More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1148 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1148  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 614 aa  1234    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.549431 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  51.64 
 
 		 568 aa  624  1e-177  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1635  Ion transport 2 domain protein  50.41 
 
 		 567 aa  609  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0302468  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0899  TrkA domain-containing protein  41.41 
 
 		 567 aa  469  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07220  K+ transport system, NAD-binding component  37.35 
 
 		 576 aa  372  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146502  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0527  TrkA domain-containing protein  34.05 
 
 		 564 aa  345  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.630061  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2691  TrkA-N domain protein  28.87 
 
 		 562 aa  195  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557317  normal  0.0657771 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  25.91 
 
 		 542 aa  194  4e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1187  TrkA-N domain protein  27.41 
 
 		 541 aa  167  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  25.81 
 
 		 544 aa  158  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  26.27 
 
 		 544 aa  155  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  23.82 
 
 		 569 aa  148  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  27.55 
 
 		 347 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4312  TrkA-N domain protein  26.09 
 
 		 548 aa  140  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0396  TrkA domain-containing protein  26.68 
 
 		 457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2323  TrkA domain-containing protein  24.92 
 
 		 549 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.551813 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1924  TrkA-C domain protein  24.46 
 
 		 551 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  35.29 
 
 		 332 aa  99.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  30.4 
 
 		 351 aa  90.1  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  26.27 
 
 		 355 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  29.69 
 
 		 351 aa  88.6  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  30.66 
 
 		 325 aa  87.8  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  31.67 
 
 		 346 aa  87  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  23.58 
 
 		 345 aa  86.7  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  23.67 
 
 		 354 aa  86.7  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  28.68 
 
 		 350 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  28.68 
 
 		 350 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  27.6 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1315  TrkA-N domain protein  27.78 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  25.57 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  25.16 
 
 		 336 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  25.41 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  22.09 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  31.1 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  21.12 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  22.33 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  22.33 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  21.56 
 
 		 330 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  22 
 
 		 334 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  22.33 
 
 		 334 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  28.51 
 
 		 346 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  29.17 
 
 		 333 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  22.73 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  22.73 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  22.8 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  22.12 
 
 		 351 aa  76.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  26.79 
 
 		 371 aa  76.6  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  22.05 
 
 		 330 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0419  TrkA-N domain protein  22.86 
 
 		 313 aa  75.9  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  22.19 
 
 		 337 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  22.83 
 
 		 397 aa  76.3  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3112  potassium channel protein  28.51 
 
 		 225 aa  75.1  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370735  normal  0.700906 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  25.4 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  21.41 
 
 		 330 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  26.39 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  23.31 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  25.93 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  23.31 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  26.16 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  22.01 
 
 		 346 aa  73.6  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  26.39 
 
 		 335 aa  73.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0418  TrkA-N domain protein  26.9 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  26.29 
 
 		 352 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  27.31 
 
 		 337 aa  69.3  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2072  TrkA-N  21.99 
 
 		 568 aa  69.3  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.712567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  24.38 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  27.41 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2378  TrkA-N  33.11 
 
 		 575 aa  68.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  26.34 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  28.38 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  27.16 
 
 		 393 aa  66.6  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  24.51 
 
 		 362 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  25.84 
 
 		 350 aa  65.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  27.8 
 
 		 256 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  24.42 
 
 		 355 aa  63.5  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  26.89 
 
 		 331 aa  63.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  33.08 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3603  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 		 335 aa  62.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.497588 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  23.81 
 
 		 445 aa  62.4  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  26.48 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  28.28 
 
 		 668 aa  61.6  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  21.35 
 
 		 517 aa  61.6  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0808  TrkA domain-containing protein  20.45 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.168839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0122  TrkA-N domain protein  25.45 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00122863  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  22.71 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  25.53 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  26.09 
 
 		 337 aa  60.1  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  30.89 
 
 		 366 aa  59.7  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  31.58 
 
 		 663 aa  59.7  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 		 674 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  29.31 
 
 		 658 aa  59.7  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  22.52 
 
 		 352 aa  59.3  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  23.56 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  26.61 
 
 		 220 aa  58.9  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  30.22 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0055  TrkA-N domain protein  22.14 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2287  TrkA domain-containing protein  27.34 
 
 		 564 aa  58.5  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  26.36 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  23.21 
 
 		 775 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  20.36 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>