267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1168 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1168  large conductance mechanosensitive channel, MscL family  100 
 
 		 157 aa  316  9e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144587  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1197  large-conductance mechanosensitive channel  91.5 
 
 		 154 aa  285  2e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.932903  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0025  large-conductance mechanosensitive channel  58.06 
 
 		 155 aa  185  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00280832  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1202  large-conductance mechanosensitive channel  55.48 
 
 		 150 aa  184  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00425466  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0108  large conductance mechanosensitive channel protein  54.9 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0747555 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1262  large conductance mechanosensitive channel protein  53.9 
 
 		 148 aa  174  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1107  large-conductance mechanosensitive channel  57.52 
 
 		 161 aa  172  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3260  large conductance mechanosensitive channel protein  56.21 
 
 		 151 aa  169  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2860  large conductance mechanosensitive channel protein  56.21 
 
 		 151 aa  169  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  54.19 
 
 		 152 aa  168  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  52.9 
 
 		 155 aa  168  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2606  large conductance mechanosensitive channel protein  50.98 
 
 		 148 aa  164  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1671  large conductance mechanosensitive channel protein  54.49 
 
 		 150 aa  163  9e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0394869  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  52.6 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2788  large-conductance mechanosensitive channel  55.77 
 
 		 151 aa  159  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0532  large conductance mechanosensitive channel protein  51.28 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  49.35 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515588  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  52.74 
 
 		 144 aa  150  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  66.41 
 
 		 139 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0172  large conductance mechanosensitive channel protein  51.28 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.505473  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2389  large-conductance mechanosensitive channel  49.03 
 
 		 150 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000367491  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0381  large conductance mechanosensitive channel protein  47.71 
 
 		 144 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0387  large conductance mechanosensitive channel protein  48.73 
 
 		 144 aa  143  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376217  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1689  large conductance mechanosensitive channel protein  51.61 
 
 		 145 aa  143  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.606027  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0747  large conductance mechanosensitive channel protein  56.95 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0109  large conductance mechanosensitive channel protein  50.67 
 
 		 153 aa  137  7e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0379  large conductance mechanosensitive channel protein  48.03 
 
 		 142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0181396  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0006  large conductance mechanosensitive channel protein  40.52 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404291  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1288  large conductance mechanosensitive channel protein  43.23 
 
 		 136 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06660  large conductance mechanosensitive channel protein  43.05 
 
 		 146 aa  123  7e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00600968  normal  0.0734515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8656  large conductance mechanosensitive channel protein  41.83 
 
 		 134 aa  121  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  48.18 
 
 		 138 aa  121  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3512  large conductance mechanosensitive channel protein  53.45 
 
 		 154 aa  120  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.178106  normal  0.287508 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  47.45 
 
 		 138 aa  120  7e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1383  large conductance mechanosensitive channel protein  41.83 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  45.52 
 
 		 138 aa  120  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  48.65 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  46.53 
 
 		 137 aa  117  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  46.53 
 
 		 137 aa  117  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  46.53 
 
 		 134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  45.26 
 
 		 137 aa  117  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  44.52 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0712  large-conductance mechanosensitive channel  47.92 
 
 		 142 aa  114  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  50.81 
 
 		 138 aa  113  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  47.58 
 
 		 137 aa  113  8.999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  52.8 
 
 		 136 aa  113  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1343  large conductance mechanosensitive channel protein  58.72 
 
 		 152 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.954232  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  48.46 
 
 		 136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  48.46 
 
 		 136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  48.46 
 
 		 136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  48.46 
 
 		 136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  48.46 
 
 		 136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  48.46 
 
 		 136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  48.46 
 
 		 136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  48.46 
 
 		 136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  48.46 
 
 		 136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  47.24 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  48.2 
 
 		 142 aa  112  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  44.14 
 
 		 136 aa  111  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  44.14 
 
 		 136 aa  111  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  44.14 
 
 		 136 aa  112  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  48.09 
 
 		 142 aa  112  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  45.14 
 
 		 146 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  50.83 
 
 		 141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  50.83 
 
 		 141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  45.14 
 
 		 146 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  48.41 
 
 		 199 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0992  large-conductance mechanosensitive channel  48.87 
 
 		 140 aa  110  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1750  large conductance mechanosensitive channel protein  47.29 
 
 		 133 aa  110  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0902  large conductance mechanosensitive channel protein  36.18 
 
 		 134 aa  110  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0435  large conductance mechanosensitive channel protein  43.06 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4515  large-conductance mechanosensitive channel  49.14 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00658327  hitchhiker  0.00000531483 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  47.1 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  43.45 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  42.76 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  42.86 
 
 		 148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  48.41 
 
 		 143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  48.41 
 
 		 143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  42.47 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  48.41 
 
 		 143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  48.41 
 
 		 143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  48.41 
 
 		 143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  48.41 
 
 		 143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  48.41 
 
 		 143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  43.66 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  44.44 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  49.21 
 
 		 145 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  46.09 
 
 		 140 aa  107  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  42.36 
 
 		 146 aa  107  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  44.7 
 
 		 126 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1030  large conductance mechanosensitive channel protein  48.03 
 
 		 139 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184236  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  42.76 
 
 		 136 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  49.19 
 
 		 154 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  42.76 
 
 		 136 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  42.76 
 
 		 136 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  42.76 
 
 		 136 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3207  large-conductance mechanosensitive channel  48.03 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  44.62 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  42.36 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>