70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4021 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4021  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 156 aa  301  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3814  transcriptional regulator, XRE family  70.32 
 
 		 158 aa  214  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618812  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1014  XRE family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 168 aa  85.1  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1588  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0186285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4993  hypothetical protein  58 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1641  DNA-binding protein  52.63 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0574  XRE family transcriptional regulator  60 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0615681  hitchhiker  0.00000129991 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0781  XRE family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0290139  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2845  hypothetical protein  57.41 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2738  XRE family transcriptional regulator  57.41 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3721  transciptional regulator  52.83 
 
 		 103 aa  60.1  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1414  XRE family transcriptional regulator  57.41 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1186  transciptional regulator  35.54 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000178331  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1448  XRE family transcriptional regulator  57.41 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2176  hypothetical protein  49.12 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0476608  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2138  XRE family transcriptional regulator  64.58 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4912  hypothetical protein  30.59 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888712  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2103  XRE family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5034  XRE family transcriptional regulator  54 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03758  transcriptional regulator, XRE family  52.73 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3743  XRE family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 231 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0174083  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1289  XRE family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.279078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4910  hypothetical protein  29.11 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2490  hypothetical protein  24.71 
 
 		 90 aa  49.7  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0009  HTH-type transcriptional regulator SinR  38.33 
 
 		 60 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  46.77 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  46.77 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  46.77 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  46.77 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  46.77 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  46.77 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 94 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0873  DNA-binding protein, putative  35.64 
 
 		 222 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3919  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 104 aa  47.4  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1386  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3341  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 		 217 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0731  hypothetical protein  35 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.871554  hitchhiker  0.000506327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0972  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 		 228 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.385835 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0791  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 214 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  39.34 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1396  XRE family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3045  XRE family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 406 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  42.62 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6405  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 189 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146143  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 149 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2711  XRE family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 112 aa  42.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.256888  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  38.98 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2481  hypothetical protein  31.75 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0540  helix-turn-helix domain-containing protein  49.12 
 
 		 90 aa  42  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.229999 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3279  hypothetical protein  26.58 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.202854  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1444  helix-turn-helix domain-containing protein  42.11 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2980  hypothetical protein  25.32 
 
 		 89 aa  41.2  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00412022  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  38.67 
 
 		 189 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3686  transcriptional regulator, XRE family  32.11 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3015  hypothetical protein  26.58 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.116596  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  26.67 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2960  hypothetical protein  26.58 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.865336  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3477  transcriptional regulator, XRE family  43.4 
 
 		 737 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552103  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  27.27 
 
 		 149 aa  40.8  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 68 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1136  DNA-binding protein  40.82 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.632905  normal  0.0362151 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 73 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 68 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 68 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 73 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0890  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4913  signal transduction histidine kinase, LytS  25.96 
 
 		 445 aa  40.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759043  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0996  helix-turn-helix domain-containing protein  33.75 
 
 		 134 aa  40.4  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>