28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_130 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_130  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  100 
 
 		 95 aa  194  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00019339  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0121  hypothetical protein  97.89 
 
 		 95 aa  191  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0248  hypothetical protein  92.63 
 
 		 95 aa  184  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.512016  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2980  hypothetical protein  43.37 
 
 		 89 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00412022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3015  hypothetical protein  46.25 
 
 		 89 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.116596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2960  hypothetical protein  46.25 
 
 		 89 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.865336  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3279  hypothetical protein  46.25 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.202854  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4912  hypothetical protein  42.17 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888712  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4910  hypothetical protein  37.63 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0731  hypothetical protein  44.59 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.871554  hitchhiker  0.000506327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2456  hypothetical protein  34.09 
 
 		 100 aa  63.5  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000164028  normal  0.0224901 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2407  helix-turn-helix domain-containing protein  43.37 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2357  hypothetical protein  43.37 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2831  hypothetical protein  37.65 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4909  hypothetical protein  35.85 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11993  hypothetical protein  37.93 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.318327  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3611  hypothetical protein  28.74 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11998  hypothetical protein  32.97 
 
 		 454 aa  52.4  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.899904  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2264  hypothetical protein  32.93 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal  0.0845735 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2490  hypothetical protein  34.41 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4831  hypothetical protein  33.75 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2481  hypothetical protein  36.59 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4913  signal transduction histidine kinase, LytS  36.36 
 
 		 445 aa  48.9  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759043  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16021  hypothetical protein  36.36 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1014  XRE family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 168 aa  44.7  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2284  hypothetical protein  35.11 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.176996  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1350  hypothetical protein  36.23 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1115  hypothetical protein  30.43 
 
 		 96 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.309031 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>