256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0808 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0808  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 334 aa  670    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.168839  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2566  TrkA-N domain protein  54.08 
 
 		 336 aa  393  1e-108  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  26.58 
 
 		 335 aa  90.5  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  25.15 
 
 		 355 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  25.57 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  23.17 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  22.73 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  22.93 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  22.56 
 
 		 325 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  25.15 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  25 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  24.07 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4967  TrkA-N domain protein  27.54 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  24.22 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  25 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  22.89 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  24.59 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  23.51 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  24.35 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  20.66 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  24.12 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  22.62 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  27.81 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  24.66 
 
 		 330 aa  67  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  22.75 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  23.34 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  22.86 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  24.46 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  26.73 
 
 		 544 aa  63.5  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  22.71 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  26.21 
 
 		 661 aa  62.4  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  26.21 
 
 		 661 aa  62.4  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1148  TrkA-N domain protein  20.45 
 
 		 614 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.549431 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  24.42 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  21.03 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  26.61 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  26.61 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0418  TrkA-N domain protein  28.35 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  29.55 
 
 		 660 aa  59.7  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  25.86 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  22.3 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  22.75 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  27.19 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  29.55 
 
 		 660 aa  59.3  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  25.53 
 
 		 661 aa  58.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  27.84 
 
 		 674 aa  59.3  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  23.91 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  23.91 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  23.47 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  24.26 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  24.28 
 
 		 674 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0419  TrkA-N domain protein  21.53 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  26.04 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  25.33 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  24.54 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  27.73 
 
 		 655 aa  57.4  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1858  sodium/hydrogen exchanger  29.77 
 
 		 613 aa  57.4  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  22.48 
 
 		 324 aa  57  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  24.88 
 
 		 399 aa  57  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  23.39 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  29.66 
 
 		 395 aa  56.2  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  22.69 
 
 		 350 aa  55.8  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1380  sodium/hydrogen exchanger  23.94 
 
 		 540 aa  55.8  0.0000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.034971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0527  TrkA domain-containing protein  24.58 
 
 		 564 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.630061  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  28.81 
 
 		 669 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.81 
 
 		 669 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  28.81 
 
 		 663 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3372  TrkA-N domain protein  29.32 
 
 		 251 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.81 
 
 		 669 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.81 
 
 		 669 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.81 
 
 		 669 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.81 
 
 		 669 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  28.81 
 
 		 668 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  28.22 
 
 		 659 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  29.6 
 
 		 671 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  21.93 
 
 		 356 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6319  putative potassium efflux transporter  28.47 
 
 		 568 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.168195  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  28.81 
 
 		 663 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  25.54 
 
 		 678 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  28.81 
 
 		 668 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  28.81 
 
 		 670 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  28.81 
 
 		 670 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  28.81 
 
 		 668 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  27.59 
 
 		 659 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  21.93 
 
 		 356 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  28.81 
 
 		 668 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  22.03 
 
 		 362 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  29.31 
 
 		 667 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  23.49 
 
 		 347 aa  53.9  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0269  sodium/hydrogen exchanger  27.59 
 
 		 659 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4900  potassium efflux system protein  28.89 
 
 		 664 aa  53.9  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0899  TrkA domain-containing protein  27.05 
 
 		 567 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  29.41 
 
 		 583 aa  53.5  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  29.75 
 
 		 762 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4786  potassium efflux system protein  30.37 
 
 		 661 aa  53.5  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3112  potassium channel protein  28.57 
 
 		 225 aa  53.1  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370735  normal  0.700906 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72800  putative potassium efflux transporter  29.17 
 
 		 567 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  25.81 
 
 		 666 aa  53.1  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  24.39 
 
 		 359 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  29.63 
 
 		 656 aa  52.8  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>