150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5312 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1752  hypothetical protein  42.33 
 
 
1921 aa  1445    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0681  hypothetical protein  51.79 
 
 
2055 aa  1727    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3385  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal  53.99 
 
 
2016 aa  2085    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2407  alpha-2-macroglobulin family protein  51.84 
 
 
2067 aa  1731    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1291  Alpha-2-macroglobulin-like  51.16 
 
 
2019 aa  1963    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522086  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1583  alpha-2-macroglobulin family protein  50.29 
 
 
2064 aa  1896    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3531  alpha-2-macroglobulin-like protein  53.57 
 
 
1993 aa  2071    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2382  alpha-2-macroglobulin-like protein  37.94 
 
 
1925 aa  1127    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.465265 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0942  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  51.2 
 
 
2020 aa  2015    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.802119 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3813  alpha-2-macroglobulin-like  51.44 
 
 
2036 aa  1952    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.683754  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5749  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  51.49 
 
 
2022 aa  1952    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3980  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  51.1 
 
 
2013 aa  1947    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0975356 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4555  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  51.44 
 
 
2036 aa  1952    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11517  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1953  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  66.7 
 
 
2007 aa  2683    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0156567 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3110  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  64.73 
 
 
1999 aa  2570    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3309  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  66.2 
 
 
2022 aa  2624    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.633759 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0785  hypothetical protein  51.84 
 
 
2055 aa  1728    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15169  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1204  alpha-2-macroglobulin family protein  51.9 
 
 
2053 aa  1731    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19066  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1127  alpha-2-macroglobulin family protein  50.52 
 
 
2050 aa  1910    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1749  alpha-2-macroglobulin family protein  51.84 
 
 
2057 aa  1730    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1162  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  39.15 
 
 
1910 aa  1168    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.434491  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4444  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  51.04 
 
 
2013 aa  1949    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5312  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  100 
 
 
1994 aa  4056    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.729079 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4092  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  51.52 
 
 
2013 aa  1956    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2661  alpha-2-macroglobulin domain protein  66.17 
 
 
2006 aa  2638    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.873515  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1355  alpha-2-macroglobulin domain protein  63.02 
 
 
2012 aa  2596    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.402585  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.11 
 
 
1916 aa  274  1e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.85 
 
 
1872 aa  270  2e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.73 
 
 
1821 aa  253  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  28.38 
 
 
1971 aa  239  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.75 
 
 
2191 aa  231  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1841  alpha-2-macroglobulin domain protein  27.89 
 
 
1971 aa  227  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2037  Alpha-2-macroglobulin-like protein2  28.32 
 
 
1974 aa  221  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.722352  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.48 
 
 
2195 aa  214  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2227  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.46 
 
 
1953 aa  186  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.66 
 
 
1737 aa  177  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310712  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.67 
 
 
2002 aa  162  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.87 
 
 
2002 aa  162  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.34 
 
 
1704 aa  155  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0928  alpha-2-macroglobulin-like  24.62 
 
 
1559 aa  154  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258342 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2357  Alpha-2-macroglobulin-like  24.12 
 
 
1906 aa  151  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0821687  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.01 
 
 
1927 aa  137  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0241  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.58 
 
 
1935 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.516561 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0303  alpha-2-macroglobulin-like  20.42 
 
 
1869 aa  124  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2364  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.66 
 
 
1833 aa  107  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211363  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09660  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.23 
 
 
1823 aa  105  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1356  hypothetical protein  22.4 
 
 
1808 aa  103  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1736  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.61 
 
 
1758 aa  101  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148696  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0024  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.35 
 
 
1808 aa  99  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2773  alpha-2-macroglobulin-like  23.88 
 
 
1815 aa  98.2  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.824984 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2471  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.96 
 
 
1697 aa  98.2  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000406567 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2573  hypothetical protein  21.89 
 
 
1603 aa  97.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188511  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3259  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.29 
 
