More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0567 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0567  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  659    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2295  hypothetical protein  72.45 
 
 		 316 aa  451  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.491669  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3576  hypothetical protein  65.53 
 
 		 330 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.37147  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4467  hypothetical protein  61.82 
 
 		 328 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0114308  normal  0.0574707 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5792  hypothetical protein  52.92 
 
 		 326 aa  322  8e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4082  hypothetical protein  51.55 
 
 		 291 aa  291  9e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1801  hypothetical protein  42.18 
 
 		 343 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.939675  normal  0.361643 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5315  hypothetical protein  36.03 
 
 		 332 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248972  normal  0.736345 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1950  hypothetical protein  34.25 
 
 		 327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0031153 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2943  hypothetical protein  34.01 
 
 		 333 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.357737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5624  hypothetical protein  35.89 
 
 		 321 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  35.53 
 
 		 328 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3311  hypothetical protein  34.94 
 
 		 324 aa  195  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2663  hypothetical protein  34.92 
 
 		 324 aa  195  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0805  hypothetical protein  36.9 
 
 		 328 aa  192  5e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  33.94 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0198  twin-arginine translocation pathway signal  37.41 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.297337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  35.59 
 
 		 339 aa  189  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4796  hypothetical protein  35.69 
 
 		 331 aa  189  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3194  hypothetical protein  36.05 
 
 		 328 aa  188  9e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195792  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  35.33 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0286  hypothetical protein  34.01 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0136  hypothetical protein  37.41 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  36.36 
 
 		 328 aa  186  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0236  hypothetical protein  33.79 
 
 		 329 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  36.7 
 
 		 330 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  36.42 
 
 		 333 aa  186  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  36.03 
 
 		 328 aa  186  7e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5978  hypothetical protein  34.66 
 
 		 327 aa  185  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665972  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  35.03 
 
 		 335 aa  185  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2451  hypothetical protein  35.62 
 
 		 330 aa  185  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  36.61 
 
 		 328 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  35.27 
 
 		 349 aa  183  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4788  hypothetical protein  34.23 
 
 		 328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126294  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0073  hypothetical protein  35.76 
 
 		 330 aa  182  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  34.12 
 
 		 325 aa  182  6e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  32.78 
 
 		 325 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  33.89 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  33.02 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5514  hypothetical protein  36.3 
 
 		 330 aa  179  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  33.94 
 
 		 330 aa  179  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  34.8 
 
 		 323 aa  179  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  32.83 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  32.4 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1838  hypothetical protein  33.44 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  34.59 
 
 		 348 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  35.06 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  35.78 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  34.46 
 
 		 337 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  32.05 
 
 		 326 aa  176  6e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0164  hypothetical protein  35.49 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  35.69 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  35.81 
 
 		 323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0880  hypothetical protein  35.22 
 
 		 328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal  0.406505 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  36.71 
 
 		 327 aa  172  5e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  36.71 
 
 		 325 aa  172  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  34.75 
 
 		 328 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  34.58 
 
 		 327 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  36.13 
 
 		 366 aa  172  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  33.04 
 
 		 323 aa  172  9e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2909  hypothetical protein  34.35 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  33.11 
 
 		 332 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0560  twin-arginine translocation pathway signal  32.74 
 
 		 325 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  33.44 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  33.02 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0710  hypothetical protein  36.61 
 
 		 331 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  34.32 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  31.21 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0590  hypothetical protein  32.43 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  32.53 
 
 		 328 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  31.52 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3913  extra-cytoplasmic solute receptor  35.64 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107287  normal  0.463561 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  33.1 
 
 		 353 aa  170  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  33.11 
 
 		 322 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  32.88 
 
 		 332 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4305  hypothetical protein  33.12 
 
 		 327 aa  169  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5205  extra-cytoplasmic solute receptor  31.51 
 
 		 330 aa  169  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375676  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  33.45 
 
 		 335 aa  169  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  35.69 
 
 		 314 aa  169  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  32.53 
 
 		 330 aa  169  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  30.97 
 
 		 326 aa  168  9e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  34.65 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  33.54 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3116  twin-arginine translocation pathway signal  32.99 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.143461  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  33.64 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3683  twin-arginine translocation pathway signal  33.64 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0852906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3910  hypothetical protein  32.88 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.032337  normal  0.0571508 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  32.68 
 
 		 355 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  33.33 
 
 		 337 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4163  hypothetical protein  33.12 
 
 		 322 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0521612  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0604  hypothetical protein  36.73 
 
 		 329 aa  166  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  34.03 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  32.82 
 
 		 332 aa  166  6.9999999999999995e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4265  hypothetical protein  35.4 
 
 		 328 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1466  hypothetical protein  37.03 
 
 		 335 aa  166  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.652931 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  33.67 
 
 		 359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3899  hypothetical protein  35.09 
 
 		 341 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129071  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4856  hypothetical protein  31.96 
 
 		 325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.876948  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0796  hypothetical protein  34.02 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.980673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  33.11 
 
 		 335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>