52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1022 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1022  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
308 aa  605  9.999999999999999e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1720  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 
187 aa  59.7  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2615  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 
196 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1753  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
362 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0856  sugar transporter superfamily protein  30.25 
 
 
198 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2935  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.14 
 
 
383 aa  55.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474976  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  27.55 
 
 
643 aa  52.8  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 
465 aa  52.4  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.66 
 
 
277 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2007  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.81 
 
 
190 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  31.54 
 
 
436 aa  50.1  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 
467 aa  49.3  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 
269 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.97 
 
 
352 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0419  TPR repeat-containing protein  20 
 
 
224 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.338331  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0379  cytochrome C family protein  30.69 
 
 
767 aa  48.1  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.295116  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18031  hypothetical protein  31.08 
 
 
262 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3213  TPR repeat-containing protein  20.66 
 
 
227 aa  47  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1796  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 
216 aa  47  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 
288 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 
4079 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  30.43 
 
 
1979 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18241  hypothetical protein  31 
 
 
262 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.219981  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2117  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 
566 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000306715  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2980  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
208 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 
594 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1499  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 
494 aa  43.9  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3178  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
211 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2431  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.53 
 
 
190 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.232516  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 
208 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1786  TPR repeat-containing protein  23.4 
 
 
190 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0173384 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18061  hypothetical protein  27.33 
 
 
262 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 
269 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1188  peptidase S41  26.15 
 
 
897 aa  43.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.130898  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 
1276 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  21.64 
 
 
594 aa  43.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 
3035 aa  43.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4642  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 
249 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1812  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 
189 aa  43.1  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 
1297 aa  42.7  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  23.36 
 
 
295 aa  42.7  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.94 
 
 
293 aa  42.7  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 
543 aa  42.7  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  23.36 
 
 
301 aa  42.7  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0560  tetratricopeptide repeat protein  25.53 
 
 
389 aa  42.7  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.143452  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 
465 aa  42.7  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  24.22 
 
 
295 aa  42.7  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  21.6 
 
 
780 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 
3560 aa  42.7  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 
349 aa  42.7  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  23.72 
 
 
280 aa  42.7  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  29.03 
 
 
573 aa  42.4  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.190296 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>