More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0872 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  100 
 
 		 981 aa  1975    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  80.68 
 
 		 974 aa  1593    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  78.17 
 
 		 974 aa  1513    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  26.11 
 
 		 1077 aa  261  6e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3833  transport protein  23.09 
 
 		 944 aa  237  8e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12363  transmembrane transport protein mmpL9  22.47 
 
 		 962 aa  224  4e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  21.84 
 
 		 967 aa  225  4e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11778  MmpL family membrane protein  25.05 
 
 		 945 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000786949  decreased coverage  0.0000000000113435 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10407  transmembrane transport protein mmpL1  23.02 
 
 		 958 aa  216  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.665513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4825  transport protein  21.64 
 
 		 1001 aa  214  7e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2705  transport protein  23.15 
 
 		 957 aa  211  5e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10518  transmembrane transport protein mmpL2  22.01 
 
 		 968 aa  199  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.930398 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  28.22 
 
 		 1040 aa  194  9e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1057  transport protein  21.56 
 
 		 963 aa  193  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  28.1 
 
 		 1054 aa  192  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  24.44 
 
 		 1049 aa  184  9.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  26.53 
 
 		 1013 aa  181  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0580  putative transporter  27.25 
 
 		 1109 aa  177  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0665985  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0591  MmpL family membrane protein  27.25 
 
 		 1109 aa  176  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  25.25 
 
 		 1011 aa  173  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  36.72 
 
 		 713 aa  171  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  30.77 
 
 		 882 aa  171  8e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  27.52 
 
 		 726 aa  168  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  38.27 
 
 		 1146 aa  164  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  28.7 
 
 		 745 aa  162  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  29 
 
 		 743 aa  161  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  24.7 
 
 		 1068 aa  161  7e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  26.37 
 
 		 743 aa  158  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0890  MMPL domain protein  28.13 
 
 		 1026 aa  157  8e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000250771  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  33.12 
 
 		 743 aa  156  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  32.8 
 
 		 743 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  33.12 
 
 		 743 aa  153  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  33.12 
 
 		 743 aa  153  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  33.12 
 
 		 743 aa  154  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  33.12 
 
 		 743 aa  153  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  26.52 
 
 		 723 aa  153  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  28.45 
 
 		 713 aa  153  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2953  membrane protein, MmpL family  24.95 
 
 		 1038 aa  152  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2287  membrane protein, MmpL family  26.33 
 
 		 1038 aa  152  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0482318  hitchhiker  0.0000000000000416433 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  32.48 
 
 		 743 aa  151  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  25.84 
 
 		 1002 aa  151  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  27.59 
 
 		 740 aa  151  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  27.29 
 
 		 1000 aa  150  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  33.12 
 
 		 743 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2742  MMPL domain-containing protein  26.05 
 
 		 1038 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242391  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  27.25 
 
 		 1001 aa  149  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2691  MmpL family membrane protein  25.16 
 
 		 1041 aa  148  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.475251  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  33.74 
 
 		 1062 aa  148  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  33.74 
 
 		 1062 aa  148  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2670  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1041 aa  147  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  27.95 
 
 		 709 aa  147  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0814  hypothetical protein  27.46 
 
 		 1002 aa  147  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  26.02 
 
 		 998 aa  146  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  27.02 
 
 		 945 aa  146  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  27.02 
 
 		 945 aa  146  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  26.02 
 
 		 998 aa  146  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  26.02 
 
 		 998 aa  146  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2741  hypothetical protein  25.92 
 
 		 810 aa  145  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  32.44 
 
 		 747 aa  144  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2996  putative membrane protein, MmpL family  25.71 
 
 		 1038 aa  144  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000662064  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  39.27 
 
 		 730 aa  142  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2990  MmpL family membrane protein putative  25.1 
 
 		 1038 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189958  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  36.52 
 
 		 576 aa  139  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  25.4 
 
 		 1089 aa  139  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  38.33 
 
 		 699 aa  139  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  23.99 
 
 		 1013 aa  139  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  31.46 
 
 		 714 aa  138  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  36.77 
 
 		 753 aa  137  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  34.75 
 
 		 682 aa  137  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  34.33 
 
 		 712 aa  136  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  23.52 
 
 		 1246 aa  136  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  23.73 
 
 		 1028 aa  136  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  38.89 
 
 		 737 aa  135  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  38.56 
 
 		 727 aa  134  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  34.8 
 
 		 750 aa  134  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  35.74 
 
 		 1003 aa  134  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  23.55 
 
 		 681 aa  134  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.839502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  35.9 
 
 		 697 aa  134  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  38.86 
 
 		 733 aa  134  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  36.65 
 
 		 702 aa  132  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  36.12 
 
 		 699 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  38.54 
 
 		 701 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  23.22 
 
 		 1040 aa  133  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  36.56 
 
 		 714 aa  131  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  34.39 
 
 		 764 aa  131  7.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  33.98 
 
 		 702 aa  130  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  34.04 
 
 		 339 aa  130  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  32.33 
 
 		 730 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4418  transport protein  23.14 
 
 		 948 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063936  normal  0.179465 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  31.54 
 
 		 730 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1936  transport protein  28.85 
 
 		 941 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  33.74 
 
 		 1022 aa  128  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  33.74 
 
 		 1022 aa  128  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  32.98 
 
 		 712 aa  128  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  32.71 
 
 		 730 aa  127  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  32.71 
 
 		 730 aa  127  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  32.71 
 
 		 730 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  32.71 
 
 		 730 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  32.71 
 
 		 730 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  31.95 
 
 		 730 aa  127  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>