More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0390 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  100 
 
 		 256 aa  523  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  74.9 
 
 		 259 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  75.7 
 
 		 259 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  66.41 
 
 		 256 aa  353  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  63.35 
 
 		 267 aa  332  3e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  62.15 
 
 		 260 aa  325  5e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  63.1 
 
 		 258 aa  324  7e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  64.4 
 
 		 273 aa  324  9e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  60.96 
 
 		 260 aa  323  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  60.32 
 
 		 254 aa  321  9.000000000000001e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  63.1 
 
 		 256 aa  319  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  60.4 
 
 		 252 aa  318  3.9999999999999996e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  60 
 
 		 240 aa  318  7e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  64.4 
 
 		 267 aa  317  9e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  61.35 
 
 		 254 aa  317  1e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  59.6 
 
 		 250 aa  316  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  60 
 
 		 250 aa  316  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  58.8 
 
 		 240 aa  313  9.999999999999999e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  60.8 
 
 		 254 aa  313  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  63.97 
 
 		 255 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  59.52 
 
 		 256 aa  311  4.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4343  ABC transporter related  63.27 
 
 		 279 aa  311  5.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  60.96 
 
 		 263 aa  311  7.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  60 
 
 		 253 aa  310  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  62.55 
 
 		 264 aa  310  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.4 
 
 		 254 aa  306  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  60.89 
 
 		 254 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  60.73 
 
 		 254 aa  305  6e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  58.87 
 
 		 261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.6 
 
 		 260 aa  301  6.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  57.6 
 
 		 240 aa  300  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  60.89 
 
 		 254 aa  300  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  57.6 
 
 		 268 aa  300  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  60.56 
 
 		 264 aa  300  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  58.1 
 
 		 254 aa  299  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3766  ABC transporter related  60.24 
 
 		 264 aa  299  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0934  polar amino acid ABC transporter ATPase  59.53 
 
 		 276 aa  296  2e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  57.37 
 
 		 263 aa  296  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  55.24 
 
 		 263 aa  296  3e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  57.94 
 
 		 251 aa  295  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  57.2 
 
 		 263 aa  294  8e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2154  ABC transporter related  58.4 
 
 		 274 aa  294  9e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0599  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  60.16 
 
 		 567 aa  293  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.106218 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  57.25 
 
 		 274 aa  293  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2086  ABC transporter related  58.61 
 
 		 257 aa  293  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1184  ABC transporter-related protein  58.96 
 
 		 275 aa  293  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0985  ABC transporter related protein  56.13 
 
 		 259 aa  293  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.419565  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  56.8 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2494  ABC transporter related protein  58.4 
 
 		 274 aa  292  3e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3275  ABC transporter related  56.13 
 
 		 259 aa  293  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4548  ABC transporter related  56.8 
 
 		 254 aa  291  6e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000266703  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5145  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.36 
 
 		 567 aa  291  8e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.900628 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1987  ABC transporter related protein  58.73 
 
 		 256 aa  290  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  58 
 
 		 244 aa  290  1e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3930  ABC transporter related  56.35 
 
 		 267 aa  290  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101996  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  59.22 
 
 		 262 aa  291  1e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0521  ABC transporter related  57.6 
 
 		 272 aa  290  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.56 
 
 		 261 aa  289  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  58.8 
 
 		 243 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  55.94 
 
 		 261 aa  289  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  57.09 
 
 		 254 aa  289  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.63 
 
 		 592 aa  288  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  58.06 
 
 		 243 aa  288  4e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  56.8 
 
 		 255 aa  289  4e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5537  ABC transporter related  57.2 
 
 		 255 aa  288  5.0000000000000004e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.772431 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  58 
 
 		 243 aa  288  5.0000000000000004e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  58.43 
 
 		 262 aa  288  6e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.1 
 
 		 244 aa  288  8e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.88 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.88 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.88 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.14 
 
 		 595 aa  285  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  58.94 
 
 		 256 aa  285  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0225  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.4 
 
 		 252 aa  285  5e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.73407  hitchhiker  0.0063151 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.88 
 
 		 244 aa  285  5e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  55.2 
 
 		 241 aa  285  7e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0242  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.63 
 
 		 249 aa  284  8e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0762427  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0249  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.51 
 
 		 252 aa  284  8e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0240  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.51 
 
 		 252 aa  284  8e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.773772  normal  0.21486 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.47 
 
 		 244 aa  284  8e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.88 
 
 		 244 aa  284  9e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  56 
 
 		 241 aa  284  9e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.47 
 
 		 244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.47 
 
 		 244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2971  ABC transporter related  56.35 
 
 		 254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  54.47 
 
 		 244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.94 
 
 		 273 aa  282  3.0000000000000004e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  56 
 
 		 240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4987  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.44 
 
 		 252 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0519  ABC transporter related  55.64 
 
 		 247 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0536  ABC transporter related  55.64 
 
 		 247 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  54.94 
 
 		 244 aa  281  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.03 
 
 		 594 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  55.6 
 
 		 242 aa  281  5.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.82 
 
 		 250 aa  281  5.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  59.43 
 
 		 267 aa  281  6.000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.22 
 
 		 250 aa  281  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3476  ABC transporter related  55.47 
 
 		 266 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02260  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.69 
 
 		 299 aa  281  8.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.903253  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.22 
 
 		 246 aa  281  8.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>