More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2784 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2784  two component transcriptional regulator, LytTR family  100 
 
 		 358 aa  725    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2221  response regulator receiver protein  61.45 
 
 		 309 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.728261 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2822  response regulator receiver domain-containing protein  53.63 
 
 		 304 aa  359  4e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.135551  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3167  two component transcriptional regulator, LytTR family  68.53 
 
 		 285 aa  205  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2482  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.72 
 
 		 288 aa  203  5e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.162526 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  42.54 
 
 		 237 aa  104  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  47.22 
 
 		 237 aa  100  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.33 
 
 		 237 aa  94.7  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  37.31 
 
 		 238 aa  92.4  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 252 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.98 
 
 		 268 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.96 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  39.09 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0119  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 249 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0190  LytR/AlgR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.625509  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0469  response regulator receiver protein  40 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0898  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.63 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2143  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 265 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390763  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4560  response regulator receiver protein  39.64 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850639 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4495  LytTR family two component transcriptional regulator  32.17 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2133  LytTR family two component transcriptional regulator  36.94 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3544  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.45 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394969  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4051  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4126  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.217512  normal  0.408771 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4280  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1964  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 255 aa  67  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.777054 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3599  response regulator receiver protein  32.73 
 
 		 373 aa  67  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.485961  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1153  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.04 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6324  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 253 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.48372 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02291  predicted response regulator in two-component system withYpdA  28.83 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1276  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.83 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.435037  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1288  LytTR family two component transcriptional regulator  28.83 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.524379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2518  response regulator  28.83 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2750  response regulator  28.83 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0746  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0420  LytR/AlgR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3613  response regulator  28.83 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.560415 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2533  response regulator  28.83 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1375  response regulator receiver protein  32.03 
 
 		 239 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2671  response regulator  28.83 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0067  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.18 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2329  LytTR family two component transcriptional regulator  34.4 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531557  decreased coverage  0.00207881 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1614  response regulator receiver and SARP domain protein  33.96 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.401218  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2434  putative two-component response-regulatory protein YehT  25.91 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.318628  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2328  LytTR family two component transcriptional regulator  33.9 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.261765  decreased coverage  0.00199939 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00870  response regulator of the LytR/AlgR family  39.39 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1065  response regulator receiver protein  40 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.725191 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3172  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.38 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00901875  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5303  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.85 
 
 		 261 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.153649 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0063  response regulator receiver:LytTr DNA-binding region  35.45 
 
 		 248 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0699  response regulator receiver  35.24 
 
 		 275 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0279  two-component response regulator AlgR  31.93 
 
 		 248 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5734  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.36 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5488  two-component response regulator AlgR  32.33 
 
 		 248 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2791  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.53 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0891261 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 253 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3686  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.45 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4494  LytTr DNA-binding region  38.38 
 
 		 250 aa  62  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0706486  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.31 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6007  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  33.33 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.404994  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2357  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.54 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69470  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  33.33 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.184834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5142  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.1 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3804  LytTr DNA-binding region  33.02 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0127  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  33.64 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0224  putative two-component response-regulatory protein YehT  36.36 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1151  response regulator receiver protein  30.25 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0488  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2920  LytTR family two component transcriptional regulator  27.1 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5008  LytTR family two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1860  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.04 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000974  response regulator of the LytR/AlgR family  28.21 
 
 		 263 aa  58.9  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.728867  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1527  LytTR family two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 246 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.109257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07024  transcriptional regulator  28.21 
 
 		 263 aa  59.3  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1621  LytR/AlgR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 245 aa  58.9  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  28.97 
 
 		 276 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1561  putative PAS/PAC sensor protein  29.82 
 
 		 249 aa  59.3  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925231 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1393  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.08 
 
 		 238 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5278  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.17 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0252  two-component response regulator  26.45 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0480  response regulator receiver domain-containing protein  26.09 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0036  LytR/AlgR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2791  LytTR family two component transcriptional regulator  34.55 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.073585  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0246  two-component response regulator  26.45 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.43 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2025  two-component response regulator  35.44 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0055  LytTR family two component transcriptional regulator  30.61 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0060  LytTR family two component transcriptional regulator  30.61 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0478076  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0057  response regulator receiver protein  30.61 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000048418  decreased coverage  0.0000000648872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0055  response regulator receiver protein  30.61 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0059  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.61 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0357  response regulator receiver  33.96 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4299  LytTR family two component transcriptional regulator  30.61 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3613  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.53 
 
 		 281 aa  57  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5573  response regulator LytR  32.11 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0068  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.36 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00288448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 240 aa  57  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0387  response regulator  31.03 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2443  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.17 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.191147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>