121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_3051 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  100 
 
 		 909 aa  1805    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  71.7 
 
 		 780 aa  1061    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  48.8 
 
 		 757 aa  677    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  26.3 
 
 		 681 aa  119  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.59 
 
 		 652 aa  115  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.14 
 
 		 630 aa  109  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1048 aa  81.6  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  27.83 
 
 		 608 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  27.55 
 
 		 1054 aa  79  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 931 aa  78.6  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  28.31 
 
 		 999 aa  73.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  24.41 
 
 		 1032 aa  72.8  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.55 
 
 		 1044 aa  72.4  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1075 aa  69.7  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  27.53 
 
 		 362 aa  69.7  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1220 aa  68.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 1078 aa  67.4  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  22.33 
 
 		 597 aa  67.4  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  26.02 
 
 		 1063 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2042  hypothetical protein  28.07 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0910  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 983 aa  64.7  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  28.08 
 
 		 1084 aa  64.7  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  28.91 
 
 		 1090 aa  63.9  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.56 
 
 		 1021 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2905  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.03 
 
 		 363 aa  63.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.759852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2405  hypothetical protein  27.68 
 
 		 931 aa  61.2  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  32.39 
 
 		 1083 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1117 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0626  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.64 
 
 		 707 aa  58.2  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0021  hypothetical protein  26.39 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.25 
 
 		 1060 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  23.37 
 
 		 1147 aa  57.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  22.38 
 
 		 1043 aa  56.6  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1060 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2554  hypothetical protein  26.79 
 
 		 931 aa  57  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521814  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  24.46 
 
 		 1082 aa  56.6  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  30.52 
 
 		 934 aa  57  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3522  hypothetical protein  26.49 
 
 		 365 aa  55.5  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0353762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.28 
 
 		 371 aa  55.8  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2285  hypothetical protein  25.98 
 
 		 377 aa  55.1  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.97 
 
 		 694 aa  55.1  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  31.3 
 
 		 842 aa  54.3  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3988  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.53 
 
 		 359 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.757519 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1805  BNR repeat domain protein  25.09 
 
 		 357 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0197  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 334 aa  53.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3572  BNR repeat domain protein  25.18 
 
 		 357 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0269  group-specific protein  33.33 
 
 		 334 aa  53.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3192  BNR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 357 aa  53.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3173  glycosyl hydrolase  24.71 
 
 		 357 aa  52.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000926267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3445  BNR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 357 aa  53.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1821  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.87 
 
 		 378 aa  52.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3100  glycosyl hydrolase  25.38 
 
 		 357 aa  52.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349678  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1770  BNR repeat domain protein  25.28 
 
 		 357 aa  52.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0986764  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6753  hypothetical protein  21.09 
 
 		 876 aa  52.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.21551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1645  hypothetical protein  24.44 
 
 		 361 aa  52  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0852  hypothetical protein  26.98 
 
 		 279 aa  52  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1671  hypothetical protein  24.44 
 
 		 361 aa  52  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1620  hypothetical protein  24.44 
 
 		 361 aa  52  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2234  hypothetical protein  24.44 
 
 		 361 aa  52  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0564  hypothetical protein  24.44 
 
 		 361 aa  52  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0659  hypothetical protein  24.44 
 
 		 361 aa  52  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.937627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  30.95 
 
 		 942 aa  52  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1580  glycosyl hydrolase  24.72 
 
 		 357 aa  51.6  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.716896  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5629  hypothetical protein  24.44 
 
 		 361 aa  51.6  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0491  hypothetical protein  24.44 
 
 		 361 aa  51.6  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1888  BNR repeat domain protein  25.66 
 
 		 357 aa  51.6  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00990017  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3503  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.59 
 
 		 303 aa  50.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3424  hypothetical protein  26.82 
 
 		 362 aa  50.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  20.95 
 
 		 897 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1629  glycosyl hydrolase  24.91 
 
 		 357 aa  50.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3422  BNR repeat domain protein  26.05 
 
 		 357 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.655351  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3411  BNR repeat domain protein  25.29 
 
 		 357 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1831  BNR repeat-containing protein  24.91 
 
 		 350 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.511867  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.75 
 
 		 385 aa  49.7  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1610  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.82 
 
 		 303 aa  50.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.18 
 
 		 345 aa  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.18 
 
 		 345 aa  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  26.05 
 
 		 342 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2440  hypothetical protein  27.02 
 
 		 363 aa  50.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.641876 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0409  hypothetical protein  31 
 
 		 409 aa  50.1  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  23.32 
 
 		 1904 aa  49.7  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  25.32 
 
 		 925 aa  49.3  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  26.8 
 
 		 906 aa  49.3  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4586  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.4 
 
 		 310 aa  49.3  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  29.66 
 
 		 337 aa  48.9  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0422  hypothetical protein  28.75 
 
 		 320 aa  48.9  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326988  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 2082 aa  48.5  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2824  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.2 
 
 		 361 aa  48.5  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0584586 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1219  cellulose-binding family II  27.64 
 
 		 911 aa  48.5  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1806  hypothetical protein  23.46 
 
 		 912 aa  48.5  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0933525  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2143  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.57 
 
 		 581 aa  48.1  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.38256  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3393  hypothetical protein  26.81 
 
 		 365 aa  48.1  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  24.52 
 
 		 341 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4987  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.67 
 
 		 393 aa  47.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0426  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.02 
 
 		 647 aa  47.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0463  glycosyl hydrolase  28.32 
 
 		 382 aa  47.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.56 
 
 		 1041 aa  47.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2560  hypothetical protein  26.29 
 
 		 290 aa  47.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03761  Ycf48-like protein  27.43 
 
 		 338 aa  47.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.156925 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3058  hypothetical protein  27.75 
 
 		 343 aa  47.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>