290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2126 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2126  NmrA family protein  100 
 
 		 329 aa  678    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  31.33 
 
 		 292 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  27.35 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  28 
 
 		 292 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1828  NmrA family protein  26.74 
 
 		 293 aa  105  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1765  NmrA-like  26.09 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0815614  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5633  NmrA family protein  24.33 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  25.62 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  25.17 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5254  NmrA-like protein  25.1 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5343  NmrA family protein  25.1 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663839  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  27.33 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  24.03 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2481  NmrA family protein  28.02 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  27.39 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  22.7 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  24.32 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  26.54 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  24.21 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  24.76 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1633  NmrA family protein  25.51 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  25.5 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  25.9 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  25.87 
 
 		 584 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  28.96 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  23.68 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  25.56 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  29.34 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3118  NmrA family protein  24.53 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  26.49 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  24.9 
 
 		 277 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  24.44 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  23.43 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  25.48 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2119  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.13 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.4 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13181  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.14 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.974044  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  26.32 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  25.77 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  23.53 
 
 		 280 aa  57  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1745  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  34.15 
 
 		 387 aa  55.8  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  25.6 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  24.02 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  24.51 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.6 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  27.24 
 
 		 285 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  24.36 
 
 		 285 aa  55.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2545  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.15 
 
 		 375 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  24.71 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  26.07 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  27.13 
 
 		 281 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  25.08 
 
 		 283 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  20.82 
 
 		 295 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2612  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.15 
 
 		 375 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.17 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  27.2 
 
 		 240 aa  54.3  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  25.19 
 
 		 285 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  25 
 
 		 295 aa  53.9  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6237  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.97 
 
 		 505 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00211622  normal  0.83215 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  26.05 
 
 		 287 aa  53.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.06 
 
 		 270 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2604  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.06 
 
 		 324 aa  53.5  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  25 
 
 		 289 aa  53.1  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.81 
 
 		 358 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0547255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  22.15 
 
 		 292 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1963  NmrA family protein  22.08 
 
 		 296 aa  52.8  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  21.73 
 
 		 280 aa  52.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  21.86 
 
 		 281 aa  52.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  26.72 
 
 		 281 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  26.38 
 
 		 303 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  25.16 
 
 		 279 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  24.51 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  36.62 
 
 		 333 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  25.2 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  21.73 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1716  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  36.71 
 
 		 373 aa  51.6  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  21.84 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  22.7 
 
 		 271 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  23.51 
 
 		 320 aa  50.8  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  23.1 
 
 		 276 aa  50.8  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4565  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.53 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.99 
 
 		 327 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2099  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.54 
 
 		 330 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0931539  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  37.21 
 
 		 512 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  22.13 
 
 		 282 aa  50.4  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  23.11 
 
 		 289 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  26.05 
 
 		 281 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1372  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.13 
 
 		 376 aa  50.4  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  26.61 
 
 		 286 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2712  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.15 
 
 		 394 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  25.48 
 
 		 284 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0228  NmrA family protein  26.95 
 
 		 255 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0171  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  38.89 
 
 		 330 aa  50.4  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1312  NmrA family protein  25.38 
 
 		 295 aa  50.1  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  25.64 
 
 		 274 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  24.35 
 
 		 283 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>