More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1050 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1050  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 314 aa  630  1e-179  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1148  AraC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00767065  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0838  transcriptional regulator, AraC family  28.68 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346138 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0074  AraC-type DNA-binding protein, response regulator  26.38 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3336  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4141  AraC family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0368552 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3861  two component AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1388  AraC family transcriptional regulator  22.38 
 
 		 336 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00534804  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3855  AraC family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4513  AraC family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.24786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3754  transcriptional activator RhaS  21.19 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3842  transcriptional activator RhaS  21.19 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0149  AraC family transcriptional regulator  22.38 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511163  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0427  AraC family transcriptional regulator  22.38 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1151  AraC family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0648007  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0740  transcriptional activator RhaS  21.19 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0791489 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1497  AraC family transcription regulator  22.54 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.141505  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1411  AraC family transcriptional regulator  22.38 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439169  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0197  AraC family transcriptional regulator  22.85 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160748  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1189  AraC family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 550 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.459992  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0013  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 485 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.344073  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1337  AraC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 600 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.477585 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5791  AraC family transcriptional regulator  21.82 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  27.6 
 
 		 513 aa  59.3  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1839  helix-turn-helix domain-containing protein  29.01 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.357373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2110  transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 185 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.695339  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2894  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00223441  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2481  AraC family transcriptional regulator  20.99 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0594391  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3148  transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.322003 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  33.86 
 
 		 530 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2373  two component transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3127  transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 409 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2344  AraC family transcriptional regulator  21.89 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415258  decreased coverage  0.000000160682 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1106  AraC family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20280  transcriptional regulator, AraC family  32.8 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0229385  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0618  two component AraC family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 258 aa  57  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4299  transcriptional activator RhaR  22.35 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2050  AraC family transcriptional regulator  19.85 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.192935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3944  AraC family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.313213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3550  transcriptional regulator, AraC family  22.3 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3034  two component AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 556 aa  56.2  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00618221  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4407  AraC family transcriptional regulator  21.77 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.332097 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1731  AraC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0100  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0591  AraC family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  22.58 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2239  AraC family transcriptional regulator  29 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4661  AraC family regulatory protein  27.1 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1626  AraC family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.954407  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4661  AraC family regulatory protein  27.1 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4570  AraC family regulatory protein  27.1 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.132116  normal  0.374836 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 515 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1103  helix-turn-helix domain-containing protein  24.81 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.403298  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1706  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 778 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0404668  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2123  two component AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 414 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.331776  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5517  transcriptional regulator, AraC family  22.96 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0042541  normal  0.0106671 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4576  AraC family regulatory protein  27.1 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2295  AraC family transcriptional regulator  21.61 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4710  AraC family regulatory protein  27.1 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.238652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4439  transcriptional activator RhaR  21.96 
 
 		 312 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3986  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.08 
 
 		 289 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 266 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  32.56 
 
 		 303 aa  53.9  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2823  transcriptional regulator, AraC family  37.36 
 
 		 285 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 265 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 292 aa  53.5  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  28.57 
 
 		 387 aa  53.1  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0188  transcriptional regulator, AraC family  42.31 
 
 		 286 aa  53.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.043939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  29 
 
 		 359 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03792  DNA-binding transcriptional activator, L-rhamnose-binding  22.35 
 
 		 312 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0994  AraC family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 462 aa  53.1  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03741  hypothetical protein  22.35 
 
 		 312 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  32.32 
 
 		 287 aa  52.8  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0464  AraC family transcriptional regulator  21.09 
 
 		 259 aa  52.8  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1989  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 301 aa  52.8  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.484982  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3380  helix-turn-helix domain-containing protein  38.82 
 
 		 288 aa  53.1  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5360  transcriptional activator RhaR  21.57 
 
 		 312 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4291  transcriptional activator RhaS  20.22 
 
 		 278 aa  52.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2461  AraC family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 277 aa  52.8  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 296 aa  52.8  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2158  two component transcriptional regulator, AraC family  30.3 
 
 		 493 aa  52.8  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4331  transcriptional activator RhaS  20.22 
 
 		 278 aa  52.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0197402 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4386  transcriptional activator RhaR  21.57 
 
 		 312 aa  52.8  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.815414  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5603  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 409 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4078  transcriptional regulator, AraC family  21.57 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  24.65 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4111  transcriptional activator RhaR  21.57 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0397  AraC/XylS family transcription factor  26.19 
 
 		 396 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  26.19 
 
 		 356 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  31.78 
 
 		 1378 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 355 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4858  response regulator receiver protein  23.85 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00250208  normal  0.0726035 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1956  transcriptional regulator  26.19 
 
 		 396 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976768  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1182  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.48 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4136  transcriptional activator RhaR  21.57 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 365 aa  52.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  32.08 
 
 		 519 aa  52  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>