More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1936 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01235  tryptophan synthase subunit beta  88.86 
 
 		 397 aa  735    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2387  tryptophan synthase, beta subunit  89.11 
 
 		 397 aa  738    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.532965  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2046  tryptophan synthase subunit beta  90.91 
 
 		 396 aa  754    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1936  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 396 aa  816    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3023  tryptophan synthase subunit beta  80.61 
 
 		 396 aa  657    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2255  tryptophan synthase subunit beta  80.66 
 
 		 403 aa  669    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0836198 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2316  tryptophan synthase subunit beta  90.91 
 
 		 396 aa  754    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2003  tryptophan synthase subunit beta  92.17 
 
 		 396 aa  766    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1936  tryptophan synthase subunit beta  90.91 
 
 		 396 aa  754    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2366  tryptophan synthase subunit beta  89.11 
 
 		 397 aa  738    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.700104  hitchhiker  0.000000273648 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2671  tryptophan synthase subunit beta  91.41 
 
 		 396 aa  757    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000253614 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1370  tryptophan synthase subunit beta  89.11 
 
 		 397 aa  738    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2407  tryptophan synthase subunit beta  80.51 
 
 		 396 aa  657    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2805  tryptophan synthase subunit beta  80.36 
 
 		 396 aa  656    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1150  tryptophan synthase subunit beta  81.82 
 
 		 396 aa  683    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2302  tryptophan synthase subunit beta  92.17 
 
 		 396 aa  763    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2321  tryptophan synthase subunit beta  89.9 
 
 		 396 aa  742    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2726  tryptophan synthase subunit beta  80.51 
 
 		 396 aa  657    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.93556  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01245  hypothetical protein  88.86 
 
 		 397 aa  735    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1858  tryptophan synthase subunit beta  89.11 
 
 		 397 aa  739    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.389614 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2176  tryptophan synthase subunit beta  94.95 
 
 		 396 aa  782    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1916  tryptophan synthase subunit beta  89.11 
 
 		 397 aa  739    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000988826 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1586  tryptophan synthase subunit beta  80.51 
 
 		 409 aa  659    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2916  tryptophan synthase subunit beta  80.92 
 
 		 407 aa  664    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.511307 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2705  tryptophan synthase subunit beta  80.51 
 
 		 396 aa  657    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1420  tryptophan synthase subunit beta  89.11 
 
 		 397 aa  739    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1602  tryptophan synthase subunit beta  89.11 
 
 		 397 aa  739    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0886138 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2454  tryptophan synthase subunit beta  81.03 
 
 		 401 aa  666    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003084  tryptophan synthase beta chain  81.31 
 
 		 396 aa  685    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1893  tryptophan synthase subunit beta  89.37 
 
 		 397 aa  740    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.964383  hitchhiker  0.00187983 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1660  tryptophan synthase subunit beta  80.51 
 
 		 396 aa  657    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014764 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1458  tryptophan synthase subunit beta  81.12 
 
 		 396 aa  660    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1524  tryptophan synthase subunit beta  80.87 
 
 		 396 aa  659    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0500753 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1871  tryptophan synthase subunit beta  89.37 
 
 		 397 aa  739    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000282354 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1425  tryptophan synthase subunit beta  81.03 
 
 		 403 aa  664    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1486  tryptophan synthase subunit beta  89.11 
 
 		 397 aa  736    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1460  tryptophan synthase subunit beta  89.11 
 
 		 397 aa  738    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00292681  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02762  tryptophan synthase subunit beta  81.06 
 
 		 396 aa  687    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1516  tryptophan synthase subunit beta  81.12 
 
 		 396 aa  660    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474539 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2207  tryptophan synthase subunit beta  89.62 
 
 		 397 aa  743    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.823385  normal  0.0123051 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1853  tryptophan synthase subunit beta  89.11 
 
 		 397 aa  739    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0734118 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2133  tryptophan synthase subunit beta  81.28 
 
 		 397 aa  663    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.31152  normal  0.733883 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1682  tryptophan synthase subunit beta  80.15 
 
