More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0471 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 184 aa  375  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  67.22 
 
 		 201 aa  263  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  59.41 
 
 		 192 aa  223  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  57.78 
 
 		 184 aa  214  5.9999999999999996e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0219  NUDIX hydrolase  55.17 
 
 		 184 aa  203  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2928  NUDIX hydrolase  54.12 
 
 		 189 aa  198  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0333  MutT/nudix family protein  52.27 
 
 		 189 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0452702  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  51.76 
 
 		 182 aa  186  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1066  NUDIX hydrolase  48.17 
 
 		 201 aa  165  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.133388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3753  NUDIX hydrolase  44.31 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.641661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  42.53 
 
 		 180 aa  138  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2209  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 		 184 aa  132  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.022301  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  35.36 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 		 177 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 178 aa  111  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  37.95 
 
 		 176 aa  110  9e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4146  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 		 180 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4251  NUDIX hydrolase  37.99 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4021  NUDIX hydrolase  37.99 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4096  NUDIX hydrolase  37.99 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02241  hypothetical protein  37.78 
 
 		 179 aa  105  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0727099  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15030  NTP pyrophosphohydrolase  38.1 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 178 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  32.57 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4737  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  34.73 
 
 		 180 aa  101  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 		 173 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1523  NUDIX hydrolase  38.2 
 
 		 180 aa  97.8  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 		 209 aa  97.8  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6125  NUDIX hydrolase  37.13 
 
 		 178 aa  97.1  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 		 209 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  34.66 
 
 		 173 aa  96.3  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 		 209 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  34.66 
 
 		 173 aa  96.7  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 		 177 aa  96.7  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2018  NUDIX hydrolase  33.15 
 
 		 192 aa  95.5  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6699  NUDIX hydrolase  31.64 
 
 		 215 aa  93.6  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.121967 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  32.16 
 
 		 182 aa  93.6  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0180  NUDIX hydrolase  31.98 
 
 		 183 aa  93.6  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2006  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 186 aa  92.4  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00276085  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 		 181 aa  92.4  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000782  ADP-ribose pyrophosphatase  33.52 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  35.2 
 
 		 210 aa  91.7  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3065  hypothetical protein  33.14 
 
 		 181 aa  90.9  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194764 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  32.76 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  35.91 
 
 		 211 aa  88.6  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 		 201 aa  89  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 199 aa  88.6  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  31.76 
 
 		 171 aa  88.2  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  33.92 
 
 		 180 aa  87.8  8e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4523  NUDIX hydrolase  32.92 
 
 		 178 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 281 aa  86.7  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 		 215 aa  85.9  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2192  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 		 179 aa  85.1  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6067  NUDIX hydrolase  30.46 
 
 		 193 aa  84.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4016  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 183 aa  84.7  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.298866 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 		 164 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  33.56 
 
 		 171 aa  84  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0978  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  31.82 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  31.03 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1579  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.904804  normal  0.0162238 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29440  NUDIX family protein  32.12 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2174  NUDIX hydrolase  31.14 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0334323  normal  0.0698698 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  30 
 
 		 214 aa  81.3  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  27.49 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3458  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3586  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  30.54 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  34.16 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  30.49 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 228 aa  78.2  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  31.94 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  30.64 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 		 204 aa  77.8  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0185  hypothetical protein  33.33 
 
 		 335 aa  78.2  0.00000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.533354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 199 aa  77.8  0.00000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>