More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3305 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  100 
 
 		 313 aa  600  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  58.77 
 
 		 318 aa  346  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  58.44 
 
 		 318 aa  344  1e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  57.86 
 
 		 324 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  58.75 
 
 		 309 aa  332  5e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  53.23 
 
 		 313 aa  299  3e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2291  hypothetical protein  58.8 
 
 		 313 aa  290  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695659  normal  0.288428 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  47.9 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.37 
 
 		 312 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.37 
 
 		 312 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  47.16 
 
 		 300 aa  257  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  48.82 
 
 		 338 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  48.82 
 
 		 338 aa  253  4.0000000000000004e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  48.48 
 
 		 319 aa  250  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  44.97 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  41.95 
 
 		 334 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.19 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  43.15 
 
 		 327 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4970  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.1 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  38.4 
 
 		 314 aa  149  8e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  36.27 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2600  hypothetical protein  38.17 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0233852 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  36.96 
 
 		 281 aa  129  8.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  36.08 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  34.55 
 
 		 305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.36 
 
 		 307 aa  124  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  31.62 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  32.12 
 
 		 317 aa  122  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3092  hypothetical protein  38.08 
 
 		 297 aa  122  7e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  34 
 
 		 311 aa  122  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1862  hypothetical protein  35.05 
 
 		 333 aa  122  9e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.13 
 
 		 314 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1589  hypothetical protein  32.88 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0342218 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  30.67 
 
 		 303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  32.88 
 
 		 307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  32.42 
 
 		 315 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  30.96 
 
 		 305 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  34.01 
 
 		 310 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.2 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  32.06 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7485  hypothetical protein  31.49 
 
 		 294 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148993  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  31.83 
 
 		 317 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  33.03 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  31.61 
 
 		 320 aa  112  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  34.53 
 
 		 298 aa  112  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  31.58 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  32.52 
 
 		 317 aa  109  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  30.69 
 
 		 299 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.56 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  31.25 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  30.43 
 
 		 292 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  29.29 
 
 		 304 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.4 
 
 		 291 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  28.72 
 
 		 293 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  30.47 
 
 		 291 aa  105  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  29.76 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.14 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  32.03 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  30.65 
 
 		 312 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  31.06 
 
 		 301 aa  102  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 		 299 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.581143 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  31.03 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2345  hypothetical protein  26.95 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182301  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  33.11 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  31.03 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  37.5 
 
 		 347 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.18 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  28.91 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.48 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  30.69 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  30.58 
 
 		 311 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  28.2 
 
 		 311 aa  99.8  6e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  30.93 
 
 		 292 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  33.19 
 
 		 317 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  31.71 
 
 		 288 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  31.05 
 
 		 292 aa  98.2  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2606  hypothetical protein  32.87 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.134942  normal  0.0104554 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  29.65 
 
 		 317 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0080  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.15 
 
 		 328 aa  97.4  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.109193 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  27.86 
 
 		 296 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.86 
 
 		 290 aa  97.1  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36 
 
 		 339 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  30.23 
 
 		 301 aa  96.7  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  31.16 
 
 		 285 aa  96.3  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0131  hypothetical protein  36.86 
 
 		 321 aa  96.3  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  25.19 
 
 		 295 aa  96.3  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  27.4 
 
 		 311 aa  95.9  8e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  33.88 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 293 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  31.85 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  31.1 
 
 		 285 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  29.89 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  30.64 
 
 		 291 aa  95.5  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.69 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0006  DMT family permease  28.81 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  28.04 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5355  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.91 
 
 		 288 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  31.63 
 
 		 294 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  25.52 
 
 		 287 aa  94  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>