More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1327 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1659  ABC transporter related protein  50.9 
 
 		 792 aa  799    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.818321  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1327  ABC transporter related  100 
 
 		 751 aa  1547    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0595  daunorubicin resistance protein DrrC, putative  46.52 
 
 		 752 aa  709    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0588759  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2478  ABC transporter related  48.2 
 
 		 797 aa  748    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.704947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0057  ABC transporter related  49.42 
 
 		 797 aa  763    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0413721  normal  0.79813 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2074  ABC transporter related  49.17 
 
 		 798 aa  782    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.012346  normal  0.112929 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3513  ABC transporter related protein  46.72 
 
 		 752 aa  680    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0485409  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18400  Excinuclease ATPase subunit  50 
 
 		 795 aa  770    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0097  ABC transporter related  49.36 
 
 		 792 aa  779    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73348  normal  0.128909 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2899  ABC transporter related  50.06 
 
 		 796 aa  751    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000977115  hitchhiker  0.0000331786 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1286  ABC transporter related protein  49.61 
 
 		 827 aa  758    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19653  hitchhiker  0.00243826 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0264  ABC transporter related  52.69 
 
 		 761 aa  783    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1600  ABC transporter related protein  48.01 
 
 		 798 aa  752    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.239381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2761  ABC transporter related protein  56.51 
 
 		 752 aa  882    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1801  ABC transporter related  62.17 
 
 		 745 aa  949    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.344909  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1760  ABC transporter related protein  49.36 
 
 		 799 aa  740    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144756  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01950  Excinuclease ATPase subunit  46.35 
 
 		 798 aa  713    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2348  ABC transporter-like protein  49.48 
 
 		 790 aa  805    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.86691  normal  0.591253 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3201  ABC transporter related protein  49.74 
 
 		 790 aa  762    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0977104  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2621  ABC transporter related  50.64 
 
 		 826 aa  753    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.12429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4179  ABC transporter related  49.48 
 
 		 795 aa  746    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0706824  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3040  ABC transporter related  49.66 
 
 		 754 aa  734    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1738  ABC transporter related  49.3 
 
 		 793 aa  746    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2061  ABC transporter related protein  53.55 
 
 		 756 aa  822    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  0.320883 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1716  ABC transporter related  60.11 
 
 		 745 aa  958    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1999  ABC transporter related  52.09 
 
 		 761 aa  768    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28420  Excinuclease ATPase subunit  48.54 
 
 		 799 aa  740    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0889  excinuclease ATPase subunit  46.46 
 
 		 760 aa  714    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.470006  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1980  ABC transporter related  54.77 
 
 		 753 aa  870    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0885  excinuclease ATPase subunit  46.83 
 
 		 750 aa  703    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.987216  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3531  ABC transporter related  54.08 
 
 		 754 aa  842    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3727  ABC transporter related  48 
 
 		 810 aa  762    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2199  ABC transporter related  50 
 
 		 794 aa  784    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424891  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0727  ABC transporter related protein  50.6 
 
 		 752 aa  749    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2219  ABC transporter related protein  50.19 
 
 		 788 aa  764    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2679  ABC transporter related  50 
 
 		 795 aa  795    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.249669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1785  ABC transporter related  49.3 
 
 		 793 aa  746    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.806156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1706  ABC transporter related protein  50.32 
 
 		 795 aa  759    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3006  ABC transporter-related protein  49.55 
 
 		 792 aa  766    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.320548  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6204  nogalamycin resistance protein SnorO  64.34 
 
 		 750 aa  1006    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.846667 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3212  ABC transporter related protein  49.81 
 
 		 790 aa  789    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125335  hitchhiker  0.000000125221 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0108  ABC transporter related  49.17 
 
 		 796 aa  782    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7895  excinuclease ABC subunit A  51.4 
 
 		 768 aa  781    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3170  ABC transporter related  48.07 
 
 		 801 aa  728    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102444 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1474  ABC transporter related  71.37 
 
