More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0918 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0918  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
237 aa  483  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.709473 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3153  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  87.55 
 
 
233 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0765389 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2154  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  71.67 
 
 
233 aa  370  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1430  amino acid ABC transporter permease  74.25 
 
 
233 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.813328  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2258  amino acid ABC transporter transmembrane protein  49.34 
 
 
231 aa  218  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2463  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50 
 
 
231 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2070  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50 
 
 
231 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0342054  normal  0.592732 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0691  amino acid ABC transporter permease  47.77 
 
 
231 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.522451  normal  0.944357 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2765  amino acid ABC transporter permease  47.37 
 
 
596 aa  210  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4039  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.81 
 
 
231 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0018  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.71 
 
 
237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.219606 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.09 
 
 
598 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0310843  hitchhiker  0.00101821 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4214  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.71 
 
 
247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4526  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.5 
 
 
232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.617823  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4272  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.85 
 
 
247 aa  194  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4592  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.41 
 
 
247 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0892  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.44 
 
 
232 aa  190  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2786  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.61 
 
 
596 aa  190  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2219  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.45 
 
 
596 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.118848  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4238  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.11 
 
 
245 aa  185  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4190  polar amino acid ABC transporter permease  43.11 
 
 
245 aa  185  7e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.012386 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4164  polar amino acid ABC transporter permease  43.11 
 
 
245 aa  184  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4005  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.5 
 
 
246 aa  181  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2915  glutamine ABC transporter, permease protein  42.29 
 
 
233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.6 
 
 
240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.130009  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1539  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.05 
 
 
240 aa  175  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441453  normal  0.87599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3480  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.37 
 
 
231 aa  175  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.501916 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2587  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.41 
 
 
231 aa  174  8e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36220  putative amino acid permease  44.78 
 
 
238 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0769892  hitchhiker  0.00221047 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1620  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.33 
 
 
240 aa  170  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0497895  normal  0.121241 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4763  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  46.3 
 
 
240 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704992  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3087  putative amino acid permease  44.78 
 
 
238 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0192707  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1138  amino acid ABC transporter permease  45.58 
 
 
240 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1618  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.58 
 
 
240 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4172  amino acid ABC transporter, permease protein  38.63 
 
 
248 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4044  ABC transporter permease  39.06 
 
 
248 aa  165  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3909  amino acid ABC transporter permease  38.53 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.222479 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46920  putative permease of ABC transporter  38.2 
 
 
248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00588556 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2807  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.37 
 
 
217 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6369  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.82 
 
 
233 aa  162  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1070  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  39.48 
 
 
248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.988617 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1594  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.05 
 
 
240 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.385392  normal  0.549432 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0323  general L-amino acid transport system permease protein aapQ  44.34 
 
 
241 aa  161  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0738317  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1885  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  44.34 
 
 
241 aa  161  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.350912  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1898  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  44.34 
 
 
241 aa  161  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.753826  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0838  binding-protein-dependent transport system inner membrane component  44.34 
 
 
241 aa  161  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.751563  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2053  binding-protein-dependent transport system inner membrane component  44.34 
 
 
241 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1516  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.72 
 
 
240 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1099  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.34 
 
 
248 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9240  ABC transporter membrane spanning protein  38.89 
 
 
226 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341088  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4342  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.06 
 
 
248 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.695793  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1667  binding-protein-dependent transport system inner membrane component  44.34 
 
 
320 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492454  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2256  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.38 
 
 
240 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1111  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.06 
 
 
248 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.619698 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4536  amino acid ABC transporter permease  38.63 
 
 
248 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.193681  normal  0.123252 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1045  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  41.04 
 
 
216 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0482  glutamate/aspartate transmembrane ABC transporter protein  38.12 
 
 
242 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0458  amino acid ABC transporter permease  37.89 
 
 
242 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0400  amino acid ABC transporter permease  38.53 
 
 
242 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.123104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4478  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.12 
 
 
240 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527898  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2449  binding-protein-dependent transport system inner membrane component  43.52 
 
 
241 aa  155  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4544  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.12 
 
 
240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.424386  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4439  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.12 
 
 
240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.150798 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3962  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.38 
 
 
240 aa  155  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57318  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4330  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.38 
 
 
240 aa  155  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.152879 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0358  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.5 
 
 
242 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0871077  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1547  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.13 
 
 
246 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.090707  normal  0.921266 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0373  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.5 
 
 
242 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.25147  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4371  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
243 aa  153  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0716  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.68 
 
 
216 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.267737  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0128  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.6 
 
 
252 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0770  amino acid ABC transporter, permease protein  39.61 
 
 
218 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7228  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.72 
 
 
243 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.213094  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0709  amino acid ABC transporter, permease protein  40.1 
 
 
218 aa  151  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2572  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.34 
 
 
246 aa  151  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0188674 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2954  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.91 
 
 
246 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4661  amino acid ABC transporter, permease protein  40.1 
 
 
218 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.128052  hitchhiker  2.19299e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0608  amino acid ABC transporter permease  39.61 
 
 
218 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0191188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0552  glutamine ABC transporter permease  39.61 
 
 
218 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2211  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.78 
 
 
245 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7663  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  37.56 
 
 
235 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0641  amino acid ABC transporter permease  39.61 
 
 
218 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00751047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0698  amino acid ABC transporter, permease protein  39.61 
 
 
218 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5111  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.44 
 
 
245 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.013919 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1819  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.95 
 
 
334 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1102  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.55 
 
 
246 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0677  amino acid ABC transporter, permease protein  40.1 
 
 
218 aa  149  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1181  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.44 
 
 
246 aa  149  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0647083 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1191  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.44 
 
 
246 aa  149  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0554  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.38 
 
 
218 aa  149  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2088  amino acid ABC transporter permease  38.18 
 
 
243 aa  148  6e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0553  glutamine ABC transporter permease  39.13 
 
 
218 aa  148  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.421713  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1210  glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein GltJ  37.39 
 
 
246 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3433  glutamate/aspartate transport system permease protein  37.39 
 
 
246 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0179732  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3430  glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein GltJ  37.39 
 
 
246 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2621  glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein GltJ  37.39 
 
 
246 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0349  glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein GltJ  37.39 
 
 
246 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0597857  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3395  glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein GltJ  37.39 
 
 
246 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0591  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.12 
 
 
246 aa  148  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.273036  normal  0.437079 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0335  amino acid ABC transporter permease  36.16 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>