More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1825 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1825  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 108 aa  216  7e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0241  Thioredoxin domain protein  72.38 
 
 		 107 aa  163  9e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.83806e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0626  Thioredoxin domain protein  64.81 
 
 		 109 aa  153  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0859  Thioredoxin domain protein  66.98 
 
 		 107 aa  153  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827766  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4889  Thioredoxin domain protein  63.21 
 
 		 108 aa  150  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0850  Thioredoxin domain protein  50 
 
 		 110 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190826  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2669  thioredoxin domain-containing protein  45.35 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.237733  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0756  thioredoxin  31.63 
 
 		 101 aa  67  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2201  thioredoxin  29.59 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1675  thioredoxin  28.12 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  26.47 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  26.47 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  29.52 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  26.47 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  29.17 
 
 		 110 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1746  thioredoxin  28.12 
 
 		 110 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  27.88 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  29.17 
 
 		 110 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  25.96 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  28.57 
 
 		 108 aa  62  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  29.41 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0187  thioredoxin  28.85 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849594 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  29.25 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  28 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0036  thioredoxin  30 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  27.55 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0862  thioredoxin  27.27 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.48028  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  27.55 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  31.07 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  27.78 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  26.47 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  24.74 
 
 		 109 aa  60.1  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  29.7 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  27.62 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  27.27 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  29.59 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  27.72 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  26.04 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1003  thioredoxin  34.04 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0352077  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  27 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  25 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  31.82 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  28.57 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_002950  PG0275  thioredoxin family protein  28.87 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  28.57 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  27.55 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  23.96 
 
 		 406 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  27.55 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4222  thioredoxin  28.43 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0161465  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  27.72 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  32.18 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0150  thioredoxin domain-containing protein  34.38 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  26.53 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  26.53 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  25.71 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  27.72 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  30.86 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  29 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  25 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  26.8 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0117  Thioredoxin domain protein  30.69 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  26.67 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  28 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  26.53 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  28.57 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  25.84 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2776  Thioredoxin domain protein  32.1 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.33686e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  31.96 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  23.58 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0471  Thioredoxin domain  29.7 
 
 		 105 aa  57  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  27 
 
 		 108 aa  57  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  26.53 
 
 		 107 aa  57  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  27.45 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  27.55 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  26.8 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2070  thioredoxin-like protein TxlA  29.09 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0097  thioredoxin  29.13 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  26 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3933  thioredoxin  25.88 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  30.11 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5011  thioredoxin  25.88 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2247  thioredoxin  25.25 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.203984  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  27.62 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  24.74 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  33.33 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2496  thioredoxin  25.77 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.182202  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1854  thioredoxin  23.71 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  26.97 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  23.58 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  26.97 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  28.92 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3718  thioredoxin  26.85 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120291  hitchhiker  0.00138865 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2157  thioredoxin  25.25 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.336694  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  28 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  25 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  26.8 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  25 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  25 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  25 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  25.77 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>