23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2481 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2481  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  183  7e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2490  hypothetical protein  52.22 
 
 		 90 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4910  hypothetical protein  49.45 
 
 		 101 aa  99.8  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4912  hypothetical protein  45.05 
 
 		 105 aa  94  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3015  hypothetical protein  48.89 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.116596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2960  hypothetical protein  48.89 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.865336  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2980  hypothetical protein  47.78 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00412022  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3279  hypothetical protein  46.67 
 
 		 89 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.202854  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4913  signal transduction histidine kinase, LytS  43.96 
 
 		 445 aa  82.8  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759043  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2357  hypothetical protein  42.39 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2407  helix-turn-helix domain-containing protein  42.39 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11993  hypothetical protein  41.18 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.318327  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4909  hypothetical protein  39.8 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0731  hypothetical protein  48.53 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.871554  hitchhiker  0.000506327 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1014  XRE family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 168 aa  60.5  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145857  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13343  hypothetical protein  25 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575259  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11998  hypothetical protein  34.83 
 
 		 454 aa  55.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.899904  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0121  hypothetical protein  34.78 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0248  hypothetical protein  32.61 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.512016  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3814  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618812  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_130  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  33.7 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00019339  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4911  hypothetical protein  27.84 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4021  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>