More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3052 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 279 aa  578  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  53.48 
 
 		 282 aa  316  3e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  48.51 
 
 		 278 aa  256  3e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  46.15 
 
 		 255 aa  216  4e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  37.08 
 
 		 319 aa  169  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  37.84 
 
 		 224 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  38.2 
 
 		 238 aa  158  8e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  38.2 
 
 		 238 aa  158  8e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  36.04 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  37.07 
 
 		 233 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  35.62 
 
 		 253 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  37.07 
 
 		 233 aa  145  6e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  35.78 
 
 		 233 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  32.17 
 
 		 306 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  32.17 
 
 		 306 aa  139  7e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  31.13 
 
 		 336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  31.78 
 
 		 289 aa  132  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 271 aa  132  5e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  31.7 
 
 		 274 aa  132  9e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  31.92 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  30.67 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  34.55 
 
 		 251 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  32.44 
 
 		 266 aa  129  7.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  32.31 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  34.98 
 
 		 239 aa  127  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  33.18 
 
 		 234 aa  125  6e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 		 1015 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  32.77 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  32.68 
 
 		 510 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  35.78 
 
 		 239 aa  123  3e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  32.44 
 
 		 590 aa  122  7e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5079  polysaccharide deacetylase  34.51 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5781  polysaccharide deacetylase  34.51 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  32.83 
 
 		 244 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  31.6 
 
 		 270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  33.63 
 
 		 239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4397  polysaccharide deacetylase  34.07 
 
 		 244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 		 1001 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  30.34 
 
 		 645 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  29.33 
 
 		 254 aa  117  3e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  31.8 
 
 		 272 aa  115  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  31.95 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 		 249 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  32.06 
 
 		 627 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  31.36 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  31.65 
 
 		 322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3100  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  30.6 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5797  polysaccharide deacetylase  27.73 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  30.28 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0678  polysaccharide deacetylase  32.31 
 
 		 415 aa  104  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.945313  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  30.51 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  31.11 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  27.89 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6390  polysaccharide deacetylase  29.57 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0864277 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  28.26 
 
 		 354 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  27.66 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0171  polysaccharide deacetylase  28.27 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0521886  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  29.39 
 
 		 276 aa  102  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  29.87 
 
 		 348 aa  102  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  29 
 
 		 348 aa  102  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  29.26 
 
 		 426 aa  102  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  30.77 
 
 		 273 aa  102  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  31.17 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 		 598 aa  101  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  31.54 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  29.91 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1014  polysaccharide deacetylase family protein  30.87 
 
 		 417 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  28.04 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  25.97 
 
 		 689 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3346  polysaccharide deacetylase family protein  30.87 
 
 		 417 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000257148  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3475  polysaccharide deacetylase  30.87 
 
 		 437 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2698  polysaccharide deacetylase  30.92 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000289703  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  29.91 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  30.67 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  29.91 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 348 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  29.82 
 
 		 276 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0340  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.44 
 
 		 319 aa  99.8  5e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0441347  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 348 aa  99.8  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  27.24 
 
 		 659 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1542  polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 		 273 aa  99.8  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.04781e-18 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  30.34 
 
 		 256 aa  99.4  6e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  28.67 
 
 		 319 aa  99.4  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2052  polysaccharide deacetylase family protein  29.79 
 
 		 395 aa  99  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2342  polysaccharide deacetylase family protein  29.91 
 
 		 274 aa  99  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.769381  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1076  polysaccharide deacetylase family protein  29.91 
 
 		 274 aa  99  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1359  polysaccharide deacetylase family protein  29.79 
 
 		 437 aa  98.6  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  28.63 
 
 		 626 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  29.91 
 
 		 273 aa  98.6  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  28.14 
 
 		 348 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.19 
 
 		 258 aa  97.8  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  28.37 
 
 		 615 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  28.32 
 
 		 363 aa  97.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  30.67 
 
 		 256 aa  97.8  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>