More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3049 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3049  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 
179 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000710191  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3071  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 
179 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3491  transcriptional regulator NrdR  75.84 
 
 
180 aa  239  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4664  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like  63.53 
 
 
175 aa  221  6e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.280022  decreased coverage  0.00221105 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4029  ATP-cone domain protein  67.57 
 
 
184 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292973 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1866  transcriptional regulator NrdR  64 
 
 
158 aa  203  8e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.610385  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03481  transcriptional regulator NrdR  63.51 
 
 
157 aa  196  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03381  transcriptional regulator NrdR  58.11 
 
 
159 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.36226  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03371  transcriptional regulator NrdR  57.43 
 
 
159 aa  190  1e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0319  transcriptional regulator NrdR  57.43 
 
 
159 aa  190  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22151  transcriptional regulator NrdR  58.11 
 
 
158 aa  190  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03461  transcriptional regulator NrdR  58.11 
 
 
159 aa  188  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0695  transcriptional regulator NrdR  64.81 
 
 
168 aa  186  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000331414  normal  0.212475 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1690  transcriptional regulator NrdR  59.46 
 
 
159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04031  transcriptional regulator NrdR  59.46 
 
 
159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.5904 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0469  transcriptional regulator NrdR  62.67 
 
 
164 aa  181  3e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 
151 aa  170  9e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  49.33 
 
 
158 aa  164  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  50.33 
 
 
151 aa  164  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1376  transcriptional regulator NrdR  48 
 
 
151 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  48.37 
 
 
154 aa  160  8.000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0768  ATP-cone domain protein  51.35 
 
 
148 aa  159  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.376123  normal  0.291011 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4041  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 
163 aa  158  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  43.42 
 
 
153 aa  154  6e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  48.99 
 
 
150 aa  154  7e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  50.67 
 
 
153 aa  154  7e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 
153 aa  151  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  48.67 
 
 
150 aa  151  5e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 
153 aa  150  8e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  45.7 
 
 
156 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1070  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 
150 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102337  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  46 
 
 
163 aa  149  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  45.7 
 
 
155 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2875  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 
156 aa  149  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.362854  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0989  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 
152 aa  149  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38462  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  45.7 
 
 
155 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 
162 aa  148  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1730  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 
149 aa  148  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593738  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07390  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 
147 aa  147  7e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000247789  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2012  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 
149 aa  147  8e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.37372  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 
158 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 
153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 
150 aa  147  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000265338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  44.67 
 
 
156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  44.59 
 
 
148 aa  145  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 
150 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10820  transcriptional regulator NrdR  51.68 
 
 
149 aa  145  4.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000786411  unclonable  0.00000000140885 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 
154 aa  145  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4411  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 
153 aa  144  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000407341  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0042  ATP-cone domain protein  46.05 
 
 
165 aa  144  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.67036  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3251  transcriptional regulator NrdR  46 
 
 
152 aa  144  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1200  ATP-cone domain protein  42 
 
 
155 aa  144  7.0000000000000006e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 
150 aa  143  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 
150 aa  143  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1249  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 
156 aa  142  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0638697  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4090  ATP-cone domain protein  48.3 
 
 
154 aa  142  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 
150 aa  142  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2033  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 
150 aa  142  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1887  ATP-cone domain protein  44.31 
 
 
176 aa  142  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  45.03 
 
 
154 aa  142  3e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  45.33 
 
 
157 aa  141  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0048  ATP-cone domain protein  49.08 
 
 
158 aa  141  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1870  ATP-cone domain protein  44.74 
 
 
175 aa  140  7e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0173764  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0063  ATP-cone domain-containing protein  46.94 
 
 
173 aa  140  8e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.987989 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 
150 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  41.18 
 
 
153 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 
150 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 
150 aa  139  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1186  transcriptional regulator NrdR  43.33 
 
 
157 aa  137  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.526679  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1330  transcriptional regulator NrdR  45.03 
 
 
151 aa  137  7e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.768673  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  44.81 
 
 
154 aa  137  8.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1579  transcriptional regulator NrdR  46 
 
 
157 aa  137  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000136219  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  44.67 
 
 
154 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0578  transcriptional regulator NrdR  46 
 
 
157 aa  137  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0566  transcriptional regulator NrdR  44.67 
 
 
154 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0513  transcriptional regulator NrdR  44 
 
 
154 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579451  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0729  transcriptional regulator NrdR  40.14 
 
 
165 aa  135  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0559  transcriptional regulator NrdR  44 
 
 
154 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0548  transcriptional regulator NrdR  44 
 
 
154 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1044  transcriptional regulator NrdR  44.67 
 
 
175 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0576  transcriptional regulator NrdR  43.31 
 
 
173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0454  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 
149 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0334  transcriptional regulator NrdR  43.62 
 
 
149 aa  135  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402323  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0517  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 
149 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0475  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 
149 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0456  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 
149 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0462  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 
149 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0689  hypothetical protein  44.67 
 
 
154 aa  134  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  42.28 
 
 
149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3858  transcriptional regulator NrdR  44.67 
 
 
155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1777  transcriptional regulator NrdR  41.72 
 
 
156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>