More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0266 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0266  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 154 aa  308  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  58.94 
 
 		 151 aa  189  8e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  60.67 
 
 		 153 aa  187  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  56.49 
 
 		 158 aa  185  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  56.76 
 
 		 154 aa  182  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  59.33 
 
 		 153 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  52.98 
 
 		 153 aa  181  5.0000000000000004e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  52.35 
 
 		 153 aa  180  6e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1887  ATP-cone domain protein  58.44 
 
 		 176 aa  177  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  58.94 
 
 		 163 aa  177  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  56.08 
 
 		 157 aa  177  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  55.33 
 
 		 150 aa  176  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  56 
 
 		 153 aa  176  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  56.46 
 
 		 150 aa  176  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  55.33 
 
 		 153 aa  175  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  55.33 
 
 		 153 aa  175  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  55.33 
 
 		 153 aa  175  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  55.33 
 
 		 153 aa  175  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000265338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  55.33 
 
 		 153 aa  175  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  55.33 
 
 		 153 aa  175  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  55.33 
 
 		 153 aa  175  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  55.33 
 
 		 153 aa  175  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1070  transcriptional regulator NrdR  56.67 
 
 		 150 aa  175  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  55.33 
 
 		 153 aa  175  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  57.82 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4411  transcriptional regulator NrdR  55.33 
 
 		 153 aa  173  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000407341  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1249  transcriptional regulator NrdR  52.03 
 
 		 156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0638697  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  53.69 
 
 		 151 aa  171  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  56.67 
 
 		 150 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1623  transcriptional regulator NrdR  51.95 
 
 		 159 aa  170  6.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00056172  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1730  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 149 aa  170  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593738  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2012  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 149 aa  169  9e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.37372  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  54.67 
 
 		 150 aa  169  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  54 
 
 		 150 aa  169  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1777  transcriptional regulator NrdR  52.7 
 
 		 156 aa  168  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  53.02 
 
 		 154 aa  168  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1743  transcriptional regulator NrdR  52.7 
 
 		 156 aa  168  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  54.67 
 
 		 155 aa  167  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  54.67 
 
 		 155 aa  167  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  53.59 
 
 		 156 aa  167  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  53.06 
 
 		 148 aa  167  7e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4041  transcriptional regulator NrdR  51.63 
 
 		 163 aa  166  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  55.56 
 
 		 162 aa  166  8e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  52.67 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  52.67 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  57.33 
 
 		 150 aa  165  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  52.67 
 
 		 150 aa  164  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 154 aa  164  4e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1200  ATP-cone domain protein  49.67 
 
 		 155 aa  164  5e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1579  transcriptional regulator NrdR  56.46 
 
 		 157 aa  162  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000136219  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0578  transcriptional regulator NrdR  56.46 
 
 		 157 aa  162  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0356  transcriptional regulator NrdR  52.7 
 
 		 159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016324  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2026  transcriptional regulator NrdR  55.78 
 
 		 174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1186  transcriptional regulator NrdR  55.26 
 
 		 157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.526679  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0842  ATP-cone domain-containing protein  56.46 
 
 		 172 aa  161  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1161  transcriptional regulator NrdR  55.78 
 
 		 149 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000702599  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 153 aa  160  7e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  54.61 
 
 		 154 aa  160  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1272  transcriptional regulator NrdR  55.1 
 
 		 149 aa  160  7e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00612779  hitchhiker  0.000000016525 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  54.73 
 
 		 154 aa  160  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3858  transcriptional regulator NrdR  53.95 
 
 		 155 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1044  transcriptional regulator NrdR  54.73 
 
 		 175 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0689  hypothetical protein  55.41 
 
 		 154 aa  159  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4463  transcriptional regulator NrdR  55.41 
 
 		 154 aa  159  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0513  transcriptional regulator NrdR  55.41 
 
 		 154 aa  158  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1381  transcriptional regulator NrdR  54.42 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00201754  hitchhiker  0.0000201211 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0559  transcriptional regulator NrdR  55.41 
 
 		 154 aa  158  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5020  transcriptional regulator NrdR  55.78 
 
 		 154 aa  158  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582624 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0548  transcriptional regulator NrdR  55.41 
 
 		 154 aa  158  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2586  transcriptional regulator NrdR  54.61 
 
 		 161 aa  159  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0566  transcriptional regulator NrdR  55.41 
 
 		 154 aa  158  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3491  transcriptional regulator NrdR  53.06 
 
 		 180 aa  158  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1015  transcriptional regulator NrdR  53.74 
 
 		 149 aa  157  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  55.1 
 
 		 149 aa  157  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1143  transcriptional regulator NrdR  53.06 
 
 		 149 aa  157  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.086063  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1095  transcriptional regulator NrdR  55.1 
 
 		 149 aa  157  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.287796  normal  0.608767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1161  transcriptional regulator NrdR  55.1 
 
 		 149 aa  157  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.860678  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1034  transcriptional regulator NrdR  54.42 
 
 		 149 aa  157  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0182985  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1095  transcriptional regulator NrdR  55.1 
 
 		 149 aa  157  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146085  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1439  ATP-cone domain-containing protein  55.1 
 
 		 151 aa  157  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4090  ATP-cone domain protein  51.95 
 
 		 154 aa  157  7e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3459  transcriptional regulator NrdR  53.59 
 
 		 156 aa  157  7e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  51.95 
 
 		 154 aa  156  8e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  49.35 
 
 		 174 aa  156  8e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07390  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 147 aa  156  8e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000247789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  53.74 
 
 		 149 aa  156  9e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1659  transcriptional regulator NrdR  53.59 
 
 		 165 aa  156  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242165  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1330  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.768673  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4051  ATP-cone domain-containing protein  53.06 
 
 		 170 aa  155  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3161  transcriptional regulator NrdR  53.74 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.769122  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1210  transcriptional regulator NrdR  53.74 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.665936 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3160  transcriptional regulator NrdR  53.74 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.166441  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3304  transcriptional regulator NrdR  53.74 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.311833  hitchhiker  0.000761879 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0794  transcriptional regulator NrdR  53.64 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.610189  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2080  transcriptional regulator NrdR  53.64 
 
 		 151 aa  154  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000471331  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1310  transcriptional regulator NrdR  53.06 
 
 		 149 aa  154  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02986  transcriptional regulator NrdR  53.74 
 
 		 149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000784776  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  53.06 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1376  transcriptional regulator NrdR  47.68 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>