More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2028 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  100 
 
 		 252 aa  501  1e-141  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6728  ABC transporter related  54.29 
 
 		 260 aa  271  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5822  ABC transporter related  54.69 
 
 		 260 aa  269  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.545268  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2865  ABC transporter related  53.91 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  52.23 
 
 		 257 aa  262  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1716  ABC transporter related  54.1 
 
 		 258 aa  261  4.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  52.63 
 
 		 277 aa  261  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0954  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.5 
 
 		 271 aa  258  4e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276985  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0895  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.5 
 
 		 271 aa  258  5.0000000000000005e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.876597  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2579  ABC transporter related protein  55.79 
 
 		 248 aa  258  6e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1401  ABC transporter related  53.09 
 
 		 271 aa  257  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2135  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  55.06 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1822  ABC transporter related  55.06 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  52.28 
 
 		 256 aa  257  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  52.28 
 
 		 258 aa  256  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3296  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  53.09 
 
 		 257 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.119386  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4028  ABC transporter related  53.09 
 
 		 257 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3487  ABC transporter related  53.11 
 
 		 256 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  51.87 
 
 		 256 aa  256  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3591  ABC transporter-related protein  52 
 
 		 250 aa  255  6e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  51.45 
 
 		 256 aa  252  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  51.45 
 
 		 278 aa  250  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  50.61 
 
 		 256 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  51.63 
 
 		 250 aa  250  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3291  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  53.91 
 
 		 257 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  51.45 
 
 		 256 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  51.45 
 
 		 268 aa  248  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.231771 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  53.11 
 
 		 263 aa  248  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  51.04 
 
 		 258 aa  248  9e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0017  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50.62 
 
 		 263 aa  246  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1435  ABC transporter related  50 
 
 		 256 aa  246  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.446323 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0006  ABC transporter related  52.54 
 
 		 255 aa  246  3e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.112174 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  52.28 
 
 		 256 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3344  ABC transporter ATP-binding protein  51.45 
 
 		 256 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  52.03 
 
 		 252 aa  245  6e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3915  ABC transporter related  50.62 
 
 		 259 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3265  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.04 
 
 		 259 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0083  ABC transporter related  51.04 
 
 		 259 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0101  ABC transporter related  51.04 
 
 		 259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2972  ABC transporter related  51.04 
 
 		 259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0083  ABC transporter related  51.04 
 
 		 259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2934  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.62 
 
 		 259 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1609  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.62 
 
 		 259 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0200  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.62 
 
 		 259 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.519343  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0006  ABC transporter related  51.04 
 
 		 253 aa  242  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.362312  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.62 
 
 		 259 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  50.2 
 
 		 253 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3993  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.62 
 
 		 259 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4067  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.62 
 
 		 259 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3377  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.62 
 
 		 259 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6436  ABC transporter related  50.2 
 
 		 261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0074  ABC transporter related  50.62 
 
 		 259 aa  242  5e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0085  ABC transporter related  50.62 
 
 		 259 aa  242  5e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  49.38 
 
 		 255 aa  241  6e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3331  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 		 259 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3049  ABC transporter related  50.21 
 
 		 263 aa  240  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3527  ABC transporter related  49.59 
 
 		 257 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3754  ABC transporter ATP-binding protein  51.64 
 
 		 256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30029  normal  0.205301 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  49.8 
 
 		 249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2955  ABC transporter related  49.79 
 
 		 251 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  49.79 
 
 		 256 aa  238  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3167  ABC transporter related  49.79 
 
 		 251 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2329  ABC transporter related  49.38 
 
 		 251 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1801  ABC transporter related  51.82 
 
 		 253 aa  238  8e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.627304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  49.38 
 
 		 250 aa  238  8e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3522  ABC transporter related  53.72 
 
 		 250 aa  237  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0311765  normal  0.543543 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  48.57 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1791  ABC transporter related  50.2 
 
 		 253 aa  236  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  48.57 
 
 		 249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1672  ABC transporter related  49.79 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3246  ABC transporter related  50.83 
 
 		 262 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373982  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0055  ABC transporter related  52.32 
 
 		 252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4447  ABC transporter related  51.48 
 
 		 262 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3755  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  48.73 
 
 		 240 aa  230  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5956  ABC transporter related  47.3 
 
 		 256 aa  229  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00448247  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1679  ABC transporter related  54.36 
 
 		 250 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8050  ABC transporter related  51.05 
 
 		 261 aa  230  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0251922  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0938  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.13 
 
 		 255 aa  229  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.47 
 
 		 250 aa  227  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.47 
 
 		 250 aa  227  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2931  ABC transporter-related protein  51.02 
 
 		 264 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2022  ABC transporter related  49.39 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0830509  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1682  ABC transporter related  49.39 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  49 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  47.11 
 
 		 256 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  47.68 
 
 		 250 aa  218  7.999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  47.11 
 
 		 256 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1794  ABC transporter related  47.98 
 
 		 269 aa  216  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  47.54 
 
 		 246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3424  ABC transporter related  46.94 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  43.53 
 
 		 254 aa  209  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  46.77 
 
 		 266 aa  209  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  46.69 
 
 		 256 aa  209  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  40.48 
 
 		 253 aa  208  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  46.09 
 
 		 266 aa  208  7e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  46.91 
 
 		 257 aa  208  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  45.27 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2927  ABC transporter related  46.15 
 
 		 258 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0722568  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4421  ABC transporter related  45.78 
 
 		 259 aa  206  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11811  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1840  ABC transporter related  46.12 
 
 		 266 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.260615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>