15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2143 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0426  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  85.87 
 
 		 647 aa  989    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2143  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  100 
 
 		 581 aa  1184    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.38256  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1613  hypothetical protein  47.22 
 
 		 78 aa  63.9  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  30 
 
 		 1044 aa  54.3  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.03 
 
 		 630 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.57 
 
 		 909 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1114  hypothetical protein  30.48 
 
 		 323 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  30.28 
 
 		 1305 aa  45.4  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.71 
 
 		 345 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.71 
 
 		 345 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  27.08 
 
 		 1147 aa  44.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.33 
 
 		 652 aa  44.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  25 
 
 		 698 aa  44.3  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  30.84 
 
 		 681 aa  43.9  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2905  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.26 
 
 		 363 aa  43.9  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.759852  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>