More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4646 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4646  transcriptional regulator, RpiR family  100 
 
 		 280 aa  518  1e-146  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.308947  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1970  RpiR family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3036  RpiR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 293 aa  175  7e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35980  transcriptional regulator, RpiR family  37.72 
 
 		 333 aa  145  9e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.309329  normal  0.261129 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2295  RpiR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 284 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651664  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2246  transcriptional regulator, RpiR family  33.33 
 
 		 284 aa  142  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3077  transcriptional regulator, RpiR family  33.33 
 
 		 284 aa  142  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143664 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4516  transcriptional regulator, RpiR family  36.27 
 
 		 322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.937314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4022  transcriptional regulator, RpiR family  34.72 
 
 		 320 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0204031  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2088  RpiR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0949278  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1662  RpiR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.574027  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2832  RpiR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.233384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0269  transcriptional regulator, RpiR family  35.13 
 
 		 304 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.409833  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0168  RpiR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 280 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.057217  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3209  RpiR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2753  transcriptional regulator, RpiR family  36.52 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1547  RpiR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0250  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  32.38 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3960  RpiR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 304 aa  123  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162661  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1162  RpiR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 270 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2433  transcriptional regulator, RpiR family  25.3 
 
 		 282 aa  122  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000784459  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2323  putative transcriptional regulator  31.91 
 
 		 315 aa  122  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2984  sugar isomerase (SIS)  36.03 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  23.74 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29100  transcriptional regulator  38.26 
 
 		 290 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1406  RpiR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 292 aa  116  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7367  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  29.86 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276033  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1297  RpiR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 292 aa  116  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0475  transcriptional regulator, RpiR family  32.81 
 
 		 327 aa  115  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2771  RpiR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 292 aa  115  7.999999999999999e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114132 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1776  transcriptional regulator, RpiR family  29.12 
 
 		 281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1778  RpiR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.141472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4054  RpiR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.544392  normal  0.902505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5684  putative transcriptional regulator, RpiR family  34.56 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3444  RpiR family transcriptional regulator  34.49 
 
 		 339 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0151  transcriptional regulator, RpiR family  36.14 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.15102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1223  RpiR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 339 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.809611  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2045  putative transcriptional regulator, RpiR family  34.64 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7211  transcriptional regulator, RpiR family  33.33 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2756  transcriptional regulator, RpiR family  35.14 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2468  RpiR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899807  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0283  transcriptional regulator, RpiR family  31.66 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0898  HTH-type transcriptional regulator, rpiR family  28.41 
 
 		 292 aa  108  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.679683  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2674  transcriptional regulator, RpiR family  39.45 
 
 		 293 aa  108  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0539121 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3444  RpiR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 332 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3409  RpiR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 332 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.977628  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2447  RpiR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2634  RpiR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0365  RpiR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1216  RpiR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.3152  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0626  RpiR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0176  RpiR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0659  RpiR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.78991  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0694  RpiR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592918 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0580  RpiR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658912  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0750  RpiR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414867  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0588  RpiR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 273 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0423  RpiR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0554  RpiR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.335525  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3745  RpiR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 282 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0672  transcriptional regulator, RpiR family  33.71 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.654483  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0521  RpiR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 283 aa  106  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.207231  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3507  transcriptional regulator, RpiR family  35.42 
 
 		 342 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0619346 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5676  RpiR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 323 aa  105  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321786 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1394  transcriptional regulator, RpiR family  33.33 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0784467  normal  0.640102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2853  transcriptional regulator, RpiR family  32.22 
 
 		 316 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.543302 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0696  RpiR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 289 aa  104  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000925251  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3371  transcriptional regulator, RpiR family  31.97 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1080  RpiR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0801962  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3388  RpiR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1124  RpiR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.673079  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0941  RpiR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0472093  normal  0.387072 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0070  RpiR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 269 aa  103  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27270  DNA-binding transcriptional regulator HexR  30.83 
 
 		 289 aa  102  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1333  DNA-binding transcriptional regulator HexR  29.03 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0116463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2724  RpiR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2589  DNA-binding transcriptional regulator HexR  29.03 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00161066  normal  0.817634 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01824  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.67 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000364184  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1787  transcriptional regulator, RpiR family  28.67 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000522748  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2581  RpiR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  hitchhiker  0.000000255705 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1946  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.67 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.90466  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01812  hypothetical protein  28.67 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000387969  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2083  DNA-binding transcriptional regulator HexR  29.03 
 
 		 289 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.688583  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1779  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.67 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0686365  normal  0.239123 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4303  transcriptional regulator, RpiR family  36.08 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1044  RpiR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408154  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1122  RpiR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1355  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.906845  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2742  DNA-binding transcriptional regulator HexR  30.77 
 
 		 286 aa  99.4  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2129  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.32 
 
 		 289 aa  99  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3662  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.21 
 
 		 282 aa  99  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4653  RpiR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 280 aa  99  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.562293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3272  RpiR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 289 aa  98.6  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.854433  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1541  transcriptional regulator  24.44 
 
 		 279 aa  99  9e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0652  RpiR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 281 aa  98.2  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  0.0629992 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2083  RpiR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2422  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.42 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0329148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1082  DNA-binding transcriptional regulator HexR  30.47 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000474941  unclonable  0.00000000000467577 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1192  transcriptional regulator, RpiR family  29.06 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.497061  normal  0.760306 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1522  transcriptional regulator, RpiR family  31.25 
 
 		 301 aa  97.1  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0181901  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>