253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3609 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 574 aa  1165    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  49.73 
 
 		 565 aa  579  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  42.73 
 
 		 581 aa  478  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  46.05 
 
 		 589 aa  474  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  45.36 
 
 		 589 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  43.63 
 
 		 596 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  40.14 
 
 		 576 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  37.37 
 
 		 596 aa  382  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  37.09 
 
 		 596 aa  375  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  34.69 
 
 		 598 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  33.22 
 
 		 604 aa  338  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  35.39 
 
 		 595 aa  335  9e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1080  hypothetical protein  28.52 
 
 		 599 aa  259  1e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.752206 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0896  Rhs element Vgr protein  27.77 
 
 		 545 aa  204  5e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.79786 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1040  Rhs element Vgr protein  27.77 
 
 		 545 aa  204  5e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.605907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  26.35 
 
 		 593 aa  180  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  27.79 
 
 		 589 aa  174  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  27.39 
 
 		 610 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  22.1 
 
 		 592 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  23.95 
 
 		 641 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  34.48 
 
 		 218 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  25.35 
 
 		 578 aa  113  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  25.76 
 
 		 606 aa  110  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  32.41 
 
 		 239 aa  105  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  27.89 
 
 		 587 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  27.18 
 
 		 594 aa  104  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3043  Rhs element Vgr protein  35.23 
 
 		 229 aa  103  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160638 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  28.63 
 
 		 248 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  24.32 
 
 		 617 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4109  Rhs element Vgr protein  24.29 
 
 		 576 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0273732 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4864  Rhs element Vgr protein  25.76 
 
 		 599 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0846936  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  30.73 
 
 		 247 aa  97.1  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  29.8 
 
 		 275 aa  92  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  24.02 
 
 		 605 aa  91.3  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  28.9 
 
 		 599 aa  86.3  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3666  Rhs element Vgr protein  29.82 
 
 		 226 aa  86.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  decreased coverage  0.0000749166 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  24.79 
 
 		 602 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  23.04 
 
 		 615 aa  84  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3664  hypothetical protein  28.72 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000879822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3589  Rhs element Vgr protein  26.21 
 
 		 612 aa  80.5  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.512863 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  25.56 
 
 		 602 aa  79.7  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  28.57 
 
 		 616 aa  77.8  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  23.08 
 
 		 602 aa  77.8  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1796  Rhs element Vgr protein  21.86 
 
 		 619 aa  77.4  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2945  Rhs element Vgr protein  25.26 
 
 		 589 aa  77.4  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703955  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1875  hypothetical protein  28.81 
 
 		 212 aa  75.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0982  hypothetical protein  24.56 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3665  Rhs element Vgr protein  29.75 
 
 		 245 aa  73.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  hitchhiker  0.000248141 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3220  Rhs element Vgr protein  21.85 
 
 		 618 aa  71.2  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2892  hypothetical protein  22.08 
 
 		 499 aa  70.9  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1564  hypothetical protein  24.8 
 
 		 504 aa  70.5  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000029  hypothetical protein  26.25 
 
 		 611 aa  68.6  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4390  Rhs element Vgr protein  24.32 
 
 		 652 aa  67.8  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.86257  normal  0.698434 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0153  Rhs element Vgr protein  25.53 
 
 		 689 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1138  hypothetical protein  31.15 
 
 		 270 aa  66.6  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3849  Rhs element Vgr protein  23.14 
 
 		 675 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  22.01 
 
 		 613 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  21.85 
 
 		 735 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  28.72 
 
 		 790 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0770  Phage protein D-like protein  30.05 
 
 		 341 aa  62  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.737587  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1026  vgrG protein  25.31 
 
 		 1095 aa  61.6  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0454  Rhs element Vgr protein  27.27 
 
 		 671 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2151  Rhs element Vgr protein  26.34 
 
 		 706 aa  60.1  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  24.52 
 
 		 642 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18985  hypothetical protein  28.19 
 
 		 808 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261066  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  28.57 
 
 		 1118 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  21.41 
 
 		 618 aa  58.9  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2565  Rhs element Vgr protein  23.69 
 
 		 687 aa  58.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2572  Rhs element Vgr protein  23.69 
 
 		 687 aa  58.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0544876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2579  Rhs element Vgr protein  23.69 
 
 		 687 aa  58.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472026  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3719  Rhs element Vgr protein  25.73 
 
 		 723 aa  58.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331309  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3254  vgrG protein  22.48 
 
 		 710 aa  58.9  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  28.98 
 
 		 1057 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  38.89 
 
 		 858 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  25 
 
 		 1017 aa  57.4  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  38.89 
 
 		 930 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  38.89 
 
 		 896 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  38.89 
 
 		 872 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0650  Rhs element Vgr protein  24.02 
 
 		 727 aa  57.4  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0732792  normal  0.0253872 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0838  Rhs element Vgr protein  24.24 
 
 		 697 aa  57  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  22.95 
 
 		 709 aa  56.6  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  22.4 
 
 		 853 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1145  Rhs element Vgr protein  24.71 
 
 		 706 aa  56.2  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  43.1 
 
 		 1048 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21450  hypothetical protein  27.8 
 
 		 688 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  24.82 
 
 		 702 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  26.06 
 
 		 697 aa  55.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2094  Rhs element Vgr protein  22.56 
 
 		 646 aa  55.1  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.730907  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00256  Rhs-family protein  26.43 
 
 		 645 aa  55.5  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  22.25 
 
 		 741 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0115  vgrG protein  23.56 
 
 		 694 aa  54.7  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  26.46 
 
 		 643 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1508  phage protein D  21.69 
 
 		 348 aa  54.7  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  27.83 
 
 		 822 aa  54.3  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3454  type VI secretion system Vgr family protein  24.08 
 
 		 655 aa  54.3  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  25.15 
 
 		 646 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0043  Rhs element Vgr protein  24.27 
 
 		 320 aa  53.5  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  22.03 
 
 		 741 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  23.79 
 
 		 641 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  23.92 
 
 		 712 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>