28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2357 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2407  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 
91 aa  186  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2357  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  186  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2980  hypothetical protein  45.45 
 
 
89 aa  84  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00412022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3015  hypothetical protein  46.59 
 
 
89 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.116596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2960  hypothetical protein  46.59 
 
 
89 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.865336  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3279  hypothetical protein  44.32 
 
 
89 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.202854  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4912  hypothetical protein  36.36 
 
 
105 aa  80.9  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888712  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11993  hypothetical protein  42.86 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.318327  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4910  hypothetical protein  38.37 
 
 
101 aa  72  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2481  hypothetical protein  46.91 
 
 
92 aa  70.9  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2490  hypothetical protein  39.53 
 
 
90 aa  69.7  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4913  signal transduction histidine kinase, LytS  38.37 
 
 
445 aa  66.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759043  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4909  hypothetical protein  40 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0731  hypothetical protein  47.89 
 
 
93 aa  65.1  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.871554  hitchhiker  0.000506327 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11998  hypothetical protein  36.17 
 
 
454 aa  63.9  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.899904  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_130  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  43.37 
 
 
95 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00019339  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0121  hypothetical protein  43.37 
 
 
95 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0248  hypothetical protein  40.96 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.512016  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1288  hypothetical protein  53.33 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.727092  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13343  hypothetical protein  25.74 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575259  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1350  hypothetical protein  40.91 
 
 
97 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1225  putative transmembrane protein  53.33 
 
 
103 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37245  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3814  transcriptional regulator, XRE family  31.33 
 
 
158 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618812  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1014  XRE family transcriptional regulator  36.14 
 
 
168 aa  44.3  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145857  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2264  hypothetical protein  33.33 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal  0.0845735 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3611  hypothetical protein  41.07 
 
 
98 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0748  hypothetical protein  36.54 
 
 
157 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166523  normal  0.738443 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2456  hypothetical protein  40.3 
 
 
100 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000164028  normal  0.0224901 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>