More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2082 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_2082  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 214 aa  418  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0714276  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  41.47 
 
 		 247 aa  164  8e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 		 239 aa  141  8e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  39.81 
 
 		 237 aa  135  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  38.92 
 
 		 259 aa  125  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  33.65 
 
 		 229 aa  122  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  42.45 
 
 		 253 aa  122  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  40 
 
 		 238 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  40.48 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  39.89 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000513263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  38.29 
 
 		 279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  40.09 
 
 		 264 aa  117  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  39.53 
 
 		 247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  38.16 
 
 		 270 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  39.63 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  39.25 
 
 		 255 aa  112  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  36.76 
 
 		 255 aa  112  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  33.94 
 
 		 242 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  37.34 
 
 		 220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  38.6 
 
 		 255 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  40.86 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  36.11 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  37.28 
 
 		 271 aa  104  9e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  36.92 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  36.53 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  35.68 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  37.38 
 
 		 255 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  41.71 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  38.1 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  38.79 
 
 		 267 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  38.21 
 
 		 228 aa  99  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  35.98 
 
 		 242 aa  98.6  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  37.68 
 
 		 240 aa  98.2  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  33.95 
 
 		 251 aa  98.2  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  33.52 
 
 		 227 aa  97.4  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  31 
 
 		 276 aa  97.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  31.46 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  39.15 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  36.57 
 
 		 246 aa  96.7  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  35.32 
 
 		 242 aa  96.7  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  36.09 
 
 		 230 aa  96.3  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  37.63 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  36.94 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  32.91 
 
 		 220 aa  95.5  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 		 272 aa  95.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  32.69 
 
 		 239 aa  94.7  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  30 
 
 		 245 aa  94.4  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  36.54 
 
 		 244 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  36.71 
 
 		 246 aa  94  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  37.7 
 
 		 238 aa  94.4  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  29.95 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  41.48 
 
 		 235 aa  92.8  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  35.57 
 
 		 255 aa  92.8  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  36.99 
 
 		 241 aa  92.8  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  35.5 
 
 		 223 aa  92.8  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1678  ComF family protein  33.18 
 
 		 230 aa  92.4  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591029  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  36.88 
 
 		 232 aa  92.4  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  32.86 
 
 		 245 aa  92.4  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  34.8 
 
 		 271 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  36.41 
 
 		 245 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  37.38 
 
 		 207 aa  91.7  7e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  33.49 
 
 		 246 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  35.71 
 
 		 239 aa  90.9  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1942  phosphoribosyltransferase  33.17 
 
 		 247 aa  90.9  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  33.98 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  26.42 
 
 		 270 aa  90.5  2e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  36.98 
 
 		 269 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  30 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  39.1 
 
 		 244 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3629  competence protein ComF  38.95 
 
 		 252 aa  89.7  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0875  hypothetical protein  34.24 
 
 		 255 aa  89.7  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.656742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  36.04 
 
 		 299 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.86 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  29.49 
 
 		 243 aa  89  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  38.36 
 
 		 260 aa  89.4  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  28.51 
 
 		 245 aa  89  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  34.97 
 
 		 271 aa  88.2  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  34.42 
 
 		 246 aa  88.2  9e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  31.9 
 
 		 226 aa  87.4  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  34.01 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0359  putative competence protein F-related protein  37.98 
 
 		 240 aa  86.3  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.332104 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2856  competence protein F  33.64 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  30.52 
 
 		 233 aa  86.3  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3201  amidophosphoribosyltransferase  33.65 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.387541  normal  0.0162666 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  32.23 
 
 		 247 aa  85.9  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1195  competence protein F  33.18 
 
 		 240 aa  85.9  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  34.98 
 
 		 248 aa  85.9  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0157  competence protein ComF  32.83 
 
 		 274 aa  85.5  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  34.27 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  35.98 
 
 		 217 aa  85.5  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  38.54 
 
 		 241 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  33.83 
 
 		 230 aa  85.1  7e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  32.86 
 
 		 246 aa  84.7  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  31.46 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  33.5 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2292  ComF family protein  33 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  33.17 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  28.76 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3826  gluconate periplasmic binding protein  33.68 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>