195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4285 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  100 
 
 
207 aa  434  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  91.01 
 
 
193 aa  364  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  90.48 
 
 
193 aa  362  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  86.24 
 
 
192 aa  347  5e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  85.19 
 
 
190 aa  345  4e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1899  hypothetical protein  78.64 
 
 
209 aa  334  5.999999999999999e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2668  uncharacterized peroxidase-related enzyme  78.97 
 
 
202 aa  329  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3003  hypothetical protein  80.73 
 
 
191 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  77.89 
 
 
199 aa  316  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  77.89 
 
 
198 aa  317  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  78.31 
 
 
194 aa  313  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  79.37 
 
 
196 aa  311  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  74.09 
 
 
201 aa  309  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  74.87 
 
 
202 aa  293  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  74.33 
 
 
201 aa  289  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  70.59 
 
 
196 aa  276  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  68.98 
 
 
192 aa  275  4e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  65.45 
 
 
194 aa  274  6e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  66.32 
 
 
201 aa  274  9e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  66.49 
 
 
192 aa  271  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  65.97 
 
 
192 aa  270  9e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  68.82 
 
 
189 aa  269  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  65.08 
 
 
201 aa  266  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.96 
 
 
192 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.45 
 
 
192 aa  263  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  64.1 
 
 
196 aa  263  1e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  66.67 
 
 
192 aa  262  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.95 
 
 
192 aa  261  6e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  65.41 
 
 
192 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.41 
 
 
192 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.41 
 
 
192 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  64.32 
 
 
192 aa  257  7e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  65.22 
 
 
192 aa  257  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8682  uncharacterized peroxidase-related enzyme  66.3 
 
 
192 aa  256  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.78 
 
 
192 aa  255  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6841  uncharacterized peroxidase-related enzyme  64.67 
 
 
192 aa  250  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2723  uncharacterized peroxidase-related enzyme  69.02 
 
 
189 aa  240  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  66.3 
 
 
192 aa  234  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  59.24 
 
 
200 aa  233  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2199  uncharacterized peroxidase-related enzyme  59.46 
 
 
195 aa  230  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3071  uncharacterized peroxidase-related enzyme  59.68 
 
 
192 aa  229  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000318179  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  57.3 
 
 
235 aa  223  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  53.19 
 
 
210 aa  214  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  52.28 
 
 
202 aa  210  9e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2532  uncharacterized peroxidase-related enzyme  52.15 
 
 
228 aa  202  4e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.872008  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1633  uncharacterized peroxidase-related enzyme  53.93 
 
 
194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.11 
 
 
216 aa  160  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  46.55 
 
 
190 aa  159  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.61 
 
 
217 aa  155  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  43.68 
 
 
191 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  46.3 
 
 
212 aa  149  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  40.66 
 
 
201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  38.67 
 
 
195 aa  144  9e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  38.46 
 
 
191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  40 
 
 
214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.63 
 
 
214 aa  137  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0194  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.37 
 
 
202 aa  89  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2585  hypothetical protein  30.19 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2630  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.19 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544935  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2624  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.19 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19737  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3017  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.32 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271489  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.11 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.36 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0195  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.25 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  30.23 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3941  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.24 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0161606  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3579  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.75 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.95961  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1476  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.75 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.399629  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.71 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.91 
 
 
178 aa  67.8  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5106  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.44 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.153962 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2695  peroxidase-like  27.82 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.500229 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1371  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.45 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5313  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.5 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2539  uncharacterized peroxidase  27.5 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.56 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  25.29 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  28.49 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  26.82 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6526  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.72 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00474121  normal  0.101119 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.81 
 
 
181 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.56 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  26.4 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.55 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  24.07 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  24.71 
 
 
172 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  25.75 
 
 
177 aa  63.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.81 
 
 
181 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.07 
 
 
181 aa  64.7  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.71 
 
 
172 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2816  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  27.61 
 
 
196 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0335697  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  27.39 
 
 
183 aa  63.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.27 
 
 
181 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  29.88 
 
 
227 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1869  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.81 
 
 
201 aa  63.5  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0138584  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  26.47 
 
 
183 aa  62.8  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2544  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.28 
 
 
195 aa  62  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.165226  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3853  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.57 
 
 
192 aa  62.4  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.26579 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1888  hypothetical protein  30.28 
 
 
197 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113894  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  25.97 
 
 
190 aa  61.6  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>