More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1029 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  44.06 
 
 		 823 aa  648    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  43.01 
 
 		 863 aa  713    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  45.04 
 
 		 873 aa  753    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  91.84 
 
 		 858 aa  1604    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  43.64 
 
 		 871 aa  721    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  41.18 
 
 		 857 aa  641    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  41.77 
 
 		 891 aa  676    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  40.99 
 
 		 857 aa  642    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  40.49 
 
 		 873 aa  672    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  42.71 
 
 		 854 aa  664    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  44.87 
 
 		 867 aa  765    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  45.27 
 
 		 870 aa  765    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  40.99 
 
 		 892 aa  664    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  45.15 
 
 		 853 aa  723    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  40.99 
 
 		 892 aa  665    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  41.18 
 
 		 857 aa  639    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  41.84 
 
 		 872 aa  638    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  41.63 
 
 		 855 aa  655    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  40.99 
 
 		 892 aa  665    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  41.02 
 
 		 890 aa  667    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  40.79 
 
 		 894 aa  665    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  43.58 
 
 		 885 aa  660    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3768  DNA mismatch repair protein MutS  42.34 
 
 		 968 aa  717    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3815  DNA mismatch repair protein MutS  43.91 
 
 		 907 aa  647    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.548974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  41.71 
 
 		 859 aa  654    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  42.36 
 
 		 855 aa  667    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  43.89 
 
 		 868 aa  697    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  38.97 
 
 		 881 aa  649    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  43.13 
 
 		 896 aa  752    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  43.41 
 
 		 900 aa  721    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  41.74 
 
 		 878 aa  644    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  40.99 
 
 		 892 aa  665    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  44.01 
 
 		 854 aa  664    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  42.84 
 
 		 871 aa  645    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  43.74 
 
 		 863 aa  676    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  41.44 
 
 		 860 aa  648    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  44.3 
 
 		 864 aa  721    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  43.68 
 
 		 870 aa  711    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  40.75 
 
 		 890 aa  664    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  44.33 
 
 		 868 aa  727    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  44.55 
 
 		 873 aa  671    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  41.05 
 
 		 855 aa  647    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  44.2 
 
 		 872 aa  720    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  40.27 
 
 		 904 aa  638    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  43.35 
 
 		 869 aa  706    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  40.99 
 
 		 892 aa  665    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  41.52 
 
 		 872 aa  672    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  43.77 
 
 		 882 aa  649    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  42.64 
 
 		 863 aa  714    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1282  DNA mismatch repair protein MutS  44.17 
 
 		 862 aa  639    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  45.47 
 
 		 863 aa  669    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  44.6 
 
 		 928 aa  760    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  43.77 
 
 		 903 aa  681    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  44.15 
 
 		 932 aa  713    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  42.35 
 
 		 892 aa  682    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  40.63 
 
 		 856 aa  642    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  42.69 
 
 		 860 aa  707    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 858 aa  1756    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  42.32 
 
 		 855 aa  693    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  41.79 
 
 		 887 aa  654    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  43.86 
 
 		 872 aa  714    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  42.72 
 
 		 884 aa  642    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  42.72 
 
 		 884 aa  642    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  40.48 
 
 		 837 aa  644    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  42.89 
 
 		 871 aa  684    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  44.76 
 
 		 850 aa  684    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  45.42 
 
 		 887 aa  774    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  41.26 
 
 		 872 aa  688    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  40.56 
 
 		 859 aa  635    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  41.19 
 
 		 880 aa  639    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  40.95 
 
 		 895 aa  675    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  42.61 
 
 		 859 aa  640    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  43.47 
 
 		 882 aa  678    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  43.56 
 
 		 870 aa  729    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  46.12 
 
 		 882 aa  714    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  41.26 
 
 		 872 aa  688    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  42.96 
 
 		 860 aa  679    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  42.11 
 
 		 858 aa  694    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  40.36 
 
 		 881 aa  665    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  40.65 
 
 		 856 aa  657    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  41.66 
 
 		 910 aa  698    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  41.55 
 
 		 910 aa  697    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  40.04 
 
 		 892 aa  660    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  42.07 
 
 		 901 aa  645    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  41.82 
 
 		 875 aa  667    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  44.05 
 
 		 869 aa  733    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  43.13 
 
 		 888 aa  657    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  41.22 
 
 		 861 aa  640    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  45.45 
 
 		 859 aa  752    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  42.2 
 
 		 872 aa  659    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  42.32 
 
 		 854 aa  641    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  41.05 
 
 		 855 aa  647    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  43.15 
 
 		 888 aa  654    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  40.48 
 
 		 857 aa  641    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  40.86 
 
 		 890 aa  664    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  43.79 
 
 		 874 aa  698    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  44.65 
 
 		 872 aa  720    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  43.19 
 
 		 857 aa  686    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  44.55 
 
 		 889 aa  732    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  43.4 
 
 		 868 aa  664    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>