More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2585 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  100 
 
 
244 aa  508  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2913  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  76.03 
 
 
245 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6371  ABC transporter related  77.18 
 
 
256 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05401  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  73.86 
 
 
244 aa  358  5e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  70.54 
 
 
254 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  67.78 
 
 
247 aa  352  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  69.58 
 
 
254 aa  352  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  66.95 
 
 
249 aa  346  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2260  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  68.2 
 
 
249 aa  345  4e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal  0.463936 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7665  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  69.58 
 
 
255 aa  345  5e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2072  ABC transporter related  67.36 
 
 
249 aa  344  6e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0159024  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2465  ABC transporter related  66.95 
 
 
249 aa  340  9e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0894  ABC transporter related  65.83 
 
 
242 aa  338  4e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213179  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9237  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  62.34 
 
 
242 aa  329  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185509  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  62.24 
 
 
242 aa  323  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  61.41 
 
 
244 aa  322  5e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  61.41 
 
 
242 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  61.98 
 
 
243 aa  318  6e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  58.68 
 
 
242 aa  317  7.999999999999999e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  60.42 
 
 
242 aa  317  9e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  59.58 
 
 
242 aa  316  2e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  62.81 
 
 
260 aa  317  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  60.83 
 
 
249 aa  315  3e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4480  ABC transporter related  63.22 
 
 
266 aa  315  4e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  60.17 
 
 
243 aa  314  8e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3911  ABC transporter  62.4 
 
 
244 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.357859  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  61.41 
 
 
243 aa  313  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  60 
 
 
242 aa  313  9.999999999999999e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  60 
 
 
242 aa  310  2e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2258  ABC transporter related  61.67 
 
 
286 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21556  normal  0.633697 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  58.51 
 
 
248 aa  308  4e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  59.34 
 
 
247 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1100  ABC transporter related  61.41 
 
 
241 aa  308  6.999999999999999e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  58.75 
 
 
259 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4538  ABC transporter-like  61.32 
 
 
244 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.247485  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4174  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.16 
 
 
244 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481199  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  58.09 
 
 
246 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4528  ABC transporter related  57.02 
 
 
250 aa  304  8.000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4046  ABC transporter ATP-binding protein  61.16 
 
 
244 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4441  ABC transporter related  61.41 
 
 
255 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.103673 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0987  ABC transporter related  59.5 
 
 
244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46950  putative ATP-binding component of ABC transporter  61.16 
 
 
244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.832772  hitchhiker  0.00625095 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3964  ABC transporter related  61.25 
 
 
258 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  58.51 
 
 
255 aa  301  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4332  ABC transporter related  61.25 
 
 
258 aa  301  5.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4373  ABC transporter related  59.92 
 
 
264 aa  301  5.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  58.51 
 
 
246 aa  301  6.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  59.92 
 
 
257 aa  299  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0402  ABC transporter-related protein  60.08 
 
 
244 aa  299  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0679  ABC transporter related  60 
 
 
288 aa  299  2e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0460  ABC transporter related  60.33 
 
 
244 aa  299  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2570  ABC transporter related  57.68 
 
 
241 aa  299  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0998599  normal  0.044732 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0834  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  58.51 
 
 
249 aa  298  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0446  putative polar amino acid transport system ATP-binding protein  60.33 
 
 
244 aa  298  6e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641631  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  57.26 
 
 
246 aa  298  7e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07290  amino acid ABC transporter, ATP binding component  60.74 
 
 
244 aa  298  7e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.175528  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0337  ABC transporter related  58.09 
 
 
272 aa  298  7e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1547  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.17 
 
 
241 aa  297  8e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0593  ABC transporter related  58.51 
 
 
241 aa  298  8e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.180749  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0567  ABC transporter related  58.51 
 
 
241 aa  298  8e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  59.92 
 
 
251 aa  296  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1563  ABC transporter related  58.92 
 
 
242 aa  297  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0142744  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  57.44 
 
 
262 aa  297  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0306  ABC glutamate/aspartate transporter, inner membrane subunit GltL  58.09 
 
 
272 aa  296  2e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  58.33 
 
 
241 aa  296  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1367  ABC transporter related  58.85 
 
 
245 aa  296  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.769758  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  57.56 
 
 
244 aa  296  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0591  ABC transporter related  58.85 
 
 
245 aa  296  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0612  ABC transporter related  58.85 
 
 
245 aa  296  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  58.26 
 
 
259 aa  295  3e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4070  ABC transporter-related protein  58.85 
 
 
245 aa  295  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  59.75 
 
 
251 aa  295  4e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  58.02 
 
 
254 aa  295  4e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  58.02 
 
 
254 aa  295  4e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5607  ABC transporter related  60.08 
 
 
244 aa  295  5e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  58.09 
 
 
255 aa  295  6e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  56.61 
 
 
253 aa  294  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  57.02 
 
 
267 aa  294  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4250  ABC transporter related  59.92 
 
 
257 aa  293  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682054  normal  0.0122802 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  57.44 
 
 
253 aa  293  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6962  ABC transporter related  57.26 
 
 
241 aa  293  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  56.43 
 
 
253 aa  293  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  55.19 
 
 
259 aa  293  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  59.75 
 
 
242 aa  293  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  56.25 
 
 
253 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  56.43 
 
 
254 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  57.44 
 
 
248 aa  292  3e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  58.51 
 
 
258 aa  292  3e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000214  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.79 
 
 
244 aa  291  5e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7087  ABC transporter related  56.43 
 
 
254 aa  291  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  58.44 
 
 
244 aa  291  6e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  58.68 
 
 
252 aa  291  6e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3005  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.51 
 
 
241 aa  291  7e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2136  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.51 
 
 
241 aa  291  7e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68203  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2609  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.51 
 
 
241 aa  291  7e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  55.19 
 
 
246 aa  291  7e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2005  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.51 
 
 
241 aa  291  7e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545359  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  57.44 
 
 
251 aa  291  7e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  58.09 
 
 
242 aa  291  7e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0775  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.51 
 
 
241 aa  291  7e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>