172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0694 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0694  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 171 aa  354  3.9999999999999996e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2110  regulatory protein, MarR  64.78 
 
 		 163 aa  220  6e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.450646  normal  0.261342 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2164  MarR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  38.41 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1154  MarR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 162 aa  97.1  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  33.1 
 
 		 180 aa  96.7  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 172 aa  91.7  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1799  putative transcriptional regulator  29.47 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1575  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1880  putative transcriptional regulator  29.47 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1623  MarR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  24.34 
 
 		 153 aa  53.9  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1584  MarR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 136 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000327576  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  29.11 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  36.08 
 
 		 160 aa  52  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  27.27 
 
 		 191 aa  52  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  26.39 
 
 		 146 aa  51.6  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1765  putative transcriptional regulator  26.53 
 
 		 136 aa  52  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3577  putative transcriptional regulator  26.53 
 
 		 136 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 146 aa  50.8  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  22.68 
 
 		 158 aa  50.8  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 167 aa  50.8  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  32.97 
 
 		 177 aa  50.8  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 167 aa  50.8  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  21.67 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  21.67 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  21.67 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  21.67 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  21.67 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  21.67 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  21.67 
 
 		 139 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  21.65 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  21.67 
 
 		 139 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 155 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  21.65 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  22.02 
 
 		 165 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  20.62 
 
 		 158 aa  48.9  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  22.02 
 
 		 165 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 158 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  21.65 
 
 		 157 aa  48.1  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 173 aa  47.8  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  19.59 
 
 		 161 aa  47.8  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3695  transcriptional regulator, MarR family  28.69 
 
 		 162 aa  47.8  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000171458  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0379  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 195 aa  47.8  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1979  MarR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 140 aa  47.8  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105372  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  25.51 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  21.78 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  27.54 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  20.83 
 
 		 140 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  21.78 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  21.78 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 150 aa  47.4  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  20.83 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  21.78 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  20.91 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1405  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 136 aa  46.6  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.159583  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 		 208 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  35.56 
 
 		 150 aa  45.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  30.1 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  35.29 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  19.8 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  26.5 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  46.94 
 
 		 255 aa  45.4  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 185 aa  45.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 171 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  35.29 
 
 		 159 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 145 aa  45.1  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  35.29 
 
 		 163 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 146 aa  44.7  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  24.07 
 
 		 177 aa  44.7  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 158 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 158 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 165 aa  44.3  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 158 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 165 aa  44.3  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.35 
 
 		 304 aa  44.3  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  20 
 
 		 161 aa  44.3  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 165 aa  44.3  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 165 aa  44.3  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 165 aa  44.3  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 165 aa  44.3  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 165 aa  44.3  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  35.29 
 
 		 159 aa  44.3  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 158 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 152 aa  44.3  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>