 		 407 aa  659    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0792  tryptophan synthase subunit beta  81.57 
 
 		 396 aa  684    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00347207  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1056  tryptophan synthase subunit beta  76.9 
 
 		 395 aa  608  1e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2833  tryptophan synthase subunit beta  74.87 
 
 		 395 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02292  tryptophan synthase subunit beta  73.85 
 
 		 393 aa  602  1.0000000000000001e-171  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3526  tryptophan synthase subunit beta  70.18 
 
 		 420 aa  563  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  60.93 
 
 		 394 aa  504  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  60.93 
 
 		 394 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 		 394 aa  501  1e-141  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 394 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1120  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 389 aa  486  1e-136  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  58.68 
 
 		 411 aa  471  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  60.79 
 
 		 394 aa  472  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0810  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 389 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  58.61 
 
 		 413 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0787  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 389 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1683  tryptophan synthase subunit beta  59.34 
 
 		 442 aa  468  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000190343 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1688  tryptophan synthase subunit beta  59.08 
 
 		 443 aa  468  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2143  tryptophan synthase subunit beta  59.54 
 
 		 420 aa  467  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0206171  normal  0.237473 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0215  tryptophan synthase subunit beta  59.1 
 
 		 391 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1253  bifunctional phosphoribosylanthranilate isomerase/tryptophan synthase subunit beta  58.89 
 
 		 600 aa  465  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.562305  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  59.06 
 
 		 404 aa  467  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  57.03 
 
 		 414 aa  462  1e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  58.07 
 
 		 391 aa  464  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1216  tryptophan synthase subunit beta  58.44 
 
 		 414 aa  462  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.268288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1306  bifunctional phosphoribosylanthranilate isomerase/tryptophan synthase subunit beta  58.62 
 
 		 600 aa  463  1e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209698  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2511  tryptophan synthase subunit beta  57.58 
 
 		 413 aa  460  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  59.26 
 
 		 393 aa  460  9.999999999999999e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0166  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 414 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0594261  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  57.36 
 
 		 408 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  56.99 
 
 		 418 aa  460  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  56.12 
 
 		 401 aa  458  9.999999999999999e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  57.11 
 
 		 409 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  59.47 
 
 		 404 aa  457  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2272  tryptophan synthase subunit beta  58.44 
 
 		 413 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0535171 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1741  tryptophan synthase subunit beta  59.49 
 
 		 394 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  56.51 
 
 		 403 aa  456  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  58.18 
 
 		 396 aa  456  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0581  tryptophan synthase subunit beta  57.95 
 
 		 409 aa  457  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1990  tryptophan synthase subunit beta  56.64 
 
 		 414 aa  456  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663503 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3797  tryptophan synthase subunit beta  57.44 
 
 		 415 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2042  tryptophan synthase subunit beta  58.33 
 
 		 403 aa  457  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.104617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01841  tryptophan synthase subunit beta  59.11 
 
 		 414 aa  455  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2876  tryptophan synthase subunit beta  58.4 
 
 		 414 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0113  tryptophan synthase subunit beta  56.56 
 
 		 399 aa  456  1e-127  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01931  tryptophan synthase subunit beta  59.11 
 
 		 414 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4724  tryptophan synthase subunit beta  56.74 
 
 		 411 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3218  tryptophan synthase subunit beta  57.89 
 
 		 394 aa  451  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0147  tryptophan synthase subunit beta  56.2 
 
 		 417 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77335 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  57.33 
 
 		 399 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01821  tryptophan synthase subunit beta  58.85 
 
 		 414 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1691  tryptophan synthase subunit beta  57.84 
 
 		 393 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  57.03 
 
 		 406 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0222  tryptophan synthase subunit beta  58.25 
 
 		 399 aa  454  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.580627  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  56.88 
 
 		 397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3791  tryptophan synthase subunit beta  59.53 
 
 		 410 aa  453  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0140  tryptophan synthase subunit beta  58.72 
 
 		 433 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  56.28 
 
 		 406 aa  451  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>