69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2461 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  100 
 
 		 196 aa  406  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  63.02 
 
 		 196 aa  268  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  0.00000101589 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  62.5 
 
 		 196 aa  267  8e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  63.64 
 
 		 200 aa  263  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  44.92 
 
 		 205 aa  162  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  39.15 
 
 		 194 aa  144  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  42.02 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  36.17 
 
 		 196 aa  129  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176829 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  37.75 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1478  CRISPR-associated protein Cas4  38.5 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.470243 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  37.84 
 
 		 210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  38.25 
 
 		 255 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0494  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  34.81 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  34.5 
 
 		 550 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  34.48 
 
 		 553 aa  112  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  34.5 
 
 		 570 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  36.02 
 
 		 545 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.75 
 
 		 544 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  32.8 
 
 		 215 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.02 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1432  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.87 
 
 		 214 aa  105  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.343364  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  33.85 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1299  hypothetical protein  34.38 
 
 		 214 aa  101  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.938866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  33.88 
 
 		 206 aa  101  8e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0605  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  31.75 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.452129 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  36.41 
 
 		 559 aa  99.8  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2652  CRISPR-associated protein Cas4  35.26 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0303971  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  36.51 
 
 		 216 aa  99  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  35.26 
 
 		 199 aa  98.6  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2723  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.55 
 
 		 208 aa  98.6  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1155  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.18 
 
 		 212 aa  97.1  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3906  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.91 
 
 		 212 aa  96.7  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164887  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0793  CRISPR-associated protein Cas4  34.57 
 
 		 209 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813459  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1661  CRISPR-associated protein Cas4  32.07 
 
 		 214 aa  95.9  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.975016  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  32 
 
 		 598 aa  94  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02697  crispr-associated protein Cas4  34.05 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  31.86 
 
 		 580 aa  91.7  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2343  hypothetical protein  31.86 
 
 		 333 aa  91.7  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0235  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.16 
 
 		 211 aa  89.4  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  33.03 
 
 		 594 aa  88.2  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2974  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.21 
 
 		 212 aa  88.6  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0832  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  32.64 
 
 		 228 aa  88.6  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3647  CRISPR-associated protein Cas4  27.57 
 
 		 225 aa  87.8  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4331  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.77 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000854832  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0851  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  29.59 
 
 		 224 aa  87  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1481  CRISPR-associated protein Cas4  28 
 
 		 222 aa  85.9  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  29.51 
 
 		 190 aa  86.3  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2187  CRISPR-associated protein Cas4  27.57 
 
 		 223 aa  85.1  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  32.31 
 
 		 558 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1006  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.79 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1632  CRISPR-associated protein Cas4  30.89 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.98908 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3523  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  32.64 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1975  CRISPR-associated protein Cas4  27.14 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.35 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0479  RecB family exonuclease  27.27 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.957708  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3345  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.96 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0218123  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  26.49 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1076  CRISPR-associated Cas4 family protein  22.92 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.32 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.06 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1765  CRISPR-associated protein Cas4  25.27 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6022  CRISPR-associated protein Cas4  26.34 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  0.45154 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0438  hypothetical protein  24.76 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.503828  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  23 
 
 		 198 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1816  hypothetical protein  29.32 
 
 		 170 aa  48.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.115857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0309  CRISPR-associated protein Cas4  24.86 
 
 		 165 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1878  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.32 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2603  hypothetical protein  28.21 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.519513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0755  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.09 
 
 		 178 aa  41.6  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.714771  normal  0.862744 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>