More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2259 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2259  ABC transporter related  100 
 
 		 274 aa  533  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02410  ABC transporter, ATP-binding component  56.91 
 
 		 335 aa  273  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0985193  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1037  ABC transporter related  51.21 
 
 		 332 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2267  ABC transporter, ATP-binding protein  49.8 
 
 		 336 aa  271  6e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0800991  normal  0.721323 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1674  ABC transporter, ATP-binding protein  53.06 
 
 		 337 aa  266  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.826936  normal  0.503908 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0446  ABC transporter related  54 
 
 		 333 aa  266  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0475  ABC transporter, ATP-binding protein  48.8 
 
 		 351 aa  260  2e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1988  ABC transporter related  51.01 
 
 		 331 aa  257  2e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2094  ABC transporter, ATP-binding protein  49.2 
 
 		 338 aa  256  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.185149  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3326  ABC transporter related  51.63 
 
 		 345 aa  256  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4261  ABC transporter related  49.19 
 
 		 343 aa  253  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347781  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2106  ABC-type transport system, ATPase component  51 
 
 		 351 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0346  ABC transporter related  51.02 
 
 		 337 aa  252  6e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00397781  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00480  ABC transporter, ATP binding component  55.42 
 
 		 327 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446207  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1976  ABC transporter related protein  45.75 
 
 		 333 aa  244  9e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2371  ABC transporter related  55.25 
 
 		 228 aa  230  2e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.621592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1455  ABC transporter, ATPase subunit  48.97 
 
 		 254 aa  227  1e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.289991  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1284  ABC transporter related  42.68 
 
 		 262 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1400  ABC transporter related  44.31 
 
 		 263 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.457533  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2609  ABC transporter related  48.58 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00433881  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1276  ABC transporter related  43.9 
 
 		 263 aa  208  9e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.698379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0154  ABC transporter related  43.9 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1683  SN-glycerol-3-phosphate transport ATP-binding protein (UgpC)  46.59 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0680  ABC transporter related  43.9 
 
 		 263 aa  205  5e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0681  ABC transporter related  46.09 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2113  ABC transporter related  39.51 
 
 		 270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0499  hypothetical protein  37.8 
 
 		 263 aa  178  9e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2981  ABC transporter related  37.4 
 
 		 273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1794  ABC transporter related  40.24 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2738  ABC transporter related  37.6 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.500611 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0107  ABC transporter-related protein  38.62 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1066  ABC transporter component  40.8 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  30.77 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2391  ABC transporter related  30.94 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60790  ABC transporter ATP-binding protein  32.84 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  30.18 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5234  ABC transporter ATP-binding protein  31.1 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  32.06 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1654  ABC transporter, ATP-binding protein  29.65 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2023  ABC transporter, ATP-binding protein  29.65 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0214049  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  32.06 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3351  ABC transporter related  29.7 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2687  ABC transporter related  30.18 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  32.06 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  32.06 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2784  ABC transporter related  30.18 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.652474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1679  ABC transporter related  30.18 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0801167 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  32.06 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2708  ABC transporter related  30.18 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  31.05 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1835  ABC transporter, ATP-binding protein  29.8 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.131138  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.15 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  27.8 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1697  ABC transporter related  29 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.558012  normal  0.191667 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  29.3 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  32.06 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1788  ABC transporter related protein  30.05 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  31.19 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1165  ABC transporter, ATP-binding protein  29.85 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3374  ABC efflux transporter, ATPase subunit  29.5 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  31.58 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  30.5 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  30.65 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  29.5 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  32.06 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18810  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.67 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.222917 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  35.78 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1390  ABC transporter related  29.53 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  32.06 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  32.06 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2632  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.67 
 
 		 564 aa  60.1  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.174324  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2678  ABC transporter related protein  32.43 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.448412  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2246  ABC transporter related  29.59 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  28.76 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  28.79 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  28.71 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  28.89 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  31.09 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  31.76 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2136  ABC transporter ATP-binding protein  29.59 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2751  ABC transporter related protein  32.61 
 
 		 383 aa  59.3  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.450304  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  29.9 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  28.89 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2136  ABC transporter, ATP-binding protein  29.59 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  32 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2735  ABC transporter related  30.35 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.31749  normal  0.728727 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  31.58 
 
 		 608 aa  58.9  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3338  ABC transporter related  33.48 
 
 		 352 aa  58.9  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1270  ABC transporter related  32.99 
 
 		 361 aa  58.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0768  response regulatory protein  30.14 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319158  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  29 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1060  ABC transporter related  34.78 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.724138  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0242  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  29.15 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0762427  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  31.03 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  29.83 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4987  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  28.25 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2125  ABC transporter related  32.75 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0179374  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1821  ABC transporter related  32.83 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0936228  hitchhiker  0.0000000174264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3393  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.39 
 
 		 605 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.025265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>