More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2836 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2836  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  664    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.93454  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1042  protein of unknown function UPF0118  38.99 
 
 		 368 aa  226  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.840746  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1707  protein of unknown function UPF0118  40.57 
 
 		 504 aa  123  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  30.74 
 
 		 339 aa  123  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1563  hypothetical protein  34.88 
 
 		 398 aa  120  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  29.97 
 
 		 397 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  31.25 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  28.04 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  31.48 
 
 		 339 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  31.1 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  35.88 
 
 		 363 aa  112  9e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1868  hypothetical protein  41.56 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0467497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  31.07 
 
 		 346 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  31.71 
 
 		 363 aa  107  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  29.91 
 
 		 363 aa  106  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  28.45 
 
 		 391 aa  106  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  32.11 
 
 		 350 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  31.11 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  30.55 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  27.74 
 
 		 360 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  27.35 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  35.57 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2229  hypothetical protein  27.65 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  27.65 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2679  hypothetical protein  29.87 
 
 		 352 aa  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  27.75 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  28.16 
 
 		 359 aa  101  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  29.32 
 
 		 346 aa  99.8  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  27.27 
 
 		 365 aa  99.8  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2369  hypothetical protein  30.99 
 
 		 357 aa  99.4  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00120754  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3181  hypothetical protein  31.27 
 
 		 419 aa  99.4  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  30.7 
 
 		 348 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0203  hypothetical protein  28.75 
 
 		 362 aa  99  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  36.88 
 
 		 361 aa  99  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0192  protein of unknown function UPF0118  29.46 
 
 		 358 aa  98.2  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.146754  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  28.35 
 
 		 393 aa  98.6  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  32.24 
 
 		 354 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  32 
 
 		 361 aa  97.4  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  27.25 
 
 		 352 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  36.42 
 
 		 367 aa  96.7  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  31.3 
 
 		 351 aa  96.7  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  31.3 
 
 		 351 aa  96.7  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  26.5 
 
 		 352 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  30.64 
 
 		 349 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  26.27 
 
 		 369 aa  96.3  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1732  protein of unknown function UPF0118  33.72 
 
 		 355 aa  95.5  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000390095  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  31.48 
 
 		 350 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  27.67 
 
 		 354 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  40 
 
 		 388 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  31.48 
 
 		 349 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4061  hypothetical protein  42.95 
 
 		 351 aa  94.7  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  33.33 
 
 		 379 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2181  protein of unknown function UPF0118  28.52 
 
 		 376 aa  94  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00612132  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  26.88 
 
 		 354 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  26.22 
 
 		 387 aa  92.8  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  39.13 
 
 		 362 aa  92.4  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0747  hypothetical protein  31.08 
 
 		 381 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122791  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  26.2 
 
 		 345 aa  92  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10160  hypothetical protein  33.74 
 
 		 364 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.406243  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  34.2 
 
 		 352 aa  91.7  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  27.33 
 
 		 359 aa  91.3  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  25.95 
 
 		 354 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  27.76 
 
 		 354 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2098  hypothetical protein  31.75 
 
 		 368 aa  90.5  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1381  protein of unknown function UPF0118  39.01 
 
 		 371 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000171014  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  25.94 
 
 		 353 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  26.58 
 
 		 354 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  26.6 
 
 		 354 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3648  hypothetical protein  32.75 
 
 		 354 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.505772  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0940  protein of unknown function UPF0118  25.66 
 
 		 345 aa  89  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.726387  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1690  putative inner membrane protein  34.95 
 
 		 370 aa  88.6  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  26.67 
 
 		 361 aa  89  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43510  hypothetical protein  32.74 
 
 		 355 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0798  protein of unknown function UPF0118  29.94 
 
 		 380 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1808  putative inner membrane protein  38.06 
 
 		 372 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  26.67 
 
 		 384 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1460  putative inner membrane protein  37.42 
 
 		 372 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539422  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  28.62 
 
 		 356 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1476  putative inner membrane protein  37.42 
 
 		 372 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.655079  hitchhiker  0.000276 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1979  putative inner membrane protein  37.42 
 
 		 372 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  hitchhiker  0.00000561887 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1495  putative inner membrane protein  37.42 
 
 		 372 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  28.75 
 
 		 351 aa  86.7  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1746  putative inner membrane protein  41.35 
 
 		 371 aa  86.7  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422506 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  30.84 
 
 		 346 aa  86.3  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2175  hypothetical protein  38.73 
 
 		 366 aa  86.3  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0131226 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03420  hypothetical protein  37.5 
 
 		 361 aa  86.3  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0228  hypothetical protein  26.71 
 
 		 356 aa  85.9  9e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4608  hypothetical protein  28.74 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002589  predicted permease  37.5 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00334796  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0738  acid membrane antigen A  25.77 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.444287  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  21.34 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3486  hypothetical protein  41.35 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  29.61 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  25 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1904  putative inner membrane protein  41.35 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1769  putative inner membrane protein  41.35 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  26.45 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0988  hypothetical protein  37.41 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500729  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1889  putative inner membrane protein  41.35 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1943  putative inner membrane protein  41.35 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>