More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2198 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2198  amidohydrolase 3  100 
 
 		 501 aa  979    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2467  Amidohydrolase 3  43.49 
 
 		 475 aa  305  2.0000000000000002e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1652  Amidohydrolase 3  43.17 
 
 		 477 aa  304  2.0000000000000002e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  39.8 
 
 		 532 aa  268  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  36.84 
 
 		 527 aa  257  4e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  38.49 
 
 		 530 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  38.32 
 
 		 556 aa  238  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  38.66 
 
 		 522 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  40.08 
 
 		 536 aa  223  9e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  34.39 
 
 		 553 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  35.39 
 
 		 543 aa  219  7e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  39.48 
 
 		 536 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  32.83 
 
 		 556 aa  200  6e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  33.84 
 
 		 548 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  36.52 
 
 		 568 aa  196  6e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  36.42 
 
 		 565 aa  193  6e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  31.25 
 
 		 522 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  30.92 
 
 		 522 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  32.05 
 
 		 542 aa  190  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  40.48 
 
 		 532 aa  190  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  32.16 
 
 		 556 aa  189  8e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  32.75 
 
 		 619 aa  189  9e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  30.44 
 
 		 522 aa  189  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  31.05 
 
 		 522 aa  189  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  31.14 
 
 		 560 aa  189  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  29.9 
 
 		 552 aa  189  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  31.74 
 
 		 550 aa  188  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  34.22 
 
 		 546 aa  188  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  31.05 
 
 		 522 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  31.71 
 
 		 557 aa  187  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  30.65 
 
 		 522 aa  187  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  30.65 
 
 		 522 aa  187  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  30.85 
 
 		 522 aa  187  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  31.45 
 
 		 522 aa  186  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2017  amidohydrolase 3  38.34 
 
 		 532 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.636522  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2408  Amidohydrolase 3  34.88 
 
 		 520 aa  185  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  30.28 
 
 		 583 aa  184  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  30.51 
 
 		 522 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  33.33 
 
 		 579 aa  181  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  31.24 
 
 		 553 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  29.88 
 
 		 520 aa  178  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  29.36 
 
 		 543 aa  177  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  30.68 
 
 		 540 aa  175  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  35.6 
 
 		 551 aa  176  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  34.11 
 
 		 554 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  33.13 
 
 		 535 aa  172  9e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  28.43 
 
 		 543 aa  170  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  33.55 
 
 		 538 aa  169  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  28.25 
 
 		 539 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  29.8 
 
 		 533 aa  167  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  36.15 
 
 		 542 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  35.65 
 
 		 565 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  31.01 
 
 		 541 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  32.3 
 
 		 544 aa  164  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  31.49 
 
 		 549 aa  163  8.000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  30.02 
 
 		 563 aa  162  9e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0160  Amidohydrolase 3  34.48 
 
 		 512 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  31.41 
 
 		 537 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  30.66 
 
 		 543 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  34.79 
 
 		 553 aa  161  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  32.37 
 
 		 545 aa  160  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  32.88 
 
 		 538 aa  159  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  28.43 
 
 		 574 aa  158  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  27.88 
 
 		 544 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  30.72 
 
 		 549 aa  155  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  26.57 
 
 		 539 aa  153  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  31.79 
 
 		 540 aa  152  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  31.3 
 
 		 537 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  32.3 
 
 		 545 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  30.26 
 
 		 546 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  29.67 
 
 		 569 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  26.35 
 
 		 557 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  30.02 
 
 		 573 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  34.66 
 
 		 544 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  27.7 
 
 		 555 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4441  Amidohydrolase 3  32.49 
 
 		 535 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4734  Amidohydrolase 3  34.53 
 
 		 547 aa  147  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.238595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  30.69 
 
 		 537 aa  145  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  29.59 
 
 		 549 aa  144  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  30.12 
 
 		 544 aa  144  5e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  33.93 
 
 		 541 aa  141  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2956  Amidohydrolase 3  32.79 
 
 		 492 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2556  Amidohydrolase 3  35.23 
 
 		 556 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  32.83 
 
 		 548 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  30.97 
 
 		 547 aa  138  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  33.69 
 
 		 548 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  33.69 
 
 		 548 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  33.69 
 
 		 548 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  27.87 
 
 		 541 aa  136  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  29.27 
 
 		 601 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  32.39 
 
 		 539 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  27.88 
 
 		 583 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  32.21 
 
 		 550 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1631  Amidohydrolase 3  33.47 
 
 		 537 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0506733 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  25.84 
 
 		 520 aa  134  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  29.05 
 
 		 564 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  29.65 
 
 		 569 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  30.24 
 
 		 573 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3750  Amidohydrolase 3  33.1 
 
 		 505 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  29.22 
 
 		 564 aa  131  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>