23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11993 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_11993  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  226  6e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.318327  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4910  hypothetical protein  43.01 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3279  hypothetical protein  46.88 
 
 		 89 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.202854  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4912  hypothetical protein  38.2 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888712  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11998  hypothetical protein  40.21 
 
 		 454 aa  75.5  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.899904  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2960  hypothetical protein  45.83 
 
 		 89 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.865336  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3015  hypothetical protein  45.83 
 
 		 89 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.116596  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4913  signal transduction histidine kinase, LytS  42.39 
 
 		 445 aa  73.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2980  hypothetical protein  46.43 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00412022  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2357  hypothetical protein  42.86 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2407  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2481  hypothetical protein  42.31 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4909  hypothetical protein  37.74 
 
 		 122 aa  60.1  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2490  hypothetical protein  36.9 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0121  hypothetical protein  39.08 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0731  hypothetical protein  44.87 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.871554  hitchhiker  0.000506327 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0248  hypothetical protein  37.97 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.512016  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_130  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  37.93 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00019339  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1014  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 168 aa  51.6  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1288  hypothetical protein  41.67 
 
 		 103 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.727092  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1225  putative transmembrane protein  37.5 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37245  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2831  hypothetical protein  37.04 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13343  hypothetical protein  22.73 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>