 
1782 aa  94.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959704  normal  0.986614 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6005  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.52 
 
 
1823 aa  94.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0337827 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0071  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.91 
 
 
1872 aa  94  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.140868 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1193  hypothetical protein  20.14 
 
 
1807 aa  93.6  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0613973 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6591  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.45 
 
 
1596 aa  92.8  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509097  normal  0.0153598 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3310  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.57 
 
 
1594 aa  93.2  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0596632 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1120  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.24 
 
 
1768 aa  92.8  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0402  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.1 
 
 
1765 aa  92.4  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.882567  normal  0.753371 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2963  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.63 
 
 
1594 aa  92  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0778084 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4283  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.11 
 
 
1872 aa  92.4  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1535  extracellular alpha-helical protein  21.69 
 
 
1739 aa  92  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232844  normal  0.84967 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2823  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.4 
 
 
1737 aa  90.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2078  alpha-2-macroglobulin-like  22.04 
 
 
1738 aa  90.5  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0014  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.2 
 
 
1808 aa  89.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.617049  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0066  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.82 
 
 
1872 aa  89.7  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5103  hypothetical protein  23.2 
 
 
1516 aa  88.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2542  alpha-2-macroglobulin-like  23.48 
 
 
1737 aa  87.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380531  normal  0.505843 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7153  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.84 
 
 
1835 aa  87.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.847476 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3362  alpha-2-macroglobulin family protein  22.2 
 
 
1478 aa  86.3  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3542  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.11 
 
 
1819 aa  86.3  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3030  putative signal peptide protein  22.95 
 
 
1582 aa  85.1  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0044927  normal  0.201632 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58250  hypothetical protein  22.98 
 
 
1516 aa  84.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584692  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2368  alpha-2-macroglobulin family protein  21.86 
 
 
1504 aa  84.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1423  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.86 
 
 
1504 aa  84.7  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.427509  decreased coverage  0.0000103653 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2376  alpha-2-macroglobulin family protein  22.21 
 
 
1504 aa  84.7  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02154  putative membrane protein  21.86 
 
 
1534 aa  84  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02113  hypothetical protein  21.86 
 
 
1534 aa  84  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1630  hypothetical protein  19.65 
 
 
1921 aa  83.2  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0544  large extracellular alpha-helical protein  21.15 
 
 
1925 aa  82.8  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0066  hypothetical protein  20.2 
 
 
1898 aa  82  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1294  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.9 
 
 
1897 aa  81.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.448115  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2523  alpha-2-macroglobulin family protein  21.74 
 
 
1504 aa  81.3  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659146  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0104  Alpha-2-macroglobulin-like protein  22.66 
 
 
1759 aa  79  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1636  hypothetical protein  19.55 
 
 
1921 aa  77.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3921  hypothetical protein  22.99 
 
 
1839 aa  76.3  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.802641  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1390  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.81 
 
 
1768 aa  75.9  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.856631  normal  0.708848 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0389  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal:Alpha-2-macroglobulin, N-terminal 2  22.22 
 
 
1727 aa  75.5  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188526  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3447  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.64 
 
 
1832 aa  75.5  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1670  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.8 
 
 
1772 aa  75.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  0.347856 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2919  Alpha-2-macroglobulin-like protein  21.61 
 
 
1737 aa  74.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2137  hypothetical protein  21.84 
 
 
1834 aa  73.9  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0602  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  20.69 
 
 
1637 aa  73.2  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501993  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.58 
 
 
1824 aa  71.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3915  hypothetical protein  21.65 
 
 
1743 aa  71.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2551  alpha-2-macroglobulin-like  21.28 
 
 
1737 aa  68.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11715  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2804  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.03 
 
 
1653 aa  68.2  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1395  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.08 
 
 
1772 aa  68.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.985973  normal  0.0111299 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1148  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.03 
 
 
1653 aa  66.6  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>