 		 758 aa  1075    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.891231  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5797  ABC transporter related protein  58.98 
 
 		 780 aa  921    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0852128  normal  0.68212 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1717  ABC transporter related  49.55 
 
 		 793 aa  748    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2501  ABC transporter related protein  49.16 
 
 		 805 aa  778    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5845  ABC transporter related  53.73 
 
 		 790 aa  816    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2335  ABC transporter related  47.69 
 
 		 797 aa  750    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0125219 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0491  ABC transporter related protein  49.94 
 
 		 794 aa  791    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544871  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  37.48 
 
 		 853 aa  540  9.999999999999999e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  36.79 
 
 		 838 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  36.92 
 
 		 843 aa  534  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  36.31 
 
 		 838 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  37.33 
 
 		 850 aa  532  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  36.07 
 
 		 838 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  37.82 
 
 		 834 aa  527  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  37.61 
 
 		 844 aa  528  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1518  ABC transporter related  37.8 
 
 		 823 aa  524  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.168965 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  37.17 
 
 		 861 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1053  excinuclease ABC, A subunit  44.16 
 
 		 927 aa  523  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00826345  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  35.53 
 
 		 877 aa  520  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  36.76 
 
 		 827 aa  514  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3676  excinuclease ABC subunit A  36.6 
 
 		 880 aa  508  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.090284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  42.42 
 
 		 945 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  36.07 
 
 		 838 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  36.03 
 
 		 822 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  38.64 
 
 		 776 aa  503  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0252  excinuclease ABC (subunit A)  42.01 
 
 		 942 aa  505  1e-141  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00117135  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  36.95 
 
 		 860 aa  505  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  41.65 
 
 		 947 aa  501  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3174  excinuclease ABC subunit A  41.1 
 
 		 955 aa  498  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  36.86 
 
 		 832 aa  498  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2882  excinuclease ABC, A subunit  40.86 
 
 		 964 aa  497  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2265  ABC transporter related  35.86 
 
 		 820 aa  498  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.285501  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  36.3 
 
 		 843 aa  496  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1893  excinuclease ABC, A subunit  40.77 
 
 		 945 aa  496  1e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0808708  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  35.71 
 
 		 848 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0440  excinuclease ABC subunit A  42.84 
 
 		 916 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.674144  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  40.76 
 
 		 947 aa  493  9.999999999999999e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3339  excinuclease ABC subunit A  41.14 
 
 		 987 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.535422  hitchhiker  0.000450974 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0411  excinuclease ABC, A subunit  40.92 
 
 		 957 aa  495  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5906  excinuclease ABC subunit A  34.97 
 
 		 897 aa  495  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  35.59 
 
 		 848 aa  495  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  35.59 
 
 		 848 aa  495  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3111  excinuclease ABC subunit A  41.29 
 
 		 987 aa  495  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400929  normal  0.194384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3137  excinuclease ABC, A subunit  41.57 
 
 		 961 aa  492  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.484359  normal  0.0493947 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  40.82 
 
 		 942 aa  490  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  41 
 
 		 946 aa  492  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2524  excinuclease ABC subunit A  41.2 
 
 		 1019 aa  489  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247426  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3065  excinuclease ABC, A subunit  40.92 
 
 		 956 aa  492  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000246359  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0455  excinuclease ABC subunit A  42.68 
 
 		 916 aa  487  1e-136  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0811639  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16220  excinuclease ABC, A subunit  41.08 
 
 		 941 aa  489  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266346  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  35.01 
 
 		 950 aa  488  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0151  ABC transporter related  33.84 
 
 		 898 aa  487  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  41.26 
 
 		 939 aa  487  1e-136  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2119  excinuclease ABC, A subunit  40.65 
 
 		 942 aa  486  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000168396  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2991  excinuclease ABC subunit A  39.41 
 
 		 954 aa  489  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.9416  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0294  excinuclease ABC, A subunit  39.64 
 
 		 946 aa  483  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>