More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1070 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1070  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 150 aa  302  8.000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  65.77 
 
 		 158 aa  200  5e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  57.72 
 
 		 158 aa  191  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2012  transcriptional regulator NrdR  55.7 
 
 		 149 aa  190  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.37372  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1730  transcriptional regulator NrdR  55.03 
 
 		 149 aa  189  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593738  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  59.33 
 
 		 163 aa  186  5.999999999999999e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  55.03 
 
 		 151 aa  186  8e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  60.67 
 
 		 153 aa  186  9e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  59.33 
 
 		 153 aa  184  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  54 
 
 		 154 aa  183  9e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  55.41 
 
 		 153 aa  182  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  54.67 
 
 		 151 aa  181  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  58.67 
 
 		 153 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  58.67 
 
 		 153 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000265338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  58.67 
 
 		 153 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  58.67 
 
 		 153 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  58.67 
 
 		 153 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  58.67 
 
 		 153 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  58.67 
 
 		 153 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  58.67 
 
 		 153 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  58.67 
 
 		 153 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4411  transcriptional regulator NrdR  58.67 
 
 		 153 aa  179  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000407341  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  58.67 
 
 		 153 aa  179  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  51.35 
 
 		 153 aa  175  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  53.02 
 
 		 154 aa  173  8e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  55.1 
 
 		 156 aa  169  7.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  53.33 
 
 		 150 aa  169  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4041  transcriptional regulator NrdR  54.36 
 
 		 163 aa  168  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  52 
 
 		 150 aa  168  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1887  ATP-cone domain protein  54.67 
 
 		 176 aa  167  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  51.33 
 
 		 150 aa  166  8e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  53.06 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  53.33 
 
 		 150 aa  165  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1249  transcriptional regulator NrdR  52.7 
 
 		 156 aa  164  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0638697  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  51.33 
 
 		 154 aa  164  5e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1200  ATP-cone domain protein  50.67 
 
 		 155 aa  163  5.9999999999999996e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  51.33 
 
 		 150 aa  163  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  51.33 
 
 		 150 aa  163  8e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  52.67 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0356  transcriptional regulator NrdR  52.67 
 
 		 159 aa  160  4.0000000000000004e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016324  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 		 150 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  51.33 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1623  transcriptional regulator NrdR  51.33 
 
 		 159 aa  158  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00056172  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1777  transcriptional regulator NrdR  50.68 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1743  transcriptional regulator NrdR  50.68 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  49.33 
 
 		 155 aa  158  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  47.97 
 
 		 157 aa  158  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  49.33 
 
 		 155 aa  158  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 		 153 aa  157  4e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0042  ATP-cone domain protein  54 
 
 		 165 aa  157  7e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.67036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07390  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 147 aa  156  9e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000247789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 154 aa  155  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  48.67 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3251  transcriptional regulator NrdR  50.67 
 
 		 152 aa  154  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2033  transcriptional regulator NrdR  53.06 
 
 		 150 aa  153  7e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0266  transcriptional regulator NrdR  56.67 
 
 		 154 aa  153  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4090  ATP-cone domain protein  50.34 
 
 		 154 aa  152  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  47.62 
 
 		 148 aa  152  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1044  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 175 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0989  transcriptional regulator NrdR  51.35 
 
 		 152 aa  152  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0323  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 		 175 aa  152  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000111081  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3491  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 180 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0344  transcriptional regulator NrdR  50.68 
 
 		 175 aa  150  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0225239  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0063  ATP-cone domain-containing protein  52 
 
 		 173 aa  150  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.987989 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2026  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 174 aa  150  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 174 aa  150  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03371  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_285  transcriptional regulator  50.34 
 
 		 175 aa  150  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000377399  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0374  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 151 aa  149  8.999999999999999e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.151767 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03381  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.36226  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3071  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 179 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3049  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 179 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000710191  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1659  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242165  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3858  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 155 aa  148  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10820  transcriptional regulator NrdR  50.68 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000786411  unclonable  0.00000000140885 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1866  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 158 aa  148  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.610385  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4029  ATP-cone domain protein  46.94 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292973 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1132  transcriptional regulator NrdR  50.71 
 
 		 154 aa  148  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.26106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04031  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 159 aa  147  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.5904 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1690  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 159 aa  147  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0768  ATP-cone domain protein  48.98 
 
 		 148 aa  147  5e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.376123  normal  0.291011 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0319  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 159 aa  146  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03461  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 159 aa  146  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0689  hypothetical protein  49.66 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0566  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0513  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0548  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  47.65 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03481  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0559  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22151  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4463  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 154 aa  144  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0921  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 149 aa  144  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2080  transcriptional regulator NrdR  50.67 
 
 		 151 aa  144  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000471331  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2586  transcriptional regulator NrdR  48.67 
 
 		 161 aa  144  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0177  ATP-cone domain-containing protein  49.33 
 
 		 152 aa  144  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00361  hypothetical protein  51.02 
 
 		 149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.489757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3196  ATP-cone domain protein  51.02 
 
 		 149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.226098  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0449  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>