237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2300 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2300  hypothetical protein  100 
 
 		 482 aa  932    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.704493  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3579  hypothetical protein  39.12 
 
 		 648 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0356555 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1910  hypothetical protein  35.48 
 
 		 653 aa  293  7e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0703624  normal  0.185536 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0165  hypothetical protein  37.13 
 
 		 649 aa  277  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2059  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.4 
 
 		 497 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4351  hypothetical protein  33.47 
 
 		 503 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.646589  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3268  hypothetical protein  33.55 
 
 		 676 aa  266  7e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000411591 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.32 
 
 		 519 aa  243  5e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  31.78 
 
 		 507 aa  243  6e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0598  hypothetical protein  30.55 
 
 		 502 aa  241  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3162  hypothetical protein  33.12 
 
 		 490 aa  239  8e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1563  hypothetical protein  35.02 
 
 		 529 aa  238  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.526146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1159  hypothetical protein  33.48 
 
 		 500 aa  236  7e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0589561  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.9 
 
 		 536 aa  232  9e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.81 
 
 		 536 aa  232  9e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5724  hypothetical protein  33.11 
 
 		 506 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438284  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4220  hypothetical protein  34.86 
 
 		 494 aa  232  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.49 
 
 		 504 aa  229  9e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0415  hypothetical protein  33.69 
 
 		 505 aa  228  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  30.31 
 
 		 508 aa  226  6e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2448  hypothetical protein  31.16 
 
 		 498 aa  225  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  30.66 
 
 		 508 aa  223  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  32.27 
 
 		 512 aa  224  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  30.89 
 
 		 508 aa  222  9e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1211  hypothetical protein  34.54 
 
 		 506 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0374344  normal  0.144663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0500  hypothetical protein  31.85 
 
 		 494 aa  220  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.64 
 
 		 502 aa  220  5e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1871  hypothetical protein  31.51 
 
 		 509 aa  219  7e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2227  hypothetical protein  34.32 
 
 		 504 aa  219  7e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3409  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  34.85 
 
 		 498 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619026  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3222  hypothetical protein  32.88 
 
 		 504 aa  219  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3054  hypothetical protein  34.85 
 
 		 498 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0529038  normal  0.0190341 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0948  hypothetical protein  32.62 
 
 		 509 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.13 
 
 		 506 aa  216  7e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3387  TRAP-T family transporter fused small and large inner membrane subunits  33.56 
 
 		 658 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.933362  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4491  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.56 
 
 		 509 aa  214  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  30.98 
 
 		 502 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  30.86 
 
 		 504 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  31.21 
 
 		 501 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0830  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.82 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3033  hypothetical protein  33.33 
 
 		 658 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  31.25 
 
 		 505 aa  213  9e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  28.93 
 
 		 503 aa  212  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2145  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  30.72 
 
 		 519 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  30.98 
 
 		 501 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4415  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.67 
 
 		 503 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  29.98 
 
 		 506 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  29.98 
 
 		 506 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  29.98 
 
 		 506 aa  210  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  30.19 
 
 		 506 aa  210  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  30.34 
 
 		 502 aa  210  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  29.98 
 
 		 506 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  29.98 
 
 		 506 aa  210  6e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  32.05 
 
 		 504 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  32.05 
 
 		 504 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  32.05 
 
 		 504 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.28 
 
 		 508 aa  209  8e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3049  hypothetical protein  30.53 
 
 		 504 aa  209  9e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.235521  normal  0.409974 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  32.05 
 
 		 504 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  32.05 
 
 		 504 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  30.25 
 
 		 500 aa  209  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  30.7 
 
 		 505 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  30.68 
 
 		 508 aa  208  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2797  hypothetical protein  32.87 
 
 		 509 aa  207  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.47019  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3714  hypothetical protein  34.26 
 
 		 539 aa  207  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.114307 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3508  hypothetical protein  32.31 
 
 		 496 aa  207  5e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0428197  decreased coverage  0.0000798932 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  30.02 
 
 		 503 aa  206  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1768  hypothetical protein  31.19 
 
 		 503 aa  206  6e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.567272  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4195  hypothetical protein  31.48 
 
 		 503 aa  206  6e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.62 
 
 		 503 aa  206  7e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5627  tricarboxylate transport protein (TctA)  32.08 
 
 		 508 aa  206  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4286  hypothetical protein  32.24 
 
 		 497 aa  206  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1639  tricarboxylic transport  30.13 
 
 		 498 aa  205  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4219  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.05 
 
 		 508 aa  205  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0300  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.26 
 
 		 491 aa  204  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  30.39 
 
 		 506 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  29.69 
 
 		 504 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1016  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  30.37 
 
 		 515 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2024  hypothetical protein  32.22 
 
 		 510 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482328  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2397  hypothetical protein  33.05 
 
 		 499 aa  204  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3083  hypothetical protein  31.14 
 
 		 506 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  31.45 
 
 		 503 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5653  hypothetical protein  30.37 
 
 		 513 aa  204  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0296187 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  31.17 
 
 		 501 aa  204  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  29.78 
 
 		 496 aa  203  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4539  hypothetical protein  33.26 
 
 		 497 aa  203  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  31.48 
 
 		 502 aa  203  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2377  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.26 
 
 		 520 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908  hypothetical protein  31.32 
 
 		 529 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.839704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0071  hypothetical protein  31.88 
 
 		 505 aa  202  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36170  hypothetical protein  30.92 
 
 		 506 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000760883 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  30.93 
 
 		 501 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3430  hypothetical protein  31.78 
 
 		 510 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.467097  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2001  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.39 
 
 		 514 aa  201  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1218  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.05 
 
 		 504 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0239741  normal  0.788975 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1960  protein of unknown function DUF112 transmembrane  30.72 
 
 		 509 aa  199  6e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0173399  normal  0.831984 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2514  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  32.55 
 
 		 531 aa  199  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22099 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1067  hypothetical protein  32.23 
 
 		 508 aa  199  7e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0306  hypothetical protein  32.2 
 
 		 505 aa  199  7.999999999999999e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3100  hypothetical protein  28.86 
 
 		 509 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>