More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0822 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0822  hypothetical protein  100 
 
 
375 aa  759    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4060  hypothetical protein  69.59 
 
 
334 aa  410  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.354383  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3405  hypothetical protein  69.59 
 
 
330 aa  410  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4699  hypothetical protein  66.13 
 
 
343 aa  402  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1076  hypothetical protein  60.66 
 
 
345 aa  382  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3604  hypothetical protein  47.5 
 
 
356 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3448  hypothetical protein  51.32 
 
 
360 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5132  hypothetical protein  44.63 
 
 
334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0124  twin-arginine translocation pathway signal  45.82 
 
 
335 aa  259  8e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1680  hypothetical protein  40.77 
 
 
330 aa  243  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1829  hypothetical protein  42.86 
 
 
327 aa  243  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  43 
 
 
328 aa  235  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  39.42 
 
 
331 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2519  hypothetical protein  39.67 
 
 
324 aa  224  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4615  hypothetical protein  38.92 
 
 
320 aa  219  6e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  39.13 
 
 
325 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  39.13 
 
 
327 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  37.19 
 
 
331 aa  216  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4449  extra-cytoplasmic solute receptor  38.02 
 
 
327 aa  215  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0356205  normal  0.159319 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  40.06 
 
 
326 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  38.51 
 
 
330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  40 
 
 
334 aa  213  5.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  40.14 
 
 
328 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  35.71 
 
 
346 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1466  hypothetical protein  40.31 
 
 
335 aa  212  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.652931 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  38.78 
 
 
339 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  39.1 
 
 
325 aa  211  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  38.01 
 
 
328 aa  209  5e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  38.72 
 
 
325 aa  209  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  37.29 
 
 
324 aa  209  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  39.93 
 
 
337 aa  209  7e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  36.09 
 
 
328 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  37.46 
 
 
326 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  39.39 
 
 
343 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  36.47 
 
 
331 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  35.06 
 
 
327 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  36.2 
 
 
326 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  38.8 
 
 
323 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  37.33 
 
 
349 aa  206  6e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  34.97 
 
 
327 aa  206  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1233  hypothetical protein  34.47 
 
 
379 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  38.72 
 
 
328 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  34.88 
 
 
323 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  36.28 
 
 
341 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  38.23 
 
 
333 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  38.64 
 
 
330 aa  203  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  36.02 
 
 
328 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  37.74 
 
 
322 aa  203  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  36.3 
 
 
330 aa  203  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6079  hypothetical protein  38.63 
 
 
327 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1270  hypothetical protein  40.49 
 
 
323 aa  202  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3683  twin-arginine translocation pathway signal  39.49 
 
 
326 aa  202  9e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0852906  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  37.06 
 
 
337 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  38.38 
 
 
330 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  38.08 
 
 
315 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1931  hypothetical protein  35.98 
 
 
329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3347  hypothetical protein  37.41 
 
 
330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261888  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  38.99 
 
 
322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  38.31 
 
 
330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  38.46 
 
 
312 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0267  hypothetical protein  37.03 
 
 
337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.717963  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  35.51 
 
 
334 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  38.54 
 
 
324 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  36.65 
 
 
327 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  36.39 
 
 
327 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  33.67 
 
 
356 aa  200  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1478  hypothetical protein  38.54 
 
 
340 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  34.97 
 
 
352 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  38.84 
 
 
330 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  35.76 
 
 
345 aa  199  6e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  35.76 
 
 
345 aa  199  6e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3163  hypothetical protein  36.47 
 
 
330 aa  199  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  38.46 
 
 
341 aa  199  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4521  hypothetical protein  40.58 
 
 
338 aa  199  7e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.843645  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  37.07 
 
 
339 aa  199  7.999999999999999e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  36.46 
 
 
325 aa  199  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  37.04 
 
 
329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  36.22 
 
 
336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  33.64 
 
 
325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  36.83 
 
 
328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  36.39 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  36.68 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  35.12 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  37.27 
 
 
359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6260  hypothetical protein  40.2 
 
 
332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  37.37 
 
 
329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  38.78 
 
 
325 aa  197  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  34.77 
 
 
330 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  33.94 
 
 
331 aa  197  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0350  hypothetical protein  35.25 
 
 
336 aa  197  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  35.97 
 
 
310 aa  197  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  34.41 
 
 
333 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  37.38 
 
 
322 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  36.05 
 
 
335 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  37.14 
 
 
334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2466  hypothetical protein  33.67 
 
 
321 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3593  hypothetical protein  40.74 
 
 
328 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  36.73 
 
 
337 aa  196  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  40.67 
 
 
334 aa  196  7e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  35.47 
 
 
324 aa  196  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>