More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2046 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2046  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  100 
 
 		 571 aa  1165    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.302213  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2984  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.85 
 
 		 607 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0801  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.92 
 
 		 598 aa  200  7e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2538  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.5 
 
 		 596 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2507  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.68 
 
 		 602 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  28.07 
 
 		 517 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  26.96 
 
 		 1005 aa  133  7.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  28.11 
 
 		 515 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  28.11 
 
 		 521 aa  131  4.0000000000000003e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.29 
 
 		 534 aa  129  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1624  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.72 
 
 		 524 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1580  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  29.08 
 
 		 550 aa  128  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  27.06 
 
 		 481 aa  128  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0777  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.73 
 
 		 566 aa  124  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  27.32 
 
 		 609 aa  124  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0508  putative dehydrogenase flavoprotein  26.77 
 
 		 560 aa  118  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.890159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  25.47 
 
 		 519 aa  117  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2690  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.99 
 
 		 557 aa  117  7.999999999999999e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3488  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.09 
 
 		 491 aa  116  8.999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1218  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.8 
 
 		 500 aa  116  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.292447  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  25.7 
 
 		 517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  27.04 
 
 		 596 aa  115  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  25.67 
 
 		 519 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2825  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.23 
 
 		 498 aa  114  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  26.9 
 
 		 589 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  26.85 
 
 		 596 aa  114  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  25.63 
 
 		 588 aa  114  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2291  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.95 
 
 		 565 aa  114  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  26.85 
 
 		 596 aa  114  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0773  hypothetical protein  28.09 
 
 		 542 aa  114  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153715  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  25.55 
 
 		 512 aa  114  6e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  25.17 
 
 		 519 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  25.23 
 
 		 511 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  26.14 
 
 		 517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0687  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.23 
 
 		 503 aa  111  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  26.3 
 
 		 597 aa  110  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  26.48 
 
 		 596 aa  110  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  25.8 
 
 		 517 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0124  Succinate dehydrogenase  28.73 
 
 		 497 aa  109  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  26.49 
 
 		 596 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  26.49 
 
 		 596 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4075  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.14 
 
 		 484 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  26.49 
 
 		 596 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  26.49 
 
 		 596 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3521  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.57 
 
 		 559 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  25.84 
 
 		 596 aa  107  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2533  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.14 
 
 		 555 aa  107  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.51 
 
 		 519 aa  107  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0779  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.34 
 
 		 566 aa  107  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  24.83 
 
 		 508 aa  107  7e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2826  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.32 
 
 		 543 aa  106  9e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  24.81 
 
 		 598 aa  106  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  24.28 
 
 		 584 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  24.5 
 
 		 511 aa  105  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  25 
 
 		 518 aa  105  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  25.1 
 
 		 591 aa  105  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  24.95 
 
 		 596 aa  104  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.82 
 
 		 457 aa  104  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  25.09 
 
 		 507 aa  104  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26990  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  30.84 
 
 		 551 aa  103  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  22.66 
 
 		 502 aa  103  7e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.47 
 
 		 616 aa  103  7e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  25.15 
 
 		 583 aa  103  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  25.87 
 
 		 589 aa  103  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  26.2 
 
 		 596 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  25.24 
 
 		 598 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  24.65 
 
 		 499 aa  101  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.34 
 
 		 522 aa  102  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0287  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  29.25 
 
 		 514 aa  101  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0297  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  29.25 
 
 		 514 aa  101  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0278  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  29.25 
 
 		 514 aa  101  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.198959  normal  0.93633 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  25.44 
 
 		 597 aa  100  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  25.18 
 
 		 599 aa  100  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0977  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.43 
 
 		 561 aa  100  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  25 
 
 		 582 aa  100  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  25.64 
 
 		 596 aa  100  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  24.09 
 
 		 500 aa  100  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01540  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  26.94 
 
 		 501 aa  99.8  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0190007 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0182  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.98 
 
 		 588 aa  99.4  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  24.77 
 
 		 483 aa  99.4  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  28.65 
 
 		 515 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3501  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25 
 
 		 510 aa  98.6  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  30.22 
 
 		 1004 aa  98.2  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03720  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  24.28 
 
 		 558 aa  98.2  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  24.75 
 
 		 596 aa  98.2  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  26.16 
 
 		 957 aa  97.8  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  25.9 
 
 		 598 aa  97.8  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2865  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.93 
 
 		 513 aa  97.8  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  27.73 
 
 		 631 aa  97.8  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  29.08 
 
 		 515 aa  97.4  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  28.65 
 
 		 515 aa  97.4  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2780  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  28.74 
 
 		 564 aa  97.1  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386374  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  24.25 
 
 		 464 aa  96.7  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1298  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.57 
 
 		 569 aa  96.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.306259  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3846  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.73 
 
 		 486 aa  96.7  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  26.25 
 
 		 593 aa  95.5  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1103  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.75 
 
 		 598 aa  95.5  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0367  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.42 
 
 		 589 aa  95.9  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.786243 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3320  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.92 
 
 		 564 aa  95.1  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  24.58 
 
 		 582 aa  94.7  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>