188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1214 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1214  response regulator receiver protein  100 
 
 		 131 aa  271  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.15 
 
 		 426 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11642  two component system transcriptional regulator  32.74 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0378541  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.46 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3775  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  33.33 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.665226  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1807  putative PAS/PAC sensor protein  30.89 
 
 		 258 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.254511 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0268  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.1 
 
 		 456 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540037 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0283  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.1 
 
 		 456 aa  53.9  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3151  response regulator receiver  31.25 
 
 		 206 aa  53.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.332536 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 359 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3018  response regulator receiver  29.73 
 
 		 207 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2958  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.57 
 
 		 229 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.799557  normal  0.502809 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 472 aa  53.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  30.83 
 
 		 380 aa  53.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2035  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.9 
 
 		 199 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.86 
 
 		 210 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3067  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.86 
 
 		 210 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3036  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.86 
 
 		 210 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222389  normal  0.216241 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0495  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 456 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3378  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.63 
 
 		 206 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3427  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.33 
 
 		 256 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1181  response regulator receiver  32.14 
 
 		 207 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.928438  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.45 
 
 		 220 aa  52  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  30.36 
 
 		 204 aa  51.6  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0794  two component transcriptional regulator  31.45 
 
 		 232 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.665518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0900  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000110071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2955  response regulator  30.17 
 
 		 199 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1643  response regulator receiver protein  32.54 
 
 		 130 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4195  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.81513  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2860  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.17 
 
 		 214 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153721  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4327  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  32.48 
 
 		 875 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1517  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394491  normal  0.160821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1468  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  30.97 
 
 		 197 aa  50.4  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5540  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.7 
 
 		 200 aa  50.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3159  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.25 
 
 		 212 aa  50.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2840  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.09 
 
 		 213 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0895  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.83 
 
 		 701 aa  50.4  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3575  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.57 
 
 		 229 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10936  normal  0.0183031 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  34.45 
 
 		 461 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4203  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.82 
 
 		 195 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.793788  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0751  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 485 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0880271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2212  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.092497  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2047  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.95 
 
 		 191 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000169009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1847  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 459 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.122843  normal  0.436579 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.03 
 
 		 229 aa  48.5  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.788892 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.57 
 
 		 199 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.144201  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  31.36 
 
 		 352 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1557  response regulator receiver  28.33 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000412225  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2893  response regulator receiver  30.09 
 
 		 206 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.723289  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1506  response regulator receiver and ANTAR domain protein  24 
 
 		 220 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4102  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.4 
 
 		 194 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 224 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  29.92 
 
 		 236 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1689  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.45 
 
 		 201 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000385738 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.93 
 
 		 233 aa  47.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1694  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.45 
 
 		 201 aa  47.8  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 386 aa  47.4  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2915  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  25.62 
 
 		 457 aa  47  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.75 
 
 		 989 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 457 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3061  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.32 
 
 		 194 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00113676  hitchhiker  0.000689676 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2932  two-component response regulator  29.06 
 
 		 269 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2703  two-component response regulator  29.06 
 
 		 269 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.69 
 
 		 236 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.09 
 
 		 196 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4302  signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 343 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219335  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1992  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 460 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3511  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 384 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0841  response regulator receiver  27.64 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1886  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  27.68 
 
 		 461 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 224 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.17 
 
 		 196 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  26.23 
 
 		 230 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.1 
 
 		 989 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  26.23 
 
 		 230 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3658  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.4 
 
 		 194 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.568485 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1274  two-component response regulator  29.06 
 
 		 269 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2117  putative PAS/PAC sensor protein  30.51 
 
 		 257 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5687  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.77 
 
 		 210 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  31.97 
 
 		 429 aa  44.7  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2159  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.57 
 
 		 227 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177162  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  30.95 
 
 		 248 aa  45.1  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3363  response regulator receiver protein  30.97 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.387857 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0942  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.23 
 
 		 231 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0532517  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.25 
 
 		 953 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0985  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.57 
 
 		 704 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000494124  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1215  response regulator receiver protein  28.1 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2434  response regulator receiver protein  27.19 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247516  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.31 
 
 		 200 aa  44.7  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0188  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 245 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00347389  normal  0.0545477 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  28.21 
 
 		 603 aa  44.7  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.23 
 
 		 231 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2483  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.19 
 
 		 205 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.25 
 
 		 194 aa  44.3  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1813  response regulator receiver protein  25.64 
 
 		 316 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.445517  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  28.68 
 
 		 234 aa  43.9  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2285  response regulator receiver  29.27 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000158247  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.77 
 
 		 225 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0905  two component transcriptional regulator  30.17 
 
 		 238 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>