More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1577 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 200 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  45.73 
 
 		 208 aa  182  3e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  52.53 
 
 		 185 aa  171  9e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  54.42 
 
 		 207 aa  154  7e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  43.37 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  39.18 
 
 		 203 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  45.34 
 
 		 204 aa  145  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  42.94 
 
 		 213 aa  138  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0042  electron transport protein SCO1/SenC  43.84 
 
 		 215 aa  132  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  41.83 
 
 		 191 aa  131  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0796  hypothetical protein  39.46 
 
 		 188 aa  128  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2683  electron transport protein SCO1/SenC  37.36 
 
 		 219 aa  128  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  45.83 
 
 		 201 aa  127  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  41.4 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  37.04 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  40.13 
 
 		 219 aa  125  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  36.51 
 
 		 210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  36.51 
 
 		 210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  37.87 
 
 		 206 aa  125  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  36.51 
 
 		 210 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  42.76 
 
 		 197 aa  124  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  40.35 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  40.35 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  37.97 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  43.48 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  40.46 
 
 		 205 aa  121  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  34.33 
 
 		 198 aa  121  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  37.19 
 
 		 196 aa  121  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  38.55 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  42.03 
 
 		 205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  32.24 
 
 		 291 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  35.63 
 
 		 204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  41.3 
 
 		 205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  39.87 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  39.76 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  42.03 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  41.67 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  42.03 
 
 		 205 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  42.03 
 
 		 205 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0096  SCO1/SenC family protein  37.78 
 
 		 193 aa  118  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000173101  n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  41.67 
 
 		 211 aa  118  6e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  42.03 
 
 		 191 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  42.03 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  39.31 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  37.11 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  39.16 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  37.11 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  35.2 
 
 		 200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  34.97 
 
 		 220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  34.87 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0379  electron transport protein SCO1/SenC  33.51 
 
 		 190 aa  115  3e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  39.78 
 
 		 215 aa  115  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  34.85 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  34.36 
 
 		 197 aa  115  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  42.54 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  34.81 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  42.14 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  35.18 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  36.84 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  35.16 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  31.5 
 
 		 287 aa  112  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  32.83 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  36.59 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3480  electron transport protein SCO1/SenC  32.82 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.92089  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  36.65 
 
 		 286 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  37.11 
 
 		 221 aa  112  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  38.19 
 
 		 202 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  32.39 
 
 		 208 aa  111  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  32.39 
 
 		 208 aa  111  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  41.48 
 
 		 187 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  36.25 
 
 		 192 aa  110  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001099  cytochrome oxidase biogenesis protein Sco1/SenC/PrrC putative copper metallochaperone  37.04 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  38.51 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  37.7 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1941  SCO1/SenC family protein  34.48 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000240174  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  41.4 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  40.26 
 
 		 217 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3333  electron transport protein SCO1/SenC  31.82 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  40.26 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  34.18 
 
 		 194 aa  109  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
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NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  35.03 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  32.99 
 
 		 197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  34.21 
 
 		 211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009784  VIBHAR_04842  hypothetical protein  36.3 
 
 		 204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  34.92 
 
 		 200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
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NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  30.73 
 
 		 218 aa  108  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  36.71 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
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NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  37.11 
 
 		 231 aa  108  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  41.48 
 
 		 207 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
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NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  37.97 
 
 		 198 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
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NC_009802  CCC13826_0870  SCO1/SenC family protein  35.17 
 
 		 180 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  35.44 
 
 		 199 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  39.71 
 
 		 205 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  39.71 
 
 		 205 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  39.71 
 
 		 205 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  39.71 
 
 		 205 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  39.71 
 
 		 205 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  39.71 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  36.57 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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