More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0628 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0628  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 		 426 aa  867    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1663  thiamine biosynthesis protein ThiC  70.14 
 
 		 429 aa  585  1e-166  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.275056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1680  thiamine biosynthesis protein ThiC  68.25 
 
 		 429 aa  566  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0207  thiamine biosynthesis protein ThiC  69.19 
 
 		 429 aa  542  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0605362 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2427  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.82 
 
 		 426 aa  395  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0139  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.84 
 
 		 424 aa  382  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0141  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.6 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2890  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.47 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000275023  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2018  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.61 
 
 		 432 aa  371  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0604  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.51 
 
 		 436 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0145  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.12 
 
 		 434 aa  365  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3529  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.56 
 
 		 437 aa  364  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2518  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.93 
 
 		 432 aa  362  8e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453923  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3463  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.32 
 
 		 437 aa  362  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0701  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.24 
 
 		 431 aa  360  2e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2910  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.4 
 
 		 436 aa  358  7e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_681  thiamine biosynthesis protein  47 
 
 		 431 aa  358  7e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.383158  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2236  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.58 
 
 		 430 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1401  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.95 
 
 		 432 aa  358  9.999999999999999e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1421  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.44 
 
 		 425 aa  355  1e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0775  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.28 
 
 		 431 aa  354  2e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2764  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.82 
 
 		 429 aa  354  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458002  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0670  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.87 
 
 		 436 aa  354  2e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1597  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.87 
 
 		 426 aa  353  4e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0974  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.41 
 
 		 432 aa  353  4e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893445  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0668  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.63 
 
 		 436 aa  353  4e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1114  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.02 
 
 		 431 aa  352  7e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000374822  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2596  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.08 
 
 		 432 aa  352  7e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.545863  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0367  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.15 
 
 		 436 aa  351  1e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.299563 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2776  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.73 
 
 		 429 aa  351  1e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00094064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0373  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.45 
 
 		 420 aa  351  2e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000321341  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1359  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.32 
 
 		 428 aa  350  2e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.046519  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2045  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.63 
 
 		 436 aa  350  3e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0410  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.65 
 
 		 450 aa  348  8e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130506  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1468  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.76 
 
 		 431 aa  348  1e-94  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000710454  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.11 
 
 		 468 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1189  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.73 
 
 		 426 aa  347  2e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3852  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.63 
 
 		 435 aa  346  4e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.94 
 
 		 453 aa  346  4e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1596  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.27 
 
 		 432 aa  345  8e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2216  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.94 
 
 		 463 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.455315  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2304  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.18 
 
 		 463 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1643  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.94 
 
 		 463 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1489  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.25 
 
 		 426 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0765  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.77 
 
 		 426 aa  339  4e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1186  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.01 
 
 		 426 aa  340  4e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.618429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0104  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.25 
 
 		 426 aa  338  8e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.64083  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.18 
 
 		 460 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.18 
 
 		 460 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0787  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.38 
 
 		 425 aa  337  2.9999999999999997e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.346957  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1722  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.57 
 
 		 426 aa  336  3.9999999999999995e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00870726  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3734  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.69 
 
 		 473 aa  336  3.9999999999999995e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3220  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.41 
 
 		 458 aa  335  9e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.182052 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2472  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.89 
 
 		 481 aa  335  1e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0672  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.29 
 
 		 449 aa  335  1e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.936222  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0703  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.97 
 
 		 429 aa  334  2e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.52 
 
 		 453 aa  333  5e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2307  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.01 
 
 		 489 aa  333  5e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0906  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.65 
 
 		 435 aa  332  9e-90  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.598412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2129  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.91 
 
 		 428 aa  330  3e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1684  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.03 
 
 		 431 aa  330  4e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000247869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2653  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.04 
 
 		 573 aa  329  7e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0357  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.47 
 
 		 457 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0543  thiamine biosynthesis protein ThiC  38.76 
 
 		 442 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.762964 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1908  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.47 
 
 		 459 aa  326  5e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137704 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0478  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.81 
 
 		 430 aa  325  1e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1592  thiamine biosynthesis protein ThiC  36.78 
 
 		 425 aa  324  1e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000634578  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1249  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.35 
 
 		 562 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5222  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.57 
 
 		 567 aa  325  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4020  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.47 
 
 		 457 aa  325  1e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1454  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.03 
 
 		 587 aa  323  3e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.323414  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1486  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.8 
 
 		 460 aa  323  3e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.680107  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2227  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.7 
 
 		 605 aa  322  5e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000308788 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0965  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.63 
 
 		 606 aa  322  8e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.831801  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0053  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.31 
 
 		 426 aa  322  9.000000000000001e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1485  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.57 
 
 		 430 aa  321  1.9999999999999998e-86  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2064  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.18 
 
 		 441 aa  320  1.9999999999999998e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.27669  normal  0.0343903 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2593  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.94 
 
 		 503 aa  320  1.9999999999999998e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1924  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.01 
 
 		 609 aa  321  1.9999999999999998e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.471562  normal  0.405716 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0446  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.83 
 
 		 611 aa  320  3e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0503  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.57 
 
 		 430 aa  320  3.9999999999999996e-86  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.176091  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07900  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.8 
 
 		 607 aa  318  9e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0286039  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2999  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.09 
 
 		 609 aa  318  9e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0374  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.3 
 
 		 573 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0063  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.67 
 
 		 614 aa  318  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3677  thiamine biosynthesis protein ThiC  43 
 
 		 436 aa  318  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.286824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2487  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.23 
 
 		 626 aa  317  2e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320621  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0829  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.98 
 
 		 617 aa  317  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19710  hydroxymethylpyrimidine synthase  40.47 
 
 		 554 aa  317  3e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.19694  hitchhiker  0.00821817 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2459  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.14 
 
 		 424 aa  317  3e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.678195 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0041  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.94 
 
 		 622 aa  317  3e-85  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.321035  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1742  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.54 
 
 		 617 aa  316  4e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.780857  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0132  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.05 
 
 		 917 aa  317  4e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34570  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.33 
 
 		 548 aa  317  4e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0044  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.47 
 
 		 425 aa  315  7e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0383  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.9 
 
 		 652 aa  315  8e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0892  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.57 
 
 		 885 aa  315  9e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2440  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.61 
 
 		 578 aa  315  9e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00485552  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2054  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.54 
 
 		 608 aa  315  9e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1096  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.14 
 
 		 456 aa  315  9.999999999999999e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0295127  normal  0.0112677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>