More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4497 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4497  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  754    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.209765  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3842  hypothetical protein  54.47 
 
 		 365 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1929  hypothetical protein  54.62 
 
 		 365 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3032  hypothetical protein  54.6 
 
 		 354 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3829  hypothetical protein  41.88 
 
 		 362 aa  258  9e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5015  Male sterility domain-containing protein  32.2 
 
 		 667 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435156  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4650  male sterility domain protein  31.07 
 
 		 353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458104  normal  0.580556 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2925  hypothetical protein  24.7 
 
 		 618 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142893  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2045  mxaA domain protein  25.23 
 
 		 618 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7117  putative NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.39 
 
 		 580 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0187299  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2969  nucleotide sugar epimerase  24.39 
 
 		 618 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3227  hypothetical protein  24.7 
 
 		 618 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0125277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3211  mxaA domain protein  24.39 
 
 		 617 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3235  mxaA domain protein  24.24 
 
 		 618 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00294865  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0855  nucleotide sugar epimerase  24.63 
 
 		 618 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.625581  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3193  mxaA domain protein  24.55 
 
 		 618 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0896  MxaA domain-containing protein  24.7 
 
 		 627 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0954  MxaA domain-containing protein  24.7 
 
 		 627 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1667  hypothetical protein  27.33 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0262372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3148  Male sterility domain protein  30.12 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.33 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  26.67 
 
 		 661 aa  76.6  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  28.38 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  28.38 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4094  Male sterility domain protein  28.41 
 
 		 359 aa  73.2  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.796216  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.25 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  29.73 
 
 		 1506 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  30.34 
 
 		 659 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  28.91 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2778  male sterility domain protein  28.91 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2871  Male sterility domain protein  28.91 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2676  hypothetical protein  29.15 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0511814 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  24.73 
 
 		 665 aa  67.4  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5128  Male sterility domain protein  31.12 
 
 		 358 aa  67  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  25.45 
 
 		 671 aa  66.6  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 		 328 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23450  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  27.12 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292756  hitchhiker  0.00536132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  30.63 
 
 		 671 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.76 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.6 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178304  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  29.19 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  25.92 
 
 		 668 aa  62.4  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.41 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000549333 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  26.43 
 
 		 664 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.91 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  24.46 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4728  hypothetical protein  27.49 
 
 		 354 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.43 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  27.87 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3396  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5514  putative dihydrokaempferol 4-reductase (NAD-dependent epimerase/dehydratase)  26.42 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  26.92 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.65 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.667307 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.54 
 
 		 352 aa  59.3  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.37 
 
 		 320 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3013  hypothetical protein  25.91 
 
 		 366 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0103839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13818  dTDP-glucose-4,6-dehydratase  25.75 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.14 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  26.74 
 
 		 937 aa  58.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0266  hypothetical protein  25.4 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.488249  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0387  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.38 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.831837  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  27.38 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0377  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.38 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.54 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0171245  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1504  NAD dependent protein  23.93 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132125 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.75 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.82 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.16 
 
 		 335 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3275  hopanoid-associated sugar epimerase  26.26 
 
 		 328 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0434  polyketide synthase  37.19 
 
 		 4157 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1856  polyketide non-ribosomal peptide synthase  37.19 
 
 		 4123 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0530  putative polyketide synthase PksM  37.19 
 
 		 4122 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3516  amino acid adenylation domain-containing protein  23.76 
 
 		 995 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.14 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.14 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.733793  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2093  polyketide synthase, putative  36.36 
 
 		 4048 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  27.61 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5420  hopanoid-associated sugar epimerase  24.84 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1451.1  hypothetical protein  37.19 
 
 		 4580 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.84 
 
 		 335 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2161  hypothetical protein  37.19 
 
 		 4098 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4723  hopanoid-associated sugar epimerase  24.84 
 
 		 335 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 		 311 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.84 
 
 		 335 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5549  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.84 
 
 		 335 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2551  hypothetical protein  26.34 
 
 		 351 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0234245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0845  hypothetical protein  37.19 
 
 		 4101 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4933  Male sterility domain protein  30.29 
 
 		 437 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  0.407936 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.35 
 
 		 324 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.552356  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4973  amino acid adenylation  24.93 
 
 		 1188 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432296  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3187  amino acid adenylation domain-containing protein  24.93 
 
 		 1188 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4147  hypothetical protein  25.5 
 
 		 366 aa  54.7  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.95 
 
 		 352 aa  54.7  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  23.41 
 
 		 363 aa  54.3  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3257  hopanoid-associated sugar epimerase  24.84 
 
 		 335 aa  53.9  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273856  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.11 
 
 		 321 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  26.13 
 
 		 340 aa  54.3  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 		 307 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>