26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0248 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0248  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  195  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.512016  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0121  hypothetical protein  94.74 
 
 		 95 aa  188  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_130  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  92.63 
 
 		 95 aa  184  2e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00019339  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2980  hypothetical protein  39.76 
 
 		 89 aa  72  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00412022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3015  hypothetical protein  40.96 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.116596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2960  hypothetical protein  40.96 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.865336  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3279  hypothetical protein  40.96 
 
 		 89 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.202854  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4910  hypothetical protein  39.78 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4912  hypothetical protein  40.96 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888712  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2456  hypothetical protein  33.68 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000164028  normal  0.0224901 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0731  hypothetical protein  43.24 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.871554  hitchhiker  0.000506327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2357  hypothetical protein  40.96 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2407  helix-turn-helix domain-containing protein  40.96 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2831  hypothetical protein  36.47 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4909  hypothetical protein  36.11 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11993  hypothetical protein  37.97 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.318327  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2490  hypothetical protein  33.33 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11998  hypothetical protein  28.72 
 
 		 454 aa  51.2  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.899904  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2481  hypothetical protein  35.37 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4831  hypothetical protein  32.98 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2264  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal  0.0845735 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4913  signal transduction histidine kinase, LytS  34.12 
 
 		 445 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759043  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3611  hypothetical protein  27.59 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1014  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 168 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1115  hypothetical protein  30 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.309031 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16021  hypothetical protein  33.33 
 
 		 66 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>