More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0859 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0859  transcriptional repressor MprA  100 
 
 		 170 aa  342  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  89.29 
 
 		 170 aa  306  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3485  transcriptional repressor MprA  78.92 
 
 		 171 aa  273  9e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3329  transcriptional repressor MprA  77.84 
 
 		 171 aa  271  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  73.53 
 
 		 176 aa  258  4e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  73.53 
 
 		 176 aa  256  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  73.53 
 
 		 176 aa  256  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  73.53 
 
 		 176 aa  256  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  73.37 
 
 		 176 aa  256  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  73.37 
 
 		 176 aa  256  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  73.37 
 
 		 176 aa  256  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  73.53 
 
 		 176 aa  256  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  73.53 
 
 		 176 aa  256  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  73.53 
 
 		 176 aa  256  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  73.37 
 
 		 176 aa  256  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  73.53 
 
 		 176 aa  256  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  73.37 
 
 		 176 aa  255  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  72.94 
 
 		 176 aa  254  4e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  71.6 
 
 		 173 aa  251  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  72.35 
 
 		 176 aa  250  5.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3337  transcriptional repressor MprA  69.88 
 
 		 170 aa  239  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3200  transcriptional repressor MprA  69.88 
 
 		 170 aa  239  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3458  transcriptional repressor MprA  69.88 
 
 		 170 aa  239  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  36.59 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00668  transcriptional regulator MarR family  31.25 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5564  regulatory protein, MarR  36.84 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0162  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.258521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0184  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3181  regulatory protein, MarR  28.79 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  31.25 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  31.82 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  25.66 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  29.49 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7355  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.238982 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3624  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  25.49 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.08 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  27.5 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  27.41 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  30.53 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  24.38 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  26.62 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1599  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 95 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276188  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3623  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  23.48 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  23.48 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  28.37 
 
 		 144 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  28.37 
 
 		 144 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  23.48 
 
 		 148 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 148 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 148 aa  52.4  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 148 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  28.37 
 
 		 144 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 148 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 173 aa  52.4  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  28.77 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  23.48 
 
 		 148 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>