36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0731 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0731  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  191  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.871554  hitchhiker  0.000506327 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4910  hypothetical protein  48.91 
 
 
101 aa  83.2  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2980  hypothetical protein  46.67 
 
 
89 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00412022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3015  hypothetical protein  46.59 
 
 
89 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.116596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2960  hypothetical protein  46.59 
 
 
89 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.865336  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3279  hypothetical protein  46.67 
 
 
89 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.202854  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4912  hypothetical protein  40.45 
 
 
105 aa  73.6  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888712  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0248  hypothetical protein  41.38 
 
 
95 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.512016  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4913  signal transduction histidine kinase, LytS  41.86 
 
 
445 aa  69.3  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759043  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0121  hypothetical protein  42.53 
 
 
95 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2481  hypothetical protein  48.53 
 
 
92 aa  68.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_130  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  42.53 
 
 
95 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00019339  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2357  hypothetical protein  40.22 
 
 
91 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2407  helix-turn-helix domain-containing protein  40.22 
 
 
91 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3611  hypothetical protein  36.84 
 
 
98 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2264  hypothetical protein  32.61 
 
 
111 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal  0.0845735 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11993  hypothetical protein  41.38 
 
 
109 aa  60.5  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.318327  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1350  hypothetical protein  36.96 
 
 
97 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2490  hypothetical protein  43.28 
 
 
90 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1288  hypothetical protein  42.03 
 
 
103 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.727092  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1225  putative transmembrane protein  40.58 
 
 
103 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37245  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11998  hypothetical protein  34.41 
 
 
454 aa  53.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.899904  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4831  hypothetical protein  33.33 
 
 
91 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2456  hypothetical protein  32.94 
 
 
100 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000164028  normal  0.0224901 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4021  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2797  hypothetical protein  44.44 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.292938  normal  0.678551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2831  hypothetical protein  36.05 
 
 
109 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4909  hypothetical protein  31.43 
 
 
122 aa  44.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0486  hypothetical protein  27.96 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1014  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 
168 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145857  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2715  hypothetical protein  35.09 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.256925  normal  0.0458373 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2637  hypothetical protein  35.85 
 
 
83 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.587373  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3479  hypothetical protein  35.85 
 
 
83 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13343  hypothetical protein  24.49 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575259  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1624  hypothetical protein  23.81 
 
 
83 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.275986  normal  0.80703 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3563  hypothetical protein  50 
 
 
120 aa  40.4